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【DRY解析環境構築】①Dockerのセットアップ
これまではローカルRやPythonを動かしていましたが、次世代シークエンサーDRY解析教本[改訂第２版]（以下 #NGS_DAT ）でDockerが紹介されていたので導入することに。 覚書の…
Raspberry Pi 4B + BME680 + Ambientで実験室環境をモニタリングする
Raspberry Piを買ってみたはいいが、何をするでもなかったので、とりあえず実験室（とデスク）の環境をモニタリングしようと思い立った。
ということで覚書。
モニタリングするもの
・室温
・湿度
・大気圧
ということで、ラズパイマガジン2020年12月号に載っていたセンサーBME680を使うことに。
BME680はガスセンサーでもあるが、今回は使用していない。
配線もラズパイマガジン通り
【QIIME2でメタゲノム解析】⓪Docker上でQIIME2を動かす
前の記事でQIIME2のDockerイメージをpullしている状態で進めます。
ローカルのワーキングディレクトリに移動した後
$ docker run -t -i -v $(pwd):/data qiime2/core:2019.10 --name o2u_qiime2 /bin/bash(qiime2-2019.10) root@XXXXXXXXXXXX:/data#
でQIIME2が使え
【DRY解析環境構築】⑥Ubuntuにリモートデスクトップを設定してMacからGUI操作
基本的にsshで操作したいわけですが、技術的に追いつかなくてどうしてもGUIで操作したい場面が出てくる（エピソード⑤参照）。
そこでリモートデスクトップでMacからGUI操作しようという試み。
参考記事は以下。
基本的にはこの通り進めれば繋がりはするのですが、なぜか画面が切れて表示される。
いろいろググった結果、元がMacBook Proで画面を閉じたまま使用しているため、Ubuntuがモニタを
【DRY解析環境構築】②Jupyter Labのインストール
前回（エピソード⓪）でUbuntuにDockerをインストールし、メインマシンのMacからssh接続で操作できるようになりました。
いよいよ解析用にセットアップしていきます。まずはJupyter Lab。
参考記事はこちら。
Dockerfileを作る。今回はVimで。
$ mkdir ~/Documents/ds_python$ cd ~/Documents/ds_python$ vi Do
【DRY解析環境構築】①Dockerのセットアップ
これまではローカルRやPythonを動かしていましたが、次世代シークエンサーDRY解析教本[改訂第２版]（以下 #NGS_DAT ）でDockerが紹介されていたので導入することに。
覚書のために、インストール手順などを記録します。
１．Docker hubへのサインアップ以前（昨年？）Dockerをインストールした時にはなかった気がする。
とりあえずdocker.comのサイトから必要情報を入力