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分子動力学シミュレーション

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2023年8月の記事一覧

metadynamicsにおける自由エネルギーの時間依存定数項を決定する方法

metadynamicsにおける自由エネルギーの時間依存定数項を決定する方法

well-tempered metadynamicsが十分に収束すると,時間依存バイアスポテンシャル$${V(s,t)}$$と自由エネルギープロファイル(平均力ポテンシャル)$${F(s)}$$には

$$
\begin{align*}
F(s) &=-\left[1+\frac{T}{\Delta T}\right]V(s,t)+C(t)
\end{align*}\tag{1}
$$

の関係が

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Statistical Mechanics: Theory and Molecular Simulation Chapter 9 - Quantum mechanics

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Statistical Mechanics: Theory and Molecular SimulationはMark Tuckermanによって著された分子シミュレーションに関連した熱・統計物理学,及び量子力学の参考書になります。

現時点では(恐らく)和訳がないこともあり,日本での知名度はあまりないような気がしますが,被引用数が1400を超えていることを考えると海外では高く認知されている参考書

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Statistical Mechanics: Theory and Molecular Simulation Chapter 8 - Free energy calculations

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Statistical Mechanics: Theory and Molecular SimulationはMark Tuckermanによって著された分子シミュレーションに関連した熱・統計物理学,及び量子力学の参考書になります。

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