記事一覧
【研究】RNA-seq02：マッピング編v20240229.0
こんにちは、あるいは、こんばんは。
執筆作業、会議資料作成、会議もろもろ、ようやく一時のオフィス籠もりタイムができましたので、格闘した格闘中の成果をご報告します。
（2024/2/9追記, 2/29追記）
PCスペックApple silicon M1でなんとか動かそうと奮闘しておりましたが、
でした。使用できないツールが多く、なんとか動かそうと努力しましたが、対応していないので無理なようです
【研究】RNA-seq03：カウント編v20240305.0
こんにちは、あるいは、こんばんは。
執筆作業を終え、会議のための資料作成、会議の案内、次の執筆の企画？のようなことをしながら、ターミナルと夜な夜な格闘した成果をご報告します。
投稿した記事の順番が前後しておりますが（記事名でソートして表示させる方法がわからないです）、今回はマッピングしたデータのカウント作業を行いました。
正直、あっているのかどうか既にわからないですが、どこかの誰かの何かの参考に
【研究】RNA-seq04：発現比較解析準備編（RとRStudioの導入）
こんにちは、あるいは、こんばんは。
相変わらずの山積みの雑務をこなしつつ、ようやく発現比較解析に手を付けています。
マッピング後のカウント処理（【研究】RNA-seq03）は、実行できていないため記述できておりません。
カウントデータファイルがありますので、統計ソフト「R」を統合開発環境(IDE)の「RStudio」を用いて解析しています。
PCスペックRとRStudio生命科学の分野に携わると
【研究】RNA-seq01.5：納品データ確認編
こんにちは！あるいは、こんばんは？
8月末に案内がありましたRNA-seqキャンペーンに、サンプルを出してみました。
納期は「年内に」とお願いしておりましたところ、きっちり納めてくださいました！！
なかなか解析に手が付けられなかったのですが、息抜き・気分転換も必要なので確認だけでもすることにしました。
※ 関連記事は備忘録ですので、
詳細は 他の記事・市販書籍をご確認いただくことをオススメ
【研究】RNA-seq01：準備編
こんにちは。あるいは、こんばんは。
次世代シーケンサーを用いたRNA-seqなるものを、Stable Diffusionの片手間に勉強してみました。
備忘録ですので詳細は、他の記事・市販書籍をご確認いただくことをおすすめします。。。
環境構築データ解析のための基本となる環境構築は、なかなか検索してもベストなものが判断できないものです。
今回はメインマシンのMacBook Pro(14inch,2