記事一覧
Samtoolsのインストール
下記のページからソースをダウンロード Samtools Current releases http://www.htslib.org/download/ ダウンロードしたファイルを適当な場所に置いて、解凍します。 tar…
FastQC インストール
次世代シーケンサーが出力するリードのクオリティチェックするプログラム。 下記のサイトからダウンロードしてインストールします。 Babraham Instituite http://www.bioi…
Rのインストール
ubuntuのバージョン確認コマンド cat /etc/lsb-release 下記を参考にインストールします。 UBUNTU PACKAGES FOR R https://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/README…
SRAToolkitのインストール
下記のサイトを参考にインストールします。 Installing SRA Toolkit https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/02.-Installing-SRA-Toolkit ubuntuの場合は、 https://gith…
Seqkitのインストール
下記のサイトからSeqkitをダウンロードする。 SeqKit - Ultrafast FASTA/Q kit https://bioinf.shenwei.me/seqkit/download/ ubuntuなので、seqkit_linux_amd64.tar.gzを…