小児割礼に伴う陰茎マイクロバイオームの変化の特性評価

小児泌尿器科|論文・インプレス
小児割礼に伴う陰茎マイクロバイオームの変化の特性評価
キルティシュリ・ミシュラ
イラハ・イサーリ
モヒト・シンダニ
Lynn L. Woo
Philip H. Abbosh
ローラ・ブカビナ
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Published:December 22, 2022DOI:https://doi.org/10.1016/j.euf.2022.12.007
PlumX メトリクス

概要
背景
マイクロバイオームと宿主の制御は多くの疾患状態に独立して寄与しているが、小児集団における割礼がその後の陰茎マイクロバイオームの変化にどのように影響するのかは不明である。
研究目的
本研究では、ペアになった分類学的プロファイルを共同で解析し、炎症、バリア保護、エネルギー代謝に関与する経路を評価することを目的とする。
デザイン、設定、参加者
割礼の前後に尿道周囲から採取した11のペアサンプルを分析し、マイクロバイオームおよびマイコバイオームプロファイリングを作成した。16S リボソーム RNA と内部転写スペーサーシークエンスのサンプル調製は、国立衛生研究所ヒトマイクロバイオームプロジェクトで開発された方法を採用した。
アウトカム測定と統計解析
Silva-Tax4FunとGreengenes-Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States（PICRUSt）アプローチを用いて、サンプル間の微生物コミュニティの予測的な機能属性を取得した。微生物群集の予測機能は、正規化された分類学的存在量を、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomesのオーソロジー参照プロファイルの事前計算された関連マトリックスに線形結合して決定された。
結果および制限
いくつかの顕著なマイクロバイオームおよびマイコバイオーム組成の違いが、包茎前患者と包茎後患者の間で観察された。分類群間の一対比較では、割礼後にマイクロバイオーム生物（Clostridiales, Bacteroidales, Campylobacterales）およびマイコバイオーム（Saccharomycetales and Pleosporales）が有意に減少した（p < 0.05, false discovery rate corrected）ことが明らかになった。割礼前後で合計14のパスウェイの存在量に差が認められた（p < 0.005、偽発見率 < 0.1、線形判別分析スコア >3；5つが濃縮、9つが枯渇）。割礼後に減少したパスウェイは、ほとんどがアミノ酸とグルコース代謝に関与しており、割礼前のパスウェイは、遺伝情報処理と転写プロセスに富んでいた。予想通り、割礼前には、化学的な合図や環境に対する微生物の指向性運動に関与する膜タンパク質であるメチル受容性化学走性タンパク質が濃縮され、割礼後には糸状菌ヘマグルチニン経路（強い免疫原性タンパク質）が枯渇していた
結論
我々の結果は、陰茎割礼の宿主-微生物叢の関係に対する洞察を深め、炎症、感染、発癌のドライバーに焦点を当てた将来の研究の基礎を築くのに役立つと思われる。
患者の概要
我々の研究は、割礼後に細菌と真菌、特に炎症と癌の潜在的な誘発因子として知られる嫌気性菌が有意に減少することを示した。これは、割礼後のマイクロバイオームの変化を示す初めての研究であり、割礼後の健康な乳児に起こる変化の一部は、成人期における癌や炎症性疾患の違いを説明するものであると思われる。
キーワード
割礼
マイクロバイオーム
マイコバイオーム
16SリボソームRNA配列決定
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記事情報
出版履歴
オンラインで公開されました。2022年12月22日
受理されました。2022年12月8日
アソシエイト・エディター クリスチャン・グラッツケ
出版時期
In Press 修正プルーフ
識別番号
DOI: https://doi.org/10.1016/j.euf.2022.12.007