Recent medRxiv: October 02, 2024
Hydroxyzine in Acute Hypertension: A Cohort Study.
1. 与えられた論文は、何を目的としていますか?:
この研究は、病院への入院のアウトカムを予測するための分類および回帰ツリー(CART)モデルを提示することを目的としています。このモデルは、患者が病院に入院するかどうか(「はい」または「いいえ」)を、さまざまな医療および人口統計的変数に基づいて分類します。
2. 与えられた論文では、どのようなデータや情報を用いましたか?:
この研究では、身体的改善、脈拍数、年齢、救急医療サービス(EMS)への呼び出し理由、改善状況などの変数を用いています。また、10分割交差検証を行うためにデータセットを10部分に分け、各トレーニングセットにおいてCARTツリーを構築しました。
3. 与えられた論文の新規性や、解決できた問題は何ですか?:
この研究の新規性は、CARTモデルを用いて、患者の入院アウトカムを予測する構造化されたアプローチを提供することです。これにより、トリアージや患者管理プロトコルの改善に役立つ可能性があります。また、特定の変数が入院の予測にどのように影響を与えるかを明確に示すことで、入院率の高い患者群や低い患者群の特定が可能になりました。
4. 将来取り組むべき未解決問題として、何が残されていますか?:
今後の課題として、他の医療変数や社会経済的要因をモデルに統合することで、予測の精度をさらに向上させることが挙げられます。また、異なる地域や人口統計でのモデルの有効性を検証し、より広範な適用性を確認する必要があります。さらに、モデルの解釈可能性を高めるための研究も重要です。
title:
Hydroxyzine in Acute Hypertension: A Cohort Study.
creator:
Nozewski, J., Remiszewski, P., Filipek, K., Pisklak, A., Abramczyk, A., Pyzel, S., Sliz, D.
date:
2024-10-02
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314673v1
Outcomes of endoscopic ultrasound-guided transmural drainage for postoperative peripancreatic fluid collection with an external drainage-first approach
1. 与えられた論文の目的:
この研究は、手術後の膵液漏れに対する治療法として、内視鏡超音波(EUS)による経皮的ドレナージ(EUS-TD)の有効性と安全性を評価することを目的としています。特に、この手法を用いた患者の治療結果や、術後の合併症の発生率を検証しています。
2. 使用されたデータや情報:
この研究では、昭和大学藤が丘病院でEUS-TDを受けた17人の患者の後ろ向きコホートを分析しています。患者の特性、手術の種類、および膵液漏れの発生率などのデータが収集されました。また、患者の匿名データが使用され、倫理的な承認のもとで情報が取り扱われています。
3. 新規性や解決された問題:
この研究の新規性は、EUS-TDを用いた膵液漏れの管理に関する具体的なデータを提供する点にあります。多くの患者で手術後の膵液漏れが確認された場合の治療選択肢として、EUS-TDが有効であることを示しています。さらに、EUS-TD後の患者の追跡データから、手術後の合併症の低減や患者の回復期間の短縮が示されています。
4. 未解決の問題:
今後の課題としては、EUS-TDの長期的な効果や安全性に関するさらなる研究が必要です。また、異なる種類の膵手術におけるEUS-TDの有効性を比較する研究や、より広範な患者群に対する臨床試験が求められています。これにより、EUS-TDを標準的な治療法として確立するためのエビデンスが強化されることが期待されます。
title:
Outcomes of endoscopic ultrasound-guided transmural drainage for postoperative peripancreatic fluid collection with an external drainage-first approach
creator:
Noda, J., Takano, Y., Tamai, N., Yamawaki, M., Azami, T., Niiya, F., Nishimoto, F., Nagahama, M.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314576v1
Longitudinal co-development of mental and cardio-metabolic health from childhood to young adulthood
1. 与えられた論文の目的:
この研究の主な目的は、抑うつ症状と脂肪量指数(FMI)の共進化を分析し、時間を追ってこれらの変数がどのように相互に影響し合うかを理解することです。特に、個人内の自己回帰的関連性とクロスラグダイナミクスを詳細に分析し、抑うつ症状とFMIの相互作用を明らかにすることが目的です。
2. 使用されたデータや情報:
この研究では、7970人の参加者を含む大規模なデータセットを使用しています。参加者は少なくとも一度は抑うつ症状とFMIの測定を受けています。データ分析には、自己回帰項とクロスラグ項を含む構造方程式モデリングが用いられており、これにより個人の時間にわたる変動とその相互作用が評価されています。
3. 論文の新規性や解決できた問題:
この研究の新規性は、抑うつ症状とFMIの間の動的な関連性を長期間にわたって追跡し、その相互作用を詳細に分析する点にあります。特に、個人内のクロスラグダイナミクスを明らかにし、これまでの研究ではあまり注目されてこなかった抑うつ症状と体脂肪との間の時間依存的な相互作用を解明しました。研究では、FMIの増加が後続の抑うつ症状の増加に関連していること、またその逆も示されています。
4. 未解決の問題:
将来的には、抑うつ症状とFMIの関連において、他の潜在的な影響要因や調節因子を同定し、これらの因子がどのように相互作用に影響を与えるかをさらに詳しく調査する必要があります。また、異なる人口統計学的特性を持つサブグループ間での関連性の違いを検討し、よりカスタマイズされた予防策や介入策を開発するための基盤を築くことも重要です。
title:
Longitudinal co-development of mental and cardio-metabolic health from childhood to young adulthood
creator:
Defina, S., Cecil, C. A. M., Felix, J., Walton, E., Tiemeier, H.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.10.01.24314697v1
Maintaining community-based cohorts in sub-Saharan Africa: An evaluation of participant attrition in SchistoTrack
1. 与えられた論文の目的:
この研究は、ウガンダの農村地域におけるシストソーム症とマラリアの共感染や長期的な健康状態に関連する因子を調査することを目的としています。特に、研究参加者のフォローアップと継続的な参加を確保するための調査の途中での離脱率(アトリション)やその要因を分析し、効果的なコミュニティエンゲージメントや治療の提供方法を模索しています。
2. 使用されたデータや情報:
この研究では、社会人口統計学的変数(年齢、性別、部族、宗教、教育、職業など)、生物医学的変数(症状の有無、感染症の歴史など)、空間的変数(家庭の位置情報、周辺の薬局や保健センターの位置情報など)を含む広範なデータが収集されました。これらのデータは、地元調査員によって、現地の言語と英語で行われた家庭調査を通じて収集されました。
3. 新規性や解決された問題:
この研究の新規性は、特にシストソーム症とマラリアの共感染状況とそれに伴う健康影響を長期にわたって追跡調査する点にあります。また、地域社会の参加と支援を得るための方法を評価し、研究の離脱率を低減する戦略を提案しています。これにより、地域社会に根ざした研究の持続可能性と効果が向上しました。
4. 未解決の問題:
研究の離脱率をさらに低減するための具体的な方法や、特定の社会経済的、地域的要因が離脱にどのように影響するかの更なる分析が必要です。また、新たに参加する家庭や個人をどのように効果的に組み込むか、研究の規模を拡大する際の課題に対処する必要があります。さらに、治療の効果を時間を追って評価し続けることで、より効果的な介入方法を開発することも求められています。
title:
Maintaining community-based cohorts in sub-Saharan Africa: An evaluation of participant attrition in SchistoTrack
creator:
Puthur, C., Nabatte, B., Tinkitina, B., Kabatereine, N. B., Chami, G. F.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.10.01.24314711v1
Subphenotypes of youth-onset type 2 diabetes mellitus and their association with distal symmetrical polyneuropathy
1. 目的:
この研究の主な目的は、若年発症型2型糖尿病(T2DM)の新たに診断された患者におけるデータ駆動型のサブフェノタイプを特定し、診断時の遠位対称性ポリニューロパシー(DSPN)との関連を研究することです。
2. 使用されたデータや情報:
この研究では、SEARCH for Diabetes in Youth StudyとTreatment Options for Type 2 Diabetes in Adolescents and Youth(TODAY)研究からの641人の10歳から19歳の新たに診断されたT2DM患者が参加しました。データには、体重指数(BMI)、HbA1c、空腹時C-ペプチド、収縮期血圧、拡張期血圧、LDLコレステロール、HDLコレステロールが含まれています。
3. 新規性や解決できた問題:
この研究は、若年発症型2型糖尿病の患者において、臨床的な表現や合併症のリスクに大きな異質性が存在することを明らかにしました。特に、軽度肥満関連糖尿病(yMOD)、重度インスリン不足糖尿病(ySIDD)、重度インスリン抵抗性糖尿病(ySIRD)という3つのサブフェノタイプを同定し、これらのサブフェノタイプがDSPNの発症率にどのように関連しているかを評価しました。
4. 未解決の問題:
将来的には、これらのサブフェノタイプに基づいて個別化された治療戦略を開発し、実装する必要があります。また、異なるサブフェノタイプがなぜ異なる臨床的表現や合併症のリスクを持つのか、その機序をさらに解明する必要があります。
title:
Subphenotypes of youth-onset type 2 diabetes mellitus and their association with distal symmetrical polyneuropathy
creator:
Guo, J., Li, Z., Carrillo Larco, R. M., Hsia, D., Harding, J., Ali, M. K., Varghese, J. S.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.10.01.24314707v1
A Prototype Machine Learning Pipeline for Assessing and Tracking Keloid Scars
1. 与えられた論文の目的:
この研究の主な目的は、EfficientNet B7アーキテクチャを使用したケロイド分類モデルのパフォーマンス分析を行うことです。ケロイド、正常な皮膚、その他の病変といった異なるクラスに対するモデルの精度、リコール、F1スコアなどのパフォーマンスメトリクスを評価し、モデルの予測と実際のラベルを視覚化するための混同行列を提供します。
2. 使用されたデータや情報:
この研究では、ケロイドの瘢痕を持つ患者の入力画像を使用し、これらの画像にはケロイドのスケールと正確な測定を提供するための基準マーカー(緑または黄色の円)が隣接して配置されています。また、ケロイドの寸法は自動セグメンテーションアルゴリズムを用いて特定され、関心領域は青でアウトラインが引かれています。さらに、セグメンテーションプロセスから生成されたバイナリマスクを使用して、ケロイドの大きさや形状を定量的に分析しています。
3. 新規性や解決された問題:
この研究の新規性は、EfficientNet B7アーキテクチャを用いてケロイドの分類を行う点にあります。凍結層と非凍結層を持つモデルのトレーニングとバリデーションの精度を比較し、異なるクラスに対するモデルのパフォーマンスを詳細に分析しました。また、混同行列を用いてモデルの予測精度と実際のラベルとの比較を視覚的に示し、正確な分類と誤分類を明確にしました。
4. 未解決の問題:
未解決の問題としては、セグメンテーションアルゴリズムが濃い肌色の患者におけるケロイド瘢痕の認識に限界があることが挙げられます。今後の研究では、肌の色によるバイアスを減らすための改善が必要です。また、異なる体の部位や異なる種類の瘢痕に対するアルゴリズムの適用性や精度をさらに向上させることも、今後の課題として考えられます。
title:
A Prototype Machine Learning Pipeline for Assessing and Tracking Keloid Scars
creator:
Abdolahnejad, M., Zandi, A., Wong, J., Chan, H. O., Lin, V., Jeong, H., Joshi, R., Wong, J. N., Hong, C.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314501v1
A novel patient-level computational model of atrial fibrillation patterns and clinical outcomes for evaluating screening strategies
1. 目的:
この論文の目的は、心房細動(AF)の発症、持続化、およびそれに伴う合併症の発生リスクを時間の経過とともにモデル化することです。具体的には、AFの進行、心房細動から持続性心房細動への進行、脳卒中や死亡の発生を時系列的に評価し、これらのイベントの発生確率を調整するためのモデルを提供しています。
2. 使用データ:
論文では、患者のAFエピソードやその進行、さらには脳卒中の発生を追跡するために、100年間のフォローアップデータを使用しています。また、LOOP試験からの植込み型ループレコーダーを持つ患者のデータや、自己定義の系統的AFスクリーニング、症状に基づく長期または短期のAFスクリーニングに関するデータも利用されています。
3. 新規性と解決した問題:
この研究の新規性は、AFの発症と進行、および重大な健康イベントの発生を長期にわたってモデル化し、それによって個々の患者のリスク評価や治療計画の精度を高める点にあります。特に、時間の経過とともに変化するAFのリスク要因を組み込んだ点や、様々なスクリーニング方法の比較を行った点が挙げられます。
4. 未解決問題:
未解決の問題としては、AFのリスク要因や発症メカニズムをさらに詳細に解明すること、さらに進んだ予防策や治療法の開発、そして異なる人口統計学的特性を持つ患者群に対するモデルの適用性と精度の向上が挙げられます。これらの問題に対処することで、より効果的な予防と治療戦略が可能となるでしょう。
title:
A novel patient-level computational model of atrial fibrillation patterns and clinical outcomes for evaluating screening strategies
creator:
Cai, M., Barrios Espinosa, C., Rienstra, M., Crijns, H. J. G. M., Schotten, U., Heijman, J.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314669v1
Multiomics identifies unique modulators of calf muscle pathophysiology in peripheral artery disease and chronic kidney disease
1. 与えられた論文の目的:
この研究は、PAD(末梢動脈疾患)およびCKD(慢性腎臓病)を持つ患者の筋肉組織におけるミトコンドリア機能の障害と、細胞間コミュニケーションの変化を解明することを目的としています。特に、ミトコンドリアの機能不全とそれが筋肉の健康、回復能力にどのように影響するかを詳細に調べることが目標です。
2. 使用されたデータや情報:
この研究では、患者の筋肉組織から取得したミトコンドリアの酸素消費率、エネルギー要求、シトラートシンターゼ活性などの生化学的パラメーターを測定しました。また、遺伝子発現の変化を追跡し、炎症、線維化、脂肪生成遺伝子の発現レベルを分析しました。さらに、CellChatを用いて細胞間コミュニケーションの変化を予測し、FGFシグナリングを含む重要なリガンド-受容体ペアのコミュニケーションを評価しました。
3. 新規性や解決できた問題:
この研究の新規性は、PADとCKDが筋肉組織のミトコンドリア機能に与える影響を包括的に評価し、特にミトコンドリアの機能不全が筋肉の回復能力にどのように影響するかを明らかにした点にあります。また、細胞間コミュニケーションの変化を詳細に分析することで、疾患の進行における細胞レベルでの相互作用の理解を深めることができました。
4. 未解決問題:
今後の課題としては、ミトコンドリア機能不全を改善するための治療戦略の開発が挙げられます。また、細胞間コミュニケーションの変化を具体的にコントロールする方法を見つけ出し、筋肉組織の健康を維持、向上させる新たなアプローチの開発も求められます。さらに、他の疾患や異なる患者集団におけるミトコンドリア機能と細胞間コミュニケーションの関連性についての研究も必要です。
title:
Multiomics identifies unique modulators of calf muscle pathophysiology in peripheral artery disease and chronic kidney disease
creator:
Kim, K., Thome, T., Pass, C. G., Stone, L., Vugman, N., Palzkill, V., Yang, Q., O'Malley, K., Anderson, E. M., Fazzone, B., Yue, F., Berceli, S. A., Scali, S. T., Ryan, T. E.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314668v1
Physical Activity, Sleep, and Quality of Life in Pulmonary Arterial Hypertension: Novel Insights from Wearable Devices
1. 与えられた論文の目的:
この研究は、心不全患者の生活習慣、特に身体活動、座位時間、睡眠の質と、生活の質(QOL)との関連を調査することを目的としています。また、長期的な健康状態の変化を追跡し、これらの要因が時間とともにどのように変化するかを観察することも目的の一つです。
2. 使用されたデータや情報:
この研究では、心不全患者109人を対象に、12週間のベースラインモニタリングと1年後のフォローアップデータを収集しました。具体的には、日々の歩数、座位時間、軽度活動、中程度活動、高強度活動、睡眠の各段階(軽睡とREM睡眠の割合)を計測しました。また、生活の質を評価するために、MLHF(Minnesota Living with Heart Failure)スコアを用いて、全体的なスコア、身体的スコア、感情的スコアを測定しました。
3. 論文の新規性や解決した問題:
この研究の新規性は、心不全患者における生活習慣の継続的なモニタリングとそのQOLとの関連を長期間にわたって評価した点にあります。特に、身体活動の減少がQOLの低下と関連していることを明らかにし、これまでの研究であまり注目されていなかった睡眠の質との関連も考慮に入れた点が挙げられます。これにより、心不全患者の管理において、身体活動だけでなく、睡眠の質にも注意を払うべきであるという重要な示唆が得られました。
4. 未解決の問題:
この研究では、感情的QOLとの関連が低いという結果が出ており、身体的な要因だけでなく心理的、社会的要因も含めたさらなる研究が必要です。また、より多様な背景を持つ患者群を対象にした研究が求められます。さらに、介入研究を行い、具体的な生活習慣の改善が心不全患者のQOLにどのように影響するかを明らかにすることも今後の課題です。
title:
Physical Activity, Sleep, and Quality of Life in Pulmonary Arterial Hypertension: Novel Insights from Wearable Devices
creator:
Hughes, A. M., Lindsey, A., Annis, J., Burke, K., Master, H., Silverman-Lloyd, L. G., Garry, J. D., Blaha, M. J., Rosenzweig, E. B., Frantz, R. P., Hassoun, P., Horn, E. M., Leopold, J. A., Rischard, F., Larive, B., Hill, N. S., Erzurum, S., Beck, G., Hemnes, A. R., Brittain, E.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314671v1
Solid-state esophageal pressure sensor for the estimation of pleural pressure: a bench and first-in-human validation study
1. 与えられた論文の目的:
この研究の主な目的は、新しい固体状態の食道圧トランスデューサー(Pessolid)の精度を評価することです。食道圧(Pes)を測定することで、機械的換気を受けているICU患者の管理を支援することができます。従来の食道バルーンカテーテルによるPes測定は複雑な校正が必要であり、多くの要因がその信頼性に影響を与えるため、固体状態の圧力センサーがこれらの制限を克服できる可能性があります。
2. 使用されたデータや情報:
この研究では、ベンチテスト設定での絶対的および相対的な固体状態センサーPes測定を参照圧力と比較し、15名の自発呼吸が可能な健康なボランティアと16名の機械換気を受けているICU患者において、同時に配置されたバルーンカテーテルと比較しました。データ分析にはBland-Altman分析が用いられ、非パラメトリックブートストラッピングでバイアスと同意の上限および下限を推定しました。
3. 論文の新規性や解決できた問題:
この研究の新規性は、固体状態の食道圧トランスデューサーが、従来の食道バルーンカテーテルと同等またはそれ以上の精度でPesを測定できることを示した点にあります。固体状態のセンサーは複雑な校正が不要で、より信頼性が高い可能性があります。ベンチテスト、健康なボランティア、および機械換気を受けているICU患者において良好な精度が示されたことは、Pesを高度な呼吸モニタリング技術として実装するための重要なステップです。
4. 将来取り組むべき未解決問題:
固体状態の食道圧トランスデューサーの長期的な使用における耐久性や信頼性をさらに評価する必要があります。また、さまざまな臨床状況下でのトランスデューサーの性能を評価する追加的な研究が必要です。さらに、固体状態のセンサーのコスト効率や、広範な臨床設定での実用性に関する研究も重要です。
title:
Solid-state esophageal pressure sensor for the estimation of pleural pressure: a bench and first-in-human validation study
creator:
van Oosten, J. P., Goedendorp, N., Mousa, A., Flink, R., Schaart, R., Flinsenberg, M., Somhorst, P., Gommers, D. A. M. P. J., Heunks, L., Jonkman, A. H.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.10.01.24314687v1
Derivation and validation of a prediction rule for sedative-associated delirium during acute respiratory failure requiring mechanical ventilation
1. 与えられた論文の目的:
この研究の主な目的は、侵襲的な機械換気中に鎮静剤関連せん妄のリスクを定量化するシンプルで透明性のある予測ツールを開発し、検証することです。特に新たに挿管された患者に焦点を当てており、臨床医が鎮静に関してリスクと利益のトレードオフを考慮する際に役立つ情報を提供することを目指しています。
2. 使用されたデータや情報:
このモデルの導出と内部検証には、BRAIN-ICU(集中治療室での脳機能障害のリスク因子と発生率を明らかにする研究)とMIND-ICU(集中治療室を生き延びた退役軍人のせん妄と認知症研究)のデータが使用されました。これらは、同じ包括/除外基準を持つ並行多施設前向きコホート研究です。研究では、急性呼吸不全や敗血症性または心原性ショックの成人患者が登録され、完全な薬剤管理データおよび訓練された研究員による日々のせん妄評価が収集されました。
3. 新規性や解決できた問題:
この研究の新規性は、鎮静剤関連せん妄のリスクを予測するための具体的なツールを提供することにあります。これまでの研究では、せん妄の長期間の持続やより高用量の鎮静剤および鎮痛剤が認知機能障害の重症度と独立して関連しているという仮説を検証してきましたが、このツールは臨床医が機械換気患者の初期管理において、具体的なリスク評価を行うための実用的な方法を提供します。
4. 未解決の問題:
この研究では内部検証を行いましたが、外部検証はまだ完了していません。外部検証を通じてツールの一般化能力をさらに評価する必要があります。また、異なる地域や医療設定での有効性を確認するための追加研究も必要です。さらに、このツールを使った介入が患者の成績にどのように影響を与えるかを評価するための臨床試験も考慮されるべきです。
title:
Derivation and validation of a prediction rule for sedative-associated delirium during acute respiratory failure requiring mechanical ventilation
creator:
Prendergast, N. T., Onyemekwu, C. A., Potter, K. M., Franz, C. A., Kitsios, G. D., McVerry, B. J., Pandharipande, P. P., Ely, E. W., Girard, T. D.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314628v1
Development, Testing, and Calibration of LINCS: A New Microsimulation Model of Maternal and Fetal Cytomegalovirus Infection
1. 与えられた論文の目的:
この論文では、シミュレーションモデルの動作を確認するためのユニットテストと機能テストを適用し、モデルが指定された仕様に従って正確に動作することを保証することを目的としています。具体的には、コードが予期しないエラーや論理的な間違いを含まないように個々の機能やコードの部分をテストし、さらに複数の機能を組み合わせたシステム全体の動作を評価することを目指しています。
2. 使用されたデータや情報:
モデルの入力値として、妊娠中の母体のCMV感染の確率、垂直伝播の確率、検査の感度や特異性などが使用されています。また、ユニットテストでは、これらの入力値に基づいて特定の条件下でのエラー応答を設定し、機能テストでは、シナリオに応じたシステムの全体的な挙動を評価するために、これらの入力値がどのように相互作用するかを検証しています。
3. 論文の新規性および解決された問題:
この研究の新規性は、複雑で非線形なシミュレーションモデルに対して、ソフトウェアエンジニアリングから導入されたユニットテストと機能テストの手法を適用し、モデルの予測が実際のシナリオと一致するかを確認する点にあります。特に、CMV感染の垂直伝播の条件を設定することで、モデルが不合理な挙動を示すことなく、より現実的な出力を提供するように改善されました。
4. 未解決の問題:
将来的には、モデルがさらに複雑なシナリオや異なる人口統計学的条件を考慮した場合の動作を検証する必要があります。また、モデルの感度分析を行い、どのパラメータが結果に最も大きな影響を与えるかを明らかにすること、そしてそのパラメータの最適な値を見つけることも重要な課題です。さらに、モデルの予測精度を向上させるために、より多くの実世界データを統合し、モデルの検証を継続的に行うことが求められます。
title:
Development, Testing, and Calibration of LINCS: A New Microsimulation Model of Maternal and Fetal Cytomegalovirus Infection
creator:
Wu, A. S., Coskun, E., Prabhu, M., Santos, E. M., Kakkar, F., Flanagan, C. F., Dugdale, C. M., Pesch, M., Giardina, J. C., Ciaranello, A. L.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314653v1
Biomedical Text Normalization through Generative Modeling
1. 与えられた論文の目的:
与えられた論文では、異なる次元とモデルサイズを持つ複数の埋め込みモデルの中から、SNOMED CTコードに対する同義語のマッチング精度を評価し、最適なモデルを選択することを目的としています。また、Retrieval-Augmented Generation (RAG) 方法を最適化し、言語モデルへの適切な情報量を提供するための適切な用語の数を決定することも目的としています。
2. 使用されたデータや情報:
この研究では、異なる次元数を持つ複数のテキスト埋め込みモデルを評価しました。具体的には、'text-embedding-ada-002', 'all-MiniLM-L6-v2', 'bge-large-en-v1.5', 'ember-v1', 'GIST-large-Embedding-v0', 'sf_model_e5', 'SFR-Embedding-Mistral' といったモデルが使用されています。また、SNOMED CTコードと医療用語のデータセットを用いて、TF-IDFベースの文字列マッチングとゼロショットリコール法を使用しています。
3. 新規性や解決された問題:
この研究の新規性は、異なる次元数を持つ複数の埋め込みモデルの中から、SNOMED CTコードに最も効果的なマッチング精度を提供するモデルを特定した点にあります。また、RAG方法を用いて、言語モデルに適切な情報量を提供するための最適な用語の数を決定する新たなアプローチを提案しました。これにより、過剰な情報や不足情報による問題を避けることができます。
4. 未解決の問題:
今後の課題としては、さらに多様なデータセットや実世界のシナリオでのモデルの評価が必要です。また、異なる言語や専門領域における適用性の検証も重要です。さらに、RAG方法のさらなる最適化や、他の機械学習技術との組み合わせによる効果の検証も求められます。
title:
Biomedical Text Normalization through Generative Modeling
creator:
Berkowitz, J. S., Fatapour, Y., Miguel Acitores Cortina, J., Srinivasan, A., Tatonetti, N. P.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314663v1
Genetic Association of Glutathione S-Transferase Omega 2 (GSTO2) Gene Variant (rs156697) with Chronic Kidney Disease Patients of Pakistani Origin
1. 与えられた論文の目的:
この研究は、パンジャブ地域の人々におけるGSTO2遺伝子の変異(rs156697)と慢性腎臓病(CKD)との遺伝的関連性を調査することを目的としています。特に、この地域のCKDの有病率を分析し、遺伝的要因がどのようにしてCKDのリスクに影響を与えるかを明らかにすることを目指しています。
2. 用いられたデータや情報:
この研究では、パンジャブ地域の9つの地区からの個体を対象に、総数50サンプルを分析しています。具体的には、ARMS-PCR遺伝子型判定法を用いて、GSTO2遺伝子のc.424A>Tの位置における変異の有無を調べ、その結果をPLINKデータツールセットを使用してハーディー・ワインバーグ平衡(HWE)やカイ二乗関連性分析により評価しました。さらに、被験者の年齢、性別、健康履歴などの記述統計も行っています。
3. 新規性や解決できた問題:
この研究の新規性は、パンジャブ地域におけるGSTO2遺伝子の特定の変異とCKDとの関連を明らかにした点にあります。しかし、統計的に有意な関連は見られなかったため、GSTO2遺伝子変異がCKDのリスクを直接的に高める証拠は得られませんでした。これにより、地域特有の遺伝的背景がCKDの発症にどのように影響しているかの理解が深まりました。
4. 未解決問題:
今後の研究では、より多くの遺伝的マーカーや大規模なサンプルデータを用いた機能的研究が必要です。この研究では統計的に有意な結果が得られなかったため、他の遺伝子や環境要因との相互作用も含めたさらなる分析が求められます。また、CKDの進行や治療法の開発に向けた遺伝的要因の特定も重要な課題となっています。
title:
Genetic Association of Glutathione S-Transferase Omega 2 (GSTO2) Gene Variant (rs156697) with Chronic Kidney Disease Patients of Pakistani Origin
creator:
Afzal, A., Saif, R., Atta, A., Jafri, S. A., Naqvi, S. K. A.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.10.01.24313369v1
FBXO22 deficiency defines a pleiotropic syndrome of growth restriction and multi-system anomalies associated with a unique epigenetic signature
1. 与えられた論文の目的:
この論文では、FBXO22遺伝子のバイアレリック損失機能変異が、自動的に遺伝する先天性多系統異常に関連しているかどうかを調査しています。具体的には、FBXO22変異が関連する家系の解析を通じて、その遺伝的影響を明らかにしようとしています。
2. 使用されたデータや情報:
この研究では、12家族の系図を用いてFBXO22変異の遺伝パターンを調査しており、具体的な変異の座標が系図下に示されています。また、影響を受けた個体の顔の画像も収集し、表現型の特徴を視覚的に示しています。
3. 論文の新規性や解決された問題:
この研究の新規性は、FBXO22遺伝子のバイアレリック損失機能変異が先天性多系統異常との関連を示唆している点にあります。これまでFBXO22遺伝子のこのような影響は明らかにされていなかったため、遺伝病の原因遺伝子としての新たな可能性を開くものです。
4. 未解決の問題:
今後の課題としては、FBXO22変異が具体的にどのような生物学的経路を介して疾患を引き起こしているのかの解明が必要です。また、異なる人種や地域の集団でのFBXO22変異の影響を調べることで、その遺伝的多様性と疾患発症との関連をより詳細に理解する必要があります。
title:
FBXO22 deficiency defines a pleiotropic syndrome of growth restriction and multi-system anomalies associated with a unique epigenetic signature
creator:
Ramakrishna, N. B., Johmura, Y., Ali, N. A., Mohamad Sahari, U. B., Alghamdi, M., Bauer, P., Khan, S., Ordonez, N., Ferreira, M., Pinto Basto, J., Alkuraya, F. S., Faqeih, E. A., Mori, M., Almontashiri, N. A., Al Shamsi, A., ElGhazali, G., Abu Subieh, H., Al Ojaimi, M., El-Hattab, A. W., Al-Kindi, S. A. S., Alhashmi, N., Alhabshan, F., Al Saman, A., Tfayli, H., Arabi, M., Khalifeh, S., Taylor, A., Alfadhel, M., Jain, R., Sinha, S., Shenbagam, S., Ramachandran, R., Altunoglu, U., Jacob, A., Thalange, N., Shin, J. W., Al-Maawali, A., Al-Shidhani, A., Al-Futaisi, A., Rabea, F., Chekroun, I., Al M
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.28.24314530v1
Risk of Incident Cytopenia in Clonal Hematopoiesis
1. 与えられた論文の目的:
この研究の主な目的は、クローナル造血(CH)の一形態であるクローナル造血不特定(CHIP)を持つ個体における貧血の発生率を定量化し、貧血への進行に関連する遺伝的、人口統計学的、および実験室の値を特定することです。さらに、CHIPから骨髄異形成症候群(MN)への進行の中間段階として貧血がどのように関与するかを明らかにし、これを臨床試験のエンドポイントとしての臨床的有用性を強調しています。
2. 使用されたデータや情報:
この研究では、All of Us Research Program(AoU)、UK Biobank(UKB)、Vanderbilt’s BioVUバイオリポジトリから得られた三つの大規模バイオバンクのデータを使用しました。これらのバイオバンクからのデータには、全ゲノムシークエンシング(WGS)データ、完全な血液検査結果、患者の人口統計情報が含まれています。特に、CHIPを示す遺伝子の変異、貧血の発生、その他の健康状態に関する情報が分析に用いられました。
3. 新規性や解決できた問題:
この研究の新規性は、CHIPの持続的な貧血への進行を詳細に追跡し、特定の遺伝子変異が貧血リスクにどのように寄与するかを明らかにした点にあります。これにより、CHIPを持つ個体のリスク評価とモニタリングの改善が期待されます。また、CHIPからMNへの進行において貧血が中間段階である可能性が示唆され、これが臨床試験設計の新たな指標となる可能性があります。
4. 未解決問題:
今後の課題としては、CHIPから貧血、さらにはMNへの進行を防ぐための具体的な介入方法の開発が挙げられます。また、異なる人口統計学的背景を持つ個体におけるCHIPの影響をさらに詳細に理解するための研究が必要です。さらに、CHIPの進行をより早期に検出するバイオマーカーの同定も重要な研究領域です。
title:
Risk of Incident Cytopenia in Clonal Hematopoiesis
creator:
Brogan, J., Kishtagari, A., Corty, R. W., Pershad, Y., Vlasschaert, C., Sharber, B., Heimlich, J. B., Luo, L., Xu, Y., Bick, A. G.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314665v1
SeqFirst: Building equity access to a precise genetic diagnosis in critically ill newborns
1. 与えられた論文の目的:
この論文は、特定の医学的状況や治療における患者の管理変更に関連するデータを分析し、評価することを目的としています。具体的には、異なる人種の患者に対する治療の適応や変更がどのように行われているかに焦点を当てています。
2. 使用されたデータや情報:
論文には、患者の人種、治療の種類(医薬品、画像診断、評価のカスケード、ラボ検査、相談、カウンセリング、指導など)、治療管理の変更に関するデータが含まれています。これらのデータは、治療の適応性や有効性を評価するために使用されています。
3. 新規性や解決された問題:
この研究の新規性は、多様な人種に対する治療アプローチの違いを詳細に分析し、特定の治療が特定の人種にどのように最適化されるかを理解する点にあります。解決された問題は、人種に基づく治療のパーソナライズを促進することにより、患者一人ひとりに最適な治療方法を提供するためのデータ駆動型のアプローチを確立することです。
4. 未解決の問題:
未解決の問題としては、さらに多くの人種や民族グループを研究に含めること、治療効果の長期的な影響を追跡すること、そして治療適応の精度を高めるための追加的なバイオマーカーまたは診断ツールの開発が挙げられます。これらの問題に取り組むことで、より広範な人口に対しても効果的な治療法を提供することが可能になります。
title:
SeqFirst: Building equity access to a precise genetic diagnosis in critically ill newborns
creator:
Wenger, T. L., Scott, A., Kruidenier, L., Sikes, M., Keefe, A., Buckingham, K. J., Marvin, C. T., Shively, K. M., Bacus, T., Sommerland, O. M., Anderson, K., Gildersleeve, H., Davis, C. J., Love-Nichols, J., MacDuffie, K. E., Miller, D. E., Yu, J.-H., Snook, A., Johnson, B., Veenstra, D. L., Parish-Morris, J., McWalter, K., Retterer, K., Copenheaver, D., Friedman, B., Juusola, J., Ryan, E., Varga, R., Doherty, D., Dipple, K., Chong, J. X., Kruszka, P., Bamshad, M. J.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314516v1
Spatial and temporal changes in choroid morphology associated with long-duration spaceflight
1. 与えられた論文は、何を目的としていますか?:
この研究は、宇宙飛行後の宇宙飛行士の視覚に関連する問題、特に宇宙飛行関連神経眼症候群(SANS)とその原因となる可能性のある因子を理解することを目的としています。具体的には、長期間の宇宙飛行による脈動変動や脈動性変化が視神経の健康にどのように影響するかを評価し、これらの変化がSANSの発症にどのように関連しているかを探ることが目的です。
2. 与えられた論文では、どのようなデータや情報を用いましたか?:
この研究では、宇宙飛行中および飛行後の宇宙飛行士の眼のOCT(光干渉断層撮影)画像を用いて、脈動性変化や脈動性変動を測定しました。また、脈動性変動の振幅や脈動性変動の頻度などの詳細な分析を行い、これらの変化がSANSの発症にどのように関連しているかを調査しました。
3. 与えられた論文の新規性や、解決できた問題は何ですか?:
この研究の新規性は、宇宙飛行による脈動性変動の増加が視神経の健康に与える影響を具体的に調査した点にあります。宇宙飛行中の無重力状態が脈動性変動にどのように影響するかを明らかにし、これがSANSの発症にどのように関連しているかを示すことができました。これにより、SANSの予防や治療に向けた新たな知見が得られたと言えます。
4. 将来取り組むべき未解決問題として、何が残されていますか?:
未解決の問題としては、具体的な予防策や治療法の開発が挙げられます。この研究で得られた知見を基に、宇宙飛行中における視神経の保護策や、SANSのリスクを軽減するための具体的な方法を開発する必要があります。また、脈動性変動の詳細なメカニズムの解明も重要な課題です。
title:
Spatial and temporal changes in choroid morphology associated with long-duration spaceflight
creator:
Belanger Nzakimuena, C., Masis Solano, M., Marcotte-Collard, R., Lesk, M. R., Costantino, S.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.10.01.24314650v1
Determinants of acute malnutrition among children under five in arid regions, Kenya
1. 与えられた論文の目的:
この研究は、ケニアのトゥルカナとサンブルの各郡における幼児の急性栄養不良の発生傾向を調査し、異なる生計戦略との関連性を明らかにすることを目的としています。具体的には、過去数年間にわたる波(Wave)ごとのデータを分析し、栄養不良の変動を評価することで、地域社会の健康状態と生活環境の理解を深めることを目指しています。
2. 使用されたデータや情報:
この研究では、トゥルカナとサンブルの各郡で行われた複数の波(Wave 1からWave 6まで)にわたる急性栄養不良(WHZ < -2 SD)の発生率に関するデータが使用されています。これには、異なる生計戦略(遊牧、農遊牧、都市/近郊、漁業)がどのように栄養状態に影響を与えるかを示す情報も含まれています。
3. 新規性や解決された問題:
この研究の新規性は、特定の地域社会における生計戦略と急性栄養不良の発生率との間の関連性を詳細に分析し、時間の経過とともにこれらの傾向がどのように変化するかを追跡した点にあります。解決された問題としては、地域に特有の栄養不良のリスク要因が明らかにされ、これによりより効果的な介入策の開発が可能になりました。
4. 未解決の問題:
将来的には、異なる生計戦略を持つ他の地域や、さらに多様な環境条件下でのデータ収集が必要です。また、栄養不良の根本的な原因をより深く理解し、持続可能な解決策を提案するための、社会経済的要因や文化的要因の更なる分析が求められます。このような総合的なアプローチにより、栄養不良の予防と対策に対する理解を一層深めることができるでしょう。
title:
Determinants of acute malnutrition among children under five in arid regions, Kenya
creator:
Amugsi, D. A., Sidze, E., Thuita, F., Flax, V. L., Wilunda, C., Adnair, L., Mwangi, B., Anono, E., Odhiambo, H., Ekiru, S., Chepkwony, G., Albert, W., Ng'ang'a, M., Miller, J. D., Sagara, B., Kimani-Murage, E., Lutter, C.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.10.01.24314690v1
TMS target comparison identifies motor network reorganization associated with behavioral improvement in writer's cramp dystonia: A randomized, double-blind, sham-controlled clinical trial
1. 与えられた論文は、何を目的としていますか?:
この研究は、一次体性感覚野(PSC)と運動前野(PMC)への反復性経頭蓋磁気刺激(rTMS)が書字障害に与える影響を評価することを目的としています。具体的には、10 HzのrTMSをPSCとPMCに適用し、それぞれの刺激が書字障害の減少にどのように寄与するかを検討しています。
2. 与えられた論文では、どのようなデータや情報を用いましたか?:
この研究では、被験者が基線で行った課題ベースのfMRIを用いて個別化された頭皮目標を選択しました。また、被験者はPSCとPMCに10 HzのrTMSとプラセボのrTMS(Sham rTMS)を受け、書字行動と課題ベースのfMRIを用いてTMSの効果を測定しました。さらに、書字障害の測定値としてピーク加速度が用いられ、PSCへのrTMSがShamに比べて有意に書字障害を減少させることが示されました。
3. 与えられた論文の新規性や、解決できた問題は何ですか?:
この研究の新規性は、PSCへのrTMSが書字障害を減少させる可能性を示した点にあります。特に、PSCと上頭頂皮質間の機能的接続の強化が書字障害の減少と関連していることが明らかにされました。これは、脳の特定の領域を標的とすることで神経回路の再編成が書字障害の改善に寄与する可能性を示唆しています。
4. 将来取り組むべき未解決問題として、何が残されていますか?:
未解決の問題としては、他の刺激条件や異なる周波数でのrTMSの効果、長期的な効果の持続性、さまざまなタイプの書字障害に対する効果の一般化性についてのさらなる研究が必要です。また、機能的接続の変化が持続的な改善にどのように寄与するかを解明するための追跡研究も重要です。
title:
TMS target comparison identifies motor network reorganization associated with behavioral improvement in writer's cramp dystonia: A randomized, double-blind, sham-controlled clinical trial
creator:
Bukhari-Parlakturk, N., Mulcahey, P. J., Lutz, M., Ghazi, R., Huang, Z., Dannhauer, M., Termsarasab, P., Scott, B., Simsek, Z. B., Groves, S. N., Lipp, M., Fei, M., Tran, T. K., Wood, E., Beynel, L., Petty, C., Voyvodic, J. T., Appelbaum, L. G., Al-Khalidi, H. R., Davis, S. W., Michael, A. M., Peterchev, A. V., Calakos, N.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314652v1
Information processing speed modulation by electrical brain stimulation in multiple sclerosis: Towards individually-tailored protocols
1. 与えられた論文の目的:
与えられた論文の主な目的は、脳刺激技術、特に経頭蓋直流電気刺激(tDCS)や経頭蓋磁気刺激(TMS)などの非侵襲的脳刺激手法が認知機能や神経疾患の治療にどのように影響を与えるかを理解することです。また、多発性硬化症(MS)における情報処理速度の改善や、加齢に伴う認知機能のサポートなど、特定の症状や状態に対する介入の効果を評価することも目的としています。
2. 使用されたデータや情報:
この論文では、ランダム化比較試験、システマティックレビューやメタアナリシス、機能的MRI研究、縦断的研究など、多様なデータソースが用いられています。これには、認知テストの結果、脳の画像データ、電気刺激のパラメータ、参加者の臨床データなどが含まれます。
3. 新規性と解決された問題:
与えられた論文の新規性は、特定の脳領域をターゲットとした刺激が認知機能に与える影響を明らかにし、年齢や疾患の種類によって異なる効果を評価した点にあります。また、多発性硬化症や軽度認知障害を持つ個体に対する介入の効果を確認し、これらの手法が潜在的な治療オプションとしての可能性を探ることができました。
4. 未解決の問題:
将来的には、非侵襲的脳刺激の個別化や最適化が重要な課題です。個々の患者の脳の特性に合わせて刺激の強度や位置を調整する方法の開発、長期的な効果や安全性に関するさらなる研究、さまざまな神経疾患に対する効果の比較検討などが必要です。また、認知機能改善のための最適な訓練プログラムと脳刺激の組み合わせに関する研究も求められています。
title:
Information processing speed modulation by electrical brain stimulation in multiple sclerosis: Towards individually-tailored protocols
creator:
Riemann, S., Mittelstaedt, M., Glatzki, M., Zilges, C., Wolff, C., Niemann, F., Roheger, M., Floeel, A., Grothe, M., Meinzer, M.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.10.01.24314688v1
Social Determinants of Health and Functional Brain Connectivity Predict Long-Term Physical Activity Adherence in Older Adults After a New Cardiovascular Diagnosis
1. 与えられた論文の目的:
この研究の主な目的は、脳画像のロバストで正確な線形登録および動き補正の最適化を改善することです。特に、脳のMRIデータにおける前処理手順を最適化し、データの品質を向上させることに焦点を当てています。
2. 使用されたデータや情報:
この研究では、Siemens Skyra 3Tスキャナーを使用して取得された脳MRIデータが使用されました。具体的には、標準的なSiemens 32チャンネルRF受信ヘッドコイルを用いて、特定のパラメーター(TR、TI、FOVなど)で画像を取得しました。また、休息状態のfMRIスキャンも行われ、BOLD感受性のシングルショットエコープレーナーイメージング(EPI)シーケンスを使用しました。
3. 新規性および解決された問題:
この研究の新規性は、脳のMRIデータにおける前処理プロセスの最適化にあります。具体的には、歪み補正されたBOLD EPIリファレンスイメージの構築、T1加重リファレンスへの登録、頭部動きのパラメーターの推定など、さまざまな技術を用いてデータの精度を向上させました。これにより、データの信頼性が向上し、脳の機能的な接続性をより正確に評価できるようになりました。
4. 未解決の問題:
未解決の問題としては、さらに高度な動き補正技術の開発が挙げられます。特に、アルツハイマー病や認知的に典型的な老化集団において、頭部動きが接続性のパターンに与える影響を最小限に抑えるための新しいアプローチの開発が必要です。また、非神経的なノイズ源を除去する方法の改善も、今後の研究で取り組むべき課題です。
title:
Social Determinants of Health and Functional Brain Connectivity Predict Long-Term Physical Activity Adherence in Older Adults After a New Cardiovascular Diagnosis
creator:
Thovinakere, N., Ghosh, S., Itturia-Medina, Y., Geddes, M.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314678v1
Brain-heart interactions are associated with mortality and acute encephalopathy in ICU patients with severe COVID-19
1. 与えられた論文の目的:
与えられた論文は、COVID-19における脳と心臓の相互作用、自律神経機能不全、心拍変動性、急性脳症に関する研究を目的としています。これらの研究を通じて、COVID-19が患者の神経系と心血管系にどのように影響を与えるかを理解し、それに応じた治療戦略や診断ツールの開発を目指しています。
2. 使用されたデータや情報:
この論文で使用されたデータや情報には、心拍変動性の測定、脳波(EEG)、心電図(ECG)、さらには重症患者の臨床データが含まれます。これらのデータを用いて、COVID-19患者の自律神経系の状態や脳心軸の相互作用が分析され、患者の病状の重さや予後との関連が評価されています。
3. 新規性と解決できた問題:
与えられた論文の新規性は、COVID-19における脳心軸の相互作用と自律神経系の障害に焦点を当てたことにあります。特に、心拍変動性を用いた研究は、COVID-19患者の予後予測や重症度評価に有用なバイオマーカーを提供する可能性が示されました。また、脳波と心拍の同時分析により、意識障害の程度や回復の可能性を評価する新たな手法が開発されたこともこの論文の重要な進歩です。
4. 未解決問題:
将来取り組むべき未解決問題としては、より具体的な治療法や介入法の開発が挙げられます。COVID-19による自律神経系の障害や脳心軸の影響を緩和するための薬理学的あるいは非薬理学的介入の効果を解明することが必要です。また、異なる人種や年齢層における心拍変動性の差異や、長期的な健康影響についての研究も重要です。
title:
Brain-heart interactions are associated with mortality and acute encephalopathy in ICU patients with severe COVID-19
creator:
Hermann, B., Benghanem, S., Pruvost-Robieux, E., Sharshar, T., Gavaret, M., Cariou, A., Diehl, J.-L., Candia-Rivera, D.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.10.01.24314706v1
Head kinematics associated with off field head injury assessment (HIA1) events in a season of English elite-level club men's and women's rugby union matches.
1. 目的:
この研究の主な目的は、男女の運動学的変数(ピーク角加速度、ピーク直線加速度、ピーク角速度の変化)を用いて、HIA1イベント(Head Impact Assessment)と非ケースとの関連を評価することです。また、これらの変数がどのようにしてHIA1のリスク評価に寄与するかを明らかにし、受信者操作特性(ROC)曲線分析を通じて、それぞれの変数の感度と特異性を検討することを目指しています。
2. 使用データ・情報:
この研究では、ラグビーの試合中の接触イベント(タックル、キャリー、ラックなど)に関連する選手の情報を含むデータを使用しています。特に、HIA1評価のためにフィールドから退場した選手のタイミングを利用して、運動学データ(ピーク角加速度、ピーク直線加速度、ピーク角速度の変化)と接触イベントのタイムスタンプを同期しました。また、これらの運動学的変数を用いて、バイナリロジスティック回帰とオッズ比を計算し、HIA1イベントと非ケースとの関連を評価しています。
3. 新規性と解決した問題:
この研究の新規性は、特定の運動学的変数を用いてHIA1のリスクを評価し、男女別にその感度と特異性をROC曲線分析を通じて明らかにした点にあります。これにより、HIA1の予防および早期発見に向けた具体的な指標を提供することが可能となり、スポーツ安全性の向上に貢献しています。解決した主な問題は、運動学的データを用いたHIA1イベントのリスク評価の精度向上と、性別による差異の理解深化です。
4. 未解決問題:
今後の課題としては、さらに多様な人口統計学的特性(年齢、経験年数など)を考慮した研究が必要です。また、他のスポーツや異なるプレースタイルにおける運動学的変数の影響を評価することも重要です。さらに、HIA1以外の頭部損傷やその他の怪我に対する運動学的変数の関連性についても検討する必要があります。これにより、より包括的な予防策や治療法の開発に繋がるでしょう。
title:
Head kinematics associated with off field head injury assessment (HIA1) events in a season of English elite-level club men's and women's rugby union matches.
creator:
Allan, D., Tooby, J., Starling, L., Tucker, R., Falvey, E., Salmon, D., Brown, J., Hudson, S., Stokes, K., Jones, B., Kemp, S., OHalloran, P., Cross, M., Bussey, M., Tierney, G.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.10.01.24314695v1
Rapid, Non-Invasive Breath Analysis for Enhancing Detection of Silicosis Using Mass Spectrometry and Interpretable Machine Learning
1. 与えられた論文の目的:
この研究は、呼吸による分析を通じてシリコーシス(石綿肺)の診断におけるバイオマーカーを同定することを目的としています。特に、APCI-MS(大気圧化学イオン化質量分析)技術を用いて、患者の呼吸から得られる代謝物質のパターンを分析し、シリコーシスの有無を予測するアルゴリズムの開発に寄与することを目指しています。
2. 使用されたデータや情報:
この研究では、シリコーシス患者と健康な対照群の呼吸サンプルから得られる代謝物質の強度データを使用しています。具体的には、SHAP(Shapley Additive exPlanations)分析を用いて、予測モデルの解釈と特徴の寄与度を評価しています。また、統計的に有意な特徴(P値)と健康な対照群と比較した際の変化率(fold change)も分析に用いられています。
3. 新規性や解決された問題:
この研究の新規性は、特にm/z 442のイオンがシリコーシスの診断において高い予測能力を持つことを明らかにした点にあります。これにより、非侵襲的で迅速なシリコーシスのスクリーニング方法としての呼吸分析の可能性が示されました。また、複数のアルゴリズムを用いた総合的な評価により、診断の精度と信頼性が向上しました。
4. 未解決の問題:
今後の課題としては、より多くの患者と健康な対照群を対象にした大規模な研究が必要です。これにより、得られたバイオマーカーの普遍性と診断精度の検証が可能となります。また、他の肺疾患との鑑別診断におけるバイオマーカーの特異性を高めるための研究も求められています。さらに、実際の臨床現場での応用に向けた技術的な改良や、診断プロセスの簡素化も重要な課題です。
title:
Rapid, Non-Invasive Breath Analysis for Enhancing Detection of Silicosis Using Mass Spectrometry and Interpretable Machine Learning
creator:
Baker, M. J., Gordon, J., Thiruvarudchelvan, A., Yates, D., Donald, W. A.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314664v1
Change in Social Participation of Adults with Spinal Cord Injury During the First Two Waves of the COVID-19 Pandemic in Canada
1. 与えられた論文の目的:
この研究の主な目的は、カナダにおけるCOVID-19パンデミックの最初の2年間における成人の脊髄損傷(SCI)患者の社会参加の変化を記述することです。特に、パンデミックの過程で進化した環境の促進要因や障壁がどのように変化したか、またそれが生活習慣の実現と社会参加にどのように影響したかを評価しています。
2. 使用されたデータや情報:
この研究では、脊髄損傷を持つ成人を対象に、社会参加を測定するために2つの検証済みアンケート「生活習慣の評価(LIFE-H 4.0)」と「環境の質の測定(MQE)」を使用しました。これらのアンケートは、生活習慣の実現と社会参加の質と量を評価するために選ばれた項目で構成されています。また、参加者の社会参加の変化を測定するために、パンデミックの第一波と第二波の間で収集されたデータを比較分析しています。
3. 新規性や解決できた問題:
この研究は、パンデミックによる環境変化が脊髄損傷患者の日常生活と社会的役割の達成にどのように影響を与えたかを示しています。特に、コミュニティ内のビジネスの利用可能性、電子通信、技術援助サービスの維持、公共の場の規則などがどのように変化し、それが社会参加にどのように影響を与えたかを明らかにしました。これにより、パンデミック中における社会参加の促進要因と障壁の理解が深まりました。
4. 未解決問題:
将来的には、パンデミックが長期にわたって脊髄損傷患者の社会参加にどのような影響を与え続けるかをさらに詳細に調査する必要があります。また、異なる地域や文化的背景を持つ患者群におけるパンデミックの影響の違いについても検討することが求められます。さらに、新たな社会参加の障壁や促進要因が時間とともにどのように出現するかを追跡する長期的な研究が必要です。
title:
Change in Social Participation of Adults with Spinal Cord Injury During the First Two Waves of the COVID-19 Pandemic in Canada
creator:
Fortin-Bedard, N., Nindorera, F., Leblond, J., Rahn, C., Best, K. L., Borisoff, J., Sweet, S. N., Arbour-Nicitopoulos, K. P., Routhier, F.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314551v1
Prism Adaptation-Induced Modulation of Cortical Excitability of Upper and Lower Limb Muscles is Enhanced with Electrical Stimulation
1. 与えられた論文の目的:
この研究は、PA+Stim(物理活動と刺激)とPA+Sham(物理活動と偽の刺激)の条件下での運動誘発電位(MEP)の変化を比較し、異なる筋肉群における反応を評価することを目的としています。特に、左FDI(第一背側骨間筋)、右FDI、左TA(前脛骨筋)のMEPの振幅変化を測定し、脳刺激後の神経生理学的変化を探ることが目的です。
2. 使用されたデータや情報:
この研究では、PA+StimとPA+Shamの条件下での前後のMEP振幅を測定することにより、時間経過に伴う変化を評価しました。具体的には、左FDI、右FDI、左TAの筋肉から得られたMEPの振幅データを用いて、時間(前後)、条件(Stim vs Sham)、及びこれらの交互作用がMEP振幅に与える効果を統計的に分析しました。
3. 新規性や解決された問題:
この研究の新規性は、特定の物理活動と脳刺激の組み合わせがMEPの振幅に与える影響を詳細に調査し、筋肉群によって異なる反応が見られることを示した点にあります。左FDIでは時間による主効果と条件と時間の交互作用が見られ、PA+Stim条件でMEPが有意に増加しましたが、他の筋肉群ではこのような明確な傾向が見られませんでした。
4. 未解決の問題:
将来の研究では、異なるタイプの物理活動や脳刺激がMEPに与える影響をさらに詳細に調査する必要があります。また、異なる筋肉群や個人差による反応の違いをより深く理解するために、より大規模なサンプルサイズや多様な被験者群を対象とした研究が求められます。さらに、MEPの変化が実際の運動機能改善にどのように寄与するかを明らかにするための追跡研究も重要です。
title:
Prism Adaptation-Induced Modulation of Cortical Excitability of Upper and Lower Limb Muscles is Enhanced with Electrical Stimulation
creator:
Aloba, F. K., Hope, J. M., Spencer, J., Muthukumar, M., Leone, T. M., Parikh, V., Chen, P., Borich, M. R., Kesar, T. M.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314639v1
End-to-End Machine Learning based Discrimination of Neoplastic and Non-neoplastic Intracerebral Hemorrhage on Computed Tomography
1. 与えられた論文の目的:
この研究の目的は、脳内出血(ICH)の悪性(腫瘍性)と非悪性(非腫瘍性)を区別するための自動分割および分類ツールを開発し評価することです。具体的には、入院時のコンピュータ断層撮影(CT)画像を利用して、出血とその周囲の浮腫を含む画像からICHを識別します。
2. 使用されたデータや情報:
この研究では、2016年1月から2020年5月までの間に単一施設で取得されたCTスキャンを使用しています。これらのCTスキャンは、原因不明の急性ICHを呈した患者のデータセットから得られたもので、訓練とテストの両方に使用されました。ICHの原因は、後続のMRI結果に基づいて悪性または非悪性に二分され、ICHとPHE(周囲浮腫)のマスクは手動でセグメント化されました。
3. 新規性や解決できた問題:
提案された予測モデルは、高い精度と診断性能を示し、臨床で実装可能なエンドツーエンドのツールのための堅牢なフレームワークを提供します。また、この研究は、脳内出血の原因を自動で判別するための分類モデルとして、nnU-NetセグメンテーションモデルとResNet-34分類モデルを組み合わせるアプローチを採用しており、これにより画像の前処理から分類までを一貫して行うことができます。
4. 未解決問題:
一部の症例では、最大の病変のみがセグメント化され、分類モデルがこの特定の出血インスタンスに基づいて予測を生成したため、複数の出血インスタンスを考慮していないことが誤分類の原因となっています。また、外部検証コホートでのモデルの一般化能力の評価も今後の課題です。これらの問題に対処するためには、さらなるデータセットでのモデルのトレーニングや、複数の出血を考慮したアルゴリズムの改善が必要です。
title:
End-to-End Machine Learning based Discrimination of Neoplastic and Non-neoplastic Intracerebral Hemorrhage on Computed Tomography
creator:
Schulze-Weddige, S., Nawabi, J., Baumgaertner, G. L., Orth, T., Dell'Orco, A., Morotti, A., Mazzacane, F., Kniep, H. C., Hanning, U., Scheel, M., Fiehler, J., Penzkofer, T.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314346v1
Yearly trends in cause-specific age-adjusted mortality from 1999-2020 in Black and White Non-Hispanic Americans
1. 与えられた論文の目的:
1999年から2020年までの黒人と白人非ヒスパニック系アメリカ人の年齢調整死亡率(AAMR)の差異を分析し、その期間における全原因死亡率の変動を追跡することです。特に、人種間の死亡率の不均衡がどのように変化しているか、また特定の病気における死亡率の違いがどのように進展または停滞しているかを評価することが目的です。
2. 用いられたデータや情報:
1999年から2020年までの黒人と白人非ヒスパニック系アメリカ人の年齢調整死亡率(AAMR)のデータを使用し、特に心疾患、がん、HIV、敗血症などの特定の病気に焦点を当てた死亡率のデータを分析しています。これらのデータは、時間を通じての死亡率のトレンドを視覚的に表現するために用いられています。
3. 新規性や解決できた問題:
この研究は、特定の疾患における人種間の死亡率の差異が時間とともにどのように変化しているかを明らかにしました。特に、がん、HIV、敗血症においては、全原因死亡率のトレンドに関わらず、死亡率の差が減少していることが示されています。これにより、これらの疾患における人種間の健康格差の縮小に向けた進歩があったことが確認されます。
4. 未解決問題:
心疾患や糖尿病など、特定の原因による死亡率の差が依然として存在すること、またそれらが全原因死亡率のトレンドと一致していることから、これらの疾患における人種間の健康格差を解消するためのさらなる研究と介入が必要です。また、パンデミックがこれらの不均衡にどのような影響を与えたかについてのさらなる分析も求められています。
title:
Yearly trends in cause-specific age-adjusted mortality from 1999-2020 in Black and White Non-Hispanic Americans
creator:
Arun, A. S., Krumholz, H.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.10.01.24314642v1
Persistently high TB prevalence in Nairobi County neighbourhoods, 2015-2022
1. 与えられた論文は、何を目的としていますか?:
この研究の主な目的は、ナイロビ県における結核(TB)の有症率を時間を経て追跡し、結核の流行の変化を評価することです。また、COVID-19パンデミックの背景の下で行われた調査により、パンデミック中の結核ケアに関する洞察を提供することも目的としています。
2. 与えられた論文では、どのようなデータや情報を用いましたか?:
この研究では、ナイロビ県の特定の地理的クラスターから集められたデータを用いています。具体的には、症状のスクリーニング、胸部X線、痰の収集とその検査(Xpert UltraおよびMGITカルチャー)を行い、結核の有症率を評価しています。また、参加者のHIVステータスや糖尿病の有無、喫煙やアルコールの使用状況などの追加情報も収集しています。
3. 与えられた論文の新規性や、解決できた問題は何ですか?:
この研究の新規性は、以前にサンプリングされた地域に戻ってTBの有症率の時間経過による変化を調査した点にあります。これにより、結核制御活動の影響を評価し、将来の対策を指示するための政策を作成するためのデータを提供します。また、COVID-19パンデミックの中で結核ケアに関する重要な洞察を提供し、プログラム管理に役立てることもこの研究の成果です。
4. 将来取り組むべき未解決問題として、何が残されていますか?:
Xpert Ultra トレースポジティブ結果に対する文化陽性サンプルを検出できなかった点や、COVID-19パンデミックが結核の有症率にどのように影響を及ぼしたかの明確な理解がまだ不足しています。また、トレースポジティブ結果を持つ個人の適切な管理と治療の役割についても、さらなる研究が必要です。これらの問題に対処することで、より効果的な結核管理戦略を開発することができるでしょう。
title:
Persistently high TB prevalence in Nairobi County neighbourhoods, 2015-2022
creator:
Ong'ang'o, J. R., Ross, J., Kiplimo, R., Kerama, C., Tram, K. H., Zifodya, J. S., Mukiri, N., Nyadimo, E., Njoroge, M., Ronoh, A., Kathure, I., Kirathe, D., Hawn, T. R., Nduba, V., Horne, D. J.
date:
2024-10-01
link:
http://medrxiv.org/cgi/content/short/2024.09.30.24314683v1
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