バイオインフォマティクスまとめ｜Oz

【DRY解析環境構築】⑦Ubuntuにスワップメモリを設定

実際にQIIME2でメタゲノム解析を進めているのですが、系統解析でkillされる事例が発生（Silva…

Oz

4年前

【DRY解析環境構築】⑤Ubuntuに接続したHDDをMacと共有【追記あり】

せっかく常時起動しているUbuntuがあるので、NGS解析データなどはUbuntuに接続した外部HDDに保…

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4年前

【DRY解析環境構築】④QIIME 2のセットアップ

QIIME 2はメタゲノム解析パイプラインです。としたり顔で書いていますが、一昨年メタゲノム…

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4年前

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【DRY解析環境構築】③Rのセットアップ

ここにきて「インストール」とは言わないよな、と気づく。このエピソードからセットアップと…

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4年前

【DRY解析環境構築】②Jupyter Labのインストール

前回（エピソード⓪）でUbuntuにDockerをインストールし、メインマシンのMacからssh接続で操作…

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4年前

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【DRY解析環境構築】⓪使わなくなったMacBook ProにUbuntuをインストールして解析専用…

①でメインマシンにDockerをインストールしたんですが、思った以上にメモリを食うようだったの…

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4年前

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【DRY解析環境構築】①Dockerのセットアップ

これまではローカルRやPythonを動かしていましたが、次世代シークエンサーDRY解析教本[改訂第２版]（以下 #NGS_DAT）でDockerが紹介されていたので導入することに。覚書のために、インストール手順などを記録します。１．Docker hubへのサインアップ以前（昨年？）Dockerをインストールした時にはなかった気がする。とりあえずdocker.comのサイトから必要情報を入力しconfirm。２．DockerのインストールログインしたらDownloa