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2023年11月の記事一覧
書記のBio/Chem-Info日誌#20 深層学習を用いた分子記述子による薬理活性の推定(PyTorchによる実装)
今回は深層学習を用いた分子記述子による薬理活性の推定を,PyTorchによる実装で示していく。
問題「CHEMBL203」に含まれる化合物について,EGFR kinaseに対する阻害活性の有無を,pIC50により評価したい。化合物を示すデータとしては,分子記述子を使用する。
データの前提条件データはKNIMEのTeachOpenCADDにある「W2_filtered_compounds.csv