米国CDC：空港でのゲノム監視システム：TGSパイロット開始

日本でも始めたら良いのに・・・

CDC expands testing of international air traveler samples to include flu RSV, and other respiratory viruses | CDC Online Newsroom | CDC

CDCは、その旅行者ベースのゲノム監視（TGS）プログラムの一環として収集しているサンプルに対して、SARS-CoV-2に加えてインフルエンザ、RSV（呼吸器合胞体ウイルス）、および選ばれた他の呼吸器ウイルスの早期検出を提供する新しいパイロットを実施しています。このパイロットは数ヶ月間行われ、Ginkgo BioworksとXpresCheckによって実装されます。これらのウイルスに陽性反応を示すサンプルはシーケンスされ、公衆衛生当局者や政策立案者に貴重な情報を提供するために公共のデータベースにアップロードされます。

CDCの旅行者健康支部のチーフであるシンディ・フリードマン博士は、「秋の呼吸器シーズンに向けて、旅行者ベースのゲノム監視プログラムをインフルエンザ、RSV、および他の病原体に拡大することが不可欠です。COVID-19パンデミック中に開始されたTGSプログラムは、新しく珍しいSARS-CoV-2ウイルスの変異体を検出する早期警戒システムとして機能し、今後も他の呼吸器ウイルスに対して同様のことを行います」と述べています。

TGSは、到着する国際旅行者の自発的な鼻腔サンプリング、航空機テスト、全国7つの空港での廃水サンプリングを含む三つの補完的なアプローチで構成される多面的なプラットフォームです。TGSは、リアルタイムで変化するパンデミックに迅速に適応し、特に検査とシーケンス情報が限られている場合に、世界的な監視のギャップを埋めるために、アメリカの公衆衛生当局者にとって機敏でスケーラブルなリソースであることが証明されています。例えば、TGSは、SARS-CoV-2変異体BA.2.86が世界的に同定されてから数日以内にアメリカへの流入を早期に検出しました。感染した旅行者が日本からの旅行を始めたため、この発見は新しい変異体がアジアにも広がっていることを公衆衛生コミュニティに通知しました。

2023年9月現在、TGSは36万人以上の航空旅行者を登録しています。プログラムへの参加は自発的かつ匿名です。このプログラムは、世界保健機関のすべての地域からの135か国以上のフライトをカバーしています。

Zhou, Shiwei, とSamuel L. Aitken. 「Prophylaxis Against Pneumocystis jirovecii Pneumonia in Adults」. JAMA 330, no. 2 (2023年7月11日): 182. https://doi.org/10.1001/jama.2023.9844 .

ChatGPT4にて日本語要約

米国疾病予防管理センター（CDC）は最近の声明で、旅行者ベースのゲノム監視（TGS）プログラムの一環として、インフルエンザや呼吸器合胞体ウイルス（RSV）などの呼吸器ウイルスもSARS-CoV-2と共に監視する新たなパイロットプログラムを開始すると発表しました。

このTGSプログラムは2021年に新たなSARS-CoV-2のゲノム変異を検出するために始まりました。参加している空港の旅行者からの自己採取した鼻腔スワブや、これらの空港および飛行機からの廃水からウイルスに関するデータを収集しています。そのサンプルは遺伝子配列を解析するためにラボに送られます。今後、研究者は追加の呼吸器ウイルスのためにもサンプルを分析する予定です。

このプログラムは7つの米国空港に到着する36万人以上の旅行者を登録しており、グローバルに報告される数週間前にオミクロン変異体を検出することに成功しました。そして今後、他の病原体についても「早期警戒システム」として利用される予定です。