[メモ] 鳥関連のデータセットあれこれ
お世話になってる or 最近知った、ウェブサイトと論文のメモ。こういうデータセットやデータベースを作った方々、本当にすごい。
図鑑的なもの
データソースは同じ場合も多いのかもしれない、よくわかってない
系統樹
・birdtree
解析用の系統樹データをダウンロードできるサイト。
・系統樹ビューアー
birdtree.orgにリンクがあって知った。通常の系統樹表示だと種数が多すぎて全体像が掴みにくかったので、助かった。アニメーションバージョンもあって楽しい。
形態
・翼の形状指標（論文）
鳥類全種のHWI（hand-wing index）リストがダウンロードできる。生態情報も含まれてた。
Sheard, C., Neate-Clegg, M.H.C., Alioravainen, N. et al. (2020)
Ecological drivers of global gradients in avian dispersal inferred from wing morphology.
Nat Commun 11, 2463
・MorphoSource
脊椎動物の2D, 3D形態データベース？CTスキャンデータなどもあるみたい。
生態
※ BirdLife Internationalから情報を集めている場合も多い
・AnAge
動物の寿命データベースらしい。最長寿個体の記録ってことなんだろうか。
・繁殖期の長さ（論文）
3096種の抱卵期間、育雛期間、などをまとめたリストをダウンロードできる。
Cooney, C.R., Sheard, C., Clark, A.D. et al. (2020)
Ecology and allometry predict the evolution of avian developmental durations.
Nat Commun 11, 2383
・採餌生態（論文）
鳥類、哺乳類の採餌行動や餌の情報をまとめたデータペーパーみたい。Ecologyにもずいぶん前からデータペーパーがあったんだなぁ。
Wilman et al. (2014)
EltonTraits 1.0: Species‐level foraging attributes of the world's birds and mammals
Ecology 95, 7, 2027-2027
https://esajournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1890/13-1917.1
・生活史（論文）
羊膜類（鳥類、哺乳類、爬虫類）の生活史情報をまとめたデータペーパーらしい。
Myhrvold et al. (2015)
An amniote life-history database to perform comparative analyses with birds, mammals, and reptiles
Ecology 96 (11), 3109-3109
https://esajournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1890/15-0846R.1
・渡り距離（論文）
- バイオロギングデータから推定した196種の渡り距離をダウンロードできる。
Y. Y. Watanabe (2016) Flight mode affects allometry of migration range in birds
Ecology Letters 19(8), 907-914
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/ele.12627
- BirdLife Internationalの情報をまとめた1466種の渡り距離をダウンロードできる。こちらには海鳥が含まれていないっぽい。
O. Vincze (2016) Light enough to travel or wise enough to stay? Brain size evolution and migratory behavior in birds
Evolution 70(9), 2123-2133
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