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おてがる理科実験

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本
身近な（家にあるもの）があればできる実験と身近なものの顕微鏡画像の紹介です。小中学生の自由研究の手助けになればと思って書いています。
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さかなとムシの研究所

#DNA

さかなとムシの研究所

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お家で系統樹を作ってみよう！その2

お家で系統樹を作ってみよう！その2

これまでも、noteで分子系統樹は家で作ることができる話を紹介してきました。この動画は、前回に引き続き自宅で系統樹を作る方法を解説しています。

前回の動画では、系統樹を作るのに必要なソフトとその使い方の説明に重点を置いていました。そのため、完成した系統樹の形がすごいめちゃくちゃでした。そこで、今回は系統関係を考察できるような系統樹の作り方を2つほど紹介しています。

1つ目は、あつ森の海底でとれ

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さかなとムシの研究所

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お家で系統樹を作ってみよう！

お家で系統樹を作ってみよう！

系統樹とは、生物の進化の道筋を図で示したものです。皆さんもご存知の通り、地球にいる多様な生物はもとは1種のバクテリア（正確にはアーキア）から始まっています。そのバクテリアが、2種に分かれ、その2種がさらに分かれて、現在に至っています。この枝分かれの様子を図で示すと、樹のようになるので、系統樹と言われています。ちなみに、系統樹の作り方に関しては、以前記事にしています。

今回は、この内容を動画にして

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さかなとムシの研究所

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乳酸菌とDNA

乳酸菌とDNA

最近開設したラボで、お手軽な理科実験をしてみました。ラボなのにお手軽とは如何に？とお思いの方いると思うのですが、レンタルスペースなので薬品の使用は原則禁止です。なので、ラボといっても基本的には顕微鏡による観察やPCを用いた系統解析といったドライラボとして利用となっています。てなわけで、そのレンタルスペースで”薬品”認定されなかったもので、実験してみました。

DNA抽出実験

DNA抽出実験は小学

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さかなとムシの研究所

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家でもできるDNA解析！解説編

家でもできるDNA解析！解説編

これまで紹介した方法で、自宅でも系統樹が作製できます。MEGAを使用した系統樹は国際誌に載っている論文にもあるので、世界レベルの解析を自宅でもできるということです。最後に、「作製する上での注意点」「起こりそうなトラブル」「系統樹の読み取り方」を簡単に紹介します。

作製する上での注意点

これまでの記事で1つ言い忘れていたことになるのですが、「Outgroup(外群)」を必ず用意して下さい。例えば

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さかなとムシの研究所

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家でもできるDNA解析！その1

家でもできるDNA解析！その1

先日、私の教え子の某国立大学の薬学部の学生と飲みに行きました。少し遅めの時間を指定されたので理由を聞いたところ、実習があったとのことでした。ゲノム解析？の実習の1回目とのことで、すぐに済んだらしいのですが、早く済ませられた理由が「先生の授業でやったもん！」とのことでした。決して、私の授業がハイレベルであるわけでも、最先端の設備のある学校にいるわけでもありません。彼が高校の時分にDNA解析を経験でき

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