【文献Abstract】新型コロナウイルス感染のPCR検査をいつ行ったらよいか？

〈要点〉

新型コロナウイルスのPCR検査の感度や特異度は十分に特定されておらず、偽陰性となる可能性が最も高い期間はよくわかっていない。今回、米国ジョンズ・ホプキンズ大学のLauren M. Kucirka氏らが7つの研究のプール解析を行ったところ、偽陰性率は、発症後3日目（感染後8日目）に最も低くなることがわかった。著者らは、偽陰性の可能性を最小限にするために、検査は発症から3日間待って実施すべきとしている。また、臨床的にCOVID-19が疑われる場合は、PCR陰性のみで除外診断すべきではなく、臨床的および疫学的状況を慎重に検討する必要があると述べている。Annals of Internal Medicine誌オンライン版2020年5月13日号に掲載。

本研究は、鼻咽頭または咽頭スワブを用いたPCR検査のデータを有する7つの研究のプール解析（入院または外来患者計1,330例）で、感染（曝露）後もしくは発症（症状発現）後の偽陰性率について、階層ベイズモデリングを用いて算出した。

主な結果は以下のとおり。

・偽陰性率は感染1日目が100％（95％CI：100～100％）であり、4日目が67%（95％CI：27～94%）と5日目（COVID-19の典型的な発症日）まで減少した。

・発症日（感染5日目）の偽陰性率は38％（95%CI：18〜65％）であった。

・感染8日目（発症から3日目）の偽陰性率は20％（95%CI：12～30％）と最低となり、その後、9日目（21％、95%CI：13～31％）から再び増加し、21日目に66％（95％CI：54〜77％）となった。

なお、本研究の限界として、プール解析した基の研究のデザインの不均一性により、推定が不正確であることを挙げている。

（今回は文献を読んだ後、上記のサイト情報をみつけたのでそのままコピペしました）

引用元 : CareNet 新型コロナPCR検査、偽陰性が多い期間は？

〈雑感〉

・ここ最近、ちょっとした発熱でも発熱外来を受診しPCR検査を希望する方が多い印象だが、発熱後数時間でPCR検査をしても正確性がどうなんだろう？と思って今回は文献を読んでみた。
・一般的に発症後数日は風邪と見分けがつかないと言われているが、早くPCR検査をしたからと言ってやはり新型コロナの有無について診断がつくわけではないのだと改めて実感。
・この文献を根拠に、症状の軽い方であったら基本3日間は自宅待機にしてもらい、その後も症状が続いていた場合などにPCR検査をするとよいかもと思った。
・検査を受ける側も他の人にうつしてしまわないように、検査をする側も負担が重くなって医療提供が中断されないように、お互いが思いやりをもって世の中を守っていくしかないんだな、やっぱり。

〈文献〉

Ann Intern Med. 2020 Aug 18;173(4):262-267. doi: 10.7326/M20-1495. Epub 2020 May 13.
Variation in False-Negative Rate of Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction-Based SARS-CoV-2 Tests by Time Since Exposure
Lauren M Kucirka , Stephen A Lauer , Oliver Laeyendecker , Denali Boon , Justin Lessler 

Abstract
Background: Tests for severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) based on reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) are being used to rule out infection among high-risk persons, such as exposed inpatients and health care workers. It is critical to understand how the predictive value of the test varies with time from exposure and symptom onset to avoid being falsely reassured by negative test results.

Objective: To estimate the false-negative rate by day since infection.

Design: Literature review and pooled analysis.

Setting: 7 previously published studies providing data on RT-PCR performance by time since symptom onset or SARS-CoV-2 exposure using samples from the upper respiratory tract (n = 1330).

Patients: A mix of inpatients and outpatients with SARS-CoV-2 infection.

Measurements: A Bayesian hierarchical model was fitted to estimate the false-negative rate by day since exposure and symptom onset.

Results: Over the 4 days of infection before the typical time of symptom onset (day 5), the probability of a false-negative result in an infected person decreases from 100% (95% CI, 100% to 100%) on day 1 to 67% (CI, 27% to 94%) on day 4. On the day of symptom onset, the median false-negative rate was 38% (CI, 18% to 65%). This decreased to 20% (CI, 12% to 30%) on day 8 (3 days after symptom onset) then began to increase again, from 21% (CI, 13% to 31%) on day 9 to 66% (CI, 54% to 77%) on day 21.

Limitation: Imprecise estimates due to heterogeneity in the design of studies on which results were based.

Conclusion: Care must be taken in interpreting RT-PCR tests for SARS-CoV-2 infection-particularly early in the course of infection-when using these results as a basis for removing precautions intended to prevent onward transmission. If clinical suspicion is high, infection should not be ruled out on the basis of RT-PCR alone, and the clinical and epidemiologic situation should be carefully considered.

Primary funding source: National Institute of Allergy and Infectious Diseases, Johns Hopkins Health System, and U.S. Centers for Disease Control and Prevention.