記事一覧
【研究】RNA-seq:ワークフローについて聞いてみたv20240309.0
こんにちは、あるいは、こんばんは。
今回は(いつもですが)データ処理ではなく、ワークフローについてChatGPT3.5さんから得た情報をメモしておきます。
回答の信憑性については裏取りをしていないため、関連する公式ページや書籍、原著論文などで再確認する必要があります。
ChatGPT 3.5さんからの自己紹介ChatGPT3.5さん について簡単に教えて下さい。
ChatGPT3.5の主な特徴
【研究】RNA-seq:前処理編まとめv20240307.1
こんにちは、あるいは、こんばんは。
RNA-seqの生データをどのように処理してから、データ解析に移れば良いのか悩まれる方も多いと思います。
これまでに試行してきました内容を整理した記事をメモとして残しておきたいと思います。
いつの日か、どこかのだれかの参考にでもなれば幸いです。
PCスペックRosetta 2でターミナル.appを動かします。
設定方法は以前の記事を参考にしていただけますと
【研究】RNA-seq03:カウント編v20240305.0
こんにちは、あるいは、こんばんは。
執筆作業を終え、会議のための資料作成、会議の案内、次の執筆の企画?のようなことをしながら、ターミナルと夜な夜な格闘した成果をご報告します。
投稿した記事の順番が前後しておりますが(記事名でソートして表示させる方法がわからないです)、今回はマッピングしたデータのカウント作業を行いました。
正直、あっているのかどうか既にわからないですが、どこかの誰かの何かの参考に
【研究】RNA-seq04:発現比較解析準備編(RとRStudioの導入)
こんにちは、あるいは、こんばんは。
相変わらずの山積みの雑務をこなしつつ、ようやく発現比較解析に手を付けています。
マッピング後のカウント処理(【研究】RNA-seq03)は、実行できていないため記述できておりません。
カウントデータファイルがありますので、統計ソフト「R」を統合開発環境(IDE)の「RStudio」を用いて解析しています。
PCスペックRとRStudio生命科学の分野に携わると
【ComfyUI-Mac】拡張機能の管理ツール
こんにちは、あるいは、こんばんは。
以前にComfyUIをMacに導入し、画像生成できるように環境設定をしました。
今回は拡張機能をインストールするためのツールを導入してみましたよ。
使いこなすのが難しそうです。。。
ComfyUI-Managerをダウンロードしよう
「ltdrdata」様の「ComfyUI-Manager」をダウンロードします。
GitHubから直接ダウンロードすることもで
【ComfyUI-Mac】ComfyUIをMacに導入してみたよ
こんにちは、あるいは、こんばんは?
米の国からの記事初投稿です。
先日のAiraloのeSImを無事にアクティベートして、ネット環境も良好です♪
10GBの用量を「半額」+「3$割引」にてお安く使用して、1週間程度の滞在では十分過ぎる(ネット検索の頻度は低いです)と実感しております。
さてさて、今回は「Stable Diffusion」のフローが分かる「ComfyUI」なるものをMacに導入して
【研究】RNA-seq02:マッピング編v20240229.0
こんにちは、あるいは、こんばんは。
執筆作業、会議資料作成、会議もろもろ、ようやく一時のオフィス籠もりタイムができましたので、格闘した格闘中の成果をご報告します。
(2024/2/9追記, 2/29追記)
PCスペックApple silicon M1でなんとか動かそうと奮闘しておりましたが、
でした。使用できないツールが多く、なんとか動かそうと努力しましたが、対応していないので無理なようです
【RVC】MacBook Pro 14 (Apple M1)に導入してみたよ<導入だけですみません>
こんにちは。あるいは、こんばんは。
仕事で合成音声を利用して動画を作成したいがために、RVC(Retrieval-based-Voice-Conversion)のWebUIなるものを勉強しました。メモメモ
現在使用中のMacPCは、2台ともクリーンインストールを余儀なくされ、全ての環境がまっさらもちな状態になっています。
ゆくゆくの環境構築も兼ねて、ここで整えておきます。
PC環境構築環境構
【Cloud】クライドデータストレージArtemis(Amaryllo)
こんにちは、あるいは、こんばんは。
クラウドストレージの代表格としてDropboxやGoogle Driveがあります。
いずれもサブスクでお金を払うわけなのですが、マクアケでAmaryllo Cloudのストレージ(Artemis)があったので、ポチりました。
設定方法・・・うっかり記録し忘れていたので、途切れ途切れの記事かもしれませんが、ご想像でご想像で補完していただけますと幸いです。
Am
【MacApp】OnyX
こんにちは。あるいは、こんばんは。
Macのメンテナンスツールの代表格であるOnyXをインストールしました。
目的はいくつかあるのですが、今回は便利な設定ができるからです。
ダウンロード以下のサイトからMacOsに対応するOnyXのインストーラをダウンロードします。
わたしはMacOS Sonoma 14.3でしたので、以下をダウンロードしました。
インストールインストーラー「OnyX.dm
【Mac】macOS Sonomaクリーンインストール再びv20240127.1
こんにちは。あるいは、こんばんは。
12月の忙しい時期にPC関係のトラブルが続発して仕事が絶賛スタックしております!!
夏に購入したばかりの4ベイNASのスロットが2つ認識しなくなり、バックアップがクラッシュして多くのデータを失い、さらに、仕事用のメインMacbook Pro14のストレージが少なくなり、データを外付けHDDに移動してローカル環境から削除してもなかなか容量が増えてくれない謎現象が起