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VBAメモ 数千ある各列の重複を削除

Rやpython、perlなどをその都度必要に応じて使えるように勉強してきたのですが、VBAは使ったことがありませんでした。大半の人が仕事のどこかでエクセルを使って、表を作成…

Moler
5年前
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解析パイプライン構築のためのSRAの利用

はじめにハイスループットシーケンサーの出力データはFASTQ形式に変換されており、最終的にFASTAファイル形式に変換して取り扱うことが大半かと思います。​ FASTAファイ…

Moler
5年前
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MAFFTをローカルで動かしてみた

普段からガシガシとプログラミング言語にふれあっているというわけではないのですが、簡単な内容を備忘録程度に綴っていきます。 間違っていることや、こっちのほうが効率…

Moler
5年前
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VBAメモ 数千ある各列の重複を削除

Rやpython、perlなどをその都度必要に応じて使えるように勉強してきたのですが、VBAは使ったことがありませんでした。大半の人が仕事のどこかでエクセルを使って、表を作成したり、計算をしたり報告書を書いたりしてるでしょう。なのでVBAなどのマクロが使えると無駄な繰り返し作業や入力・計算ミスなどが減らせて、作業効率の向上が期待できるので習得したいなと思っています。

そして単純反復作業が増えてき

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解析パイプライン構築のためのSRAの利用

はじめにハイスループットシーケンサーの出力データはFASTQ形式に変換されており、最終的にFASTAファイル形式に変換して取り扱うことが大半かと思います。​

FASTAファイルは1行目に” > ”から始まる配列の情報。2行目からは塩基配列のフォーマットになっています。

>KY471393.1_Xenotoca variata
TAAAAGCTTGGTCCTGACTTTTCTATCAGCTCTA

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MAFFTをローカルで動かしてみた

普段からガシガシとプログラミング言語にふれあっているというわけではないのですが、簡単な内容を備忘録程度に綴っていきます。

間違っていることや、こっちのほうが効率的だよ。などあると思いますので気軽にご指導いただければと思います。

MitoFishからミトコンドリアのcomplete genomeをダウンロードしてきてMAFFTのオンラインバージョンでアライメントしようとしたらデータ量が多すぎなの

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