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■なにをするサークルか KNIMEワークフローを見せ合ったり、アドバイスしたりするサークルです ■活動方針や頻度 BANDを使って情報交換します。 KNIMEもくもく会はサポータの皆さんと相談して開催決定します。 ■どんな人に来てほしいか KNIMEが好きな人ならどんな方でも構いません！ お互いに個人名は伏せていいので、気軽にやりましょう。 ■どのように参加してほしいか 見ているだけでも大丈夫です。 リアクションは活力源なので大歓迎です。 情報交換できるなら、最高です！

  • KNIMEサポーターズクラブ

    ¥100 / 月

  • KNIME KNIMER KNIMEST

  • 巨人の肩の上でKNIMEを語る

    これまで多くのKNIMEにまつわる「巨人」に助けられてきました。 その力を借りて、もっと遠くを見たいし、他の方にもお見せしたい。 その想いをつづっていきます。

  • Just KNIME It! 戦記

【zassou.syk】みとちがなかまにくわわった！

私のnote投稿100回目の佳き日に、良いニュースを告知できそうです。 zassou.syk(仮称：ザッソウ創薬)を企画して3ヶ月、進展がありました。 これまでKNIMEST (KNIME Support Team)は独りで活動してきました。しかし、 みとちがなかまにくわわった！ ブログはこちらです。 zassou.sykで何をやるのか、まだあやふやですけどもKNIMEの勉強がしたいと声掛けしてくださる方は結構いました。みとちさんは優秀なKNIMEer (補足:ナイマ

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    • 【zassou.syk】osaka.sykの灯火

      zassou.syk(仮称：ザッソウ創薬)を企画して3ヶ月、そろそろ具体化しないとね。 創薬研究についてザッソウのように話し合い研鑽する場というのは、実のところちっとも新しくはないです。 幸い面白がって参加したいと言ってくださる方々がいました。多くの方はosaka.sykのメンバーだったので、過去に楽しくまたためになった成功体験を共有できているからではないかと思います。 ちなみにosaka.sykについては、名は伏せますが中心となって下さった方が関西を離れて、今は数年来休

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      • 【zassou.syk】ザッソウと創薬

        zassou.syk(仮称：ザッソウ創薬)を企画して2ヶ月（短）。 https://note.com/knimesupportteam/n/n52e1f8d30f75 徒然なるままに書きつけてみます。 仕事でよく、「ザッソウ」をします。 雑談のような相談、雑な相談ととらえ方もいろいろあるようですが、「雑」だけにそこはまぜこぜでいいかなと思ってます。 私は週に1回出社したら珍しいと声を掛けてもらえるくらいテレワークしています。 出社した際に顔を合わせて挨拶を交わし、「そ

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        • 【zassou.syk】創薬コミュニティ

          今年は昇龍のようにと願をかけてから2ヶ月、迷走を続けておりますKNIMESTです。まだ地を這いまわっている印象。 もう30年程研究の現場にいるのですが、まだ自分探し（苦笑）中であちこちのコミュニティに顔を出してみました。 6, 12月 PPP関西 7月 KNIME Data Talks JAPAN 2023 9月 Chemaxonユーザーグループミーティング2023 11月 mishima.syk #20 Dotmatics情報交換会 第8回ケモインフォマティクス秋の学校

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        【zassou.syk】みとちがなかまにくわわった！

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        マガジン

        • KNIME KNIMER KNIMEST
          100本
        • 巨人の肩の上でKNIMEを語る
          13本
        • Just KNIME It! 戦記
          61本

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        記事

          【KNIMEST】たつ年なので

          まずは皆様の無事と健康を祈りつつ、今年最初の記事を投稿いたします。 【伏龍と昇龍】2023年はnoteに1度しか投稿しませんでした。 この記事で紹介したJKI Season2では新たなKNinjaが誕生しましたね。山本さん、吉田さん、瀬尾さんと日本でも屈指の実力者たちが選出されていたのが嬉しかったです。 私の方はたつ年にちなんで例えるならば伏龍のように身を潜めていました。そんな私をKNIME社は忘れないでいてくれて、bookletでの紹介に加えトロフィーまでもらって発奮

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          【KNIMEST】たつ年なので

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          【JKI】Just KNIME It! Season 2 はっじまっるよー

          【JKI復活祭】Just KNIME It! (JKI) のSeason 2がいよいよ開催です。2023/3/29のイースターの最中にやってきますよ！ RosariaさんたちがLinkedInで期待感を盛り上げてくれています。 【変化しつづけるKNIME】私がすっかり雌伏を決め込んでいる間にKNIMEを取り巻く環境も変わってきました。 KNIME Business Hub公開 KNIME Analytics Platform Version 5も公開へ 今回の挑戦

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          【JKI】Just KNIME It! Season 2 はっじまっるよー

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          【JKI】Meet_the_Top_KNinjas_of_Just_KNIME_It!

          【JKI KNinja四天王】 Just KNIME It! (JKI) の10ヶ月ほどの試練を終え、のんびりお休みしていたところで驚きの知らせがありました。 JKI KNinja四天王の一人に選出されました！！えっ、日本語訳違います？ 紅魔族なら歓喜するかっこよさです。 すさん、まっきーさんを敬愛し、Rosaria SilipoさんのようなKNIMEエバンジェリストにあこがれる私としてはこの上なく嬉しい受賞でした。 ただ、私の苗字は安江なのですが、KNIME社に伝

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          【JKI】Meet_the_Top_KNinjas_of_Just_KNIME_It!

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          【JKI】040_Just_KNIME_It!_Season_Finale

          【JKI_040】課題を確認Just KNIME It! (JKI) 今回の挑戦はこちら 問題文のところだけをDeepL翻訳し少し加筆して以下に さらに 好きなもん作ってみ！ってことですね。粋な計らいです。 あまり悩まないで決めました。JKI以外の私のもう一つの挑戦であったTeachOpenCADD-KNIME（TOC）体験記も先月最終回を迎えたところでした。 TOCでは扱ってなかったニッチな技術をコンポーネントにしてみようと思います。 そしてそれを部品としてKNI

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          【JKI】039_Legislative_Limits_on_Teaching

          【JKI_039】課題を確認Just KNIME It! (JKI) 今回の挑戦はこちら 問題文のところだけをDeepL翻訳し少し加筆して以下に 【データの入手と背景】【Google Sheets】 サンプルデータ： をGoogle Sheetsで開いてみます。 自分のアカウントにコピーしてからKNIME Workflow (WF) での読込をします。 使い方の基本は全てまっきーさんが教えてくれます。いつも本当にありがとうございます。 設定はそれぞれのアカウン

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          【JKI】039_Legislative_Limits_on_Teaching

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          【JKI】038_Word_Windows_02_TRAP

          【JKI_038】課題を再確認文章中の特定の単語の前後3語までのウィンドウサイズで語句抽出すると言う問題です。 サンプルのExcelを読みこんで、結果としてどういった画面表示で出力するかまでは紹介したので、続けて私の解答したworkflow (WF)のコンポーネントの中身を紹介します。 ただし、効率的ではないなと自分でも感じてはいるので公式解答を楽しみにしているところです。私のWF説明はざっくりとしておきます。 【トラップを踏みしめる製作工程紹介】【入力制御】 WFを

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          【JKI】038_Word_Windows_02_TRAP

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          【JKI】038_Word_Windows_01_コンポーネント

          【JKI_038】課題を確認Just KNIME It! (JKI) 今回の挑戦はこちら 問題文のところだけをDeepL翻訳し少し加筆して以下に 【サンプルデータはトラップだらけ】サンプルデータ： Excelで開いて見ます。 水色表示は大文字と小文字を区別しないで「eggs」の完全一致検索でヒットすべき単語を示しています。問題文で書かれている通り文頭にも文末にもありますし、2文にわたって一行で2回ヒットもあったりします。 一方で、「この種の検索によくあるトラップ」

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          【JKI】038_Word_Windows_01_コンポーネント

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          【JKI】037_Text_Deduplication

          【JKI_037】課題を確認Just KNIME It! (JKI) 今回の挑戦はこちら 問題文のところだけをGoogle翻訳し少し加筆して以下に 【PDFデータをKNIMEで取り込む】【サンプルデータを読んでみると】 今回はスウェーデン語データを扱うのですね。サンプルデータを取ってきましょう。 サンプルデータ： 内容はさっぱり見当もつかないです。でも最近は自動翻訳が素晴らしいですね。 なるほど、何となくリンネ大学の「健康と行動科学」分野の教育プログラム説明なん

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          【JKI】037_Text_Deduplication

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          【JKI】036_Implementing_Custom_Time_Alignment

          【JKI_036】課題を確認Just KNIME It! (JKI) 今回の挑戦はこちら 問題文のところだけをGoogle翻訳し少し加筆して以下に 【カスタムタイムアライメントってなんだ】GoogleでもDeepLでもCustom Time Alignmentはカスタムタイムアライメントで、日本語に変換しにくいようです。要するに自分たちで好きなように時間軸の調整ができると言うことなのかなぁと推測します。 今回の場合は与えられたデータに日時データの欠損があるのでそれを自分

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          【JKI】036_Implementing_Custom_Time_Alignment

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          【JKI】035_Linkedin_Network_Graph_02_グラフでの可視化

          【課題を再確認】Just KNIME It! (JKI)の第35回は というのがお題です。前回の記事はデータのETLで終わってしまいましたので、今回は可視化します。 【KNIMEでのネットワークグラフ実装例】 KNIMEでのネットワークグラフ作成は、全くやったことがありませんでした。 そこでヒントを元に情報を探りました。 KNIME Hubにおいて「Network Creator」で検索したら、workflow (WF)に限定しても816ヒット！ しかも私の本業であ

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          【JKI】035_Linkedin_Network_Graph_02_グラフでの可視化

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          【JKI】035_Linkedin_Network_Graph_01_つながり申請中

          【JKI_035】課題を確認Just KNIME It! (JKI) 今回の挑戦はこちら 問題文のところだけをDeepL翻訳し少し加筆して以下に 【LinkedInのデータ】私もLinkedInのアカウントはあるにはあるんで、データは取得してみました。でも21人しかつながってないんです…。繋がってくれている皆さんありがとう。 https://www.linkedin.com/in/jp-knimest-5b5a73235/ なのでサンプルデータを借用します。 いつ

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          【JKI】035_Linkedin_Network_Graph_01_つながり申請中

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          【W8】タンパク質データの取得_11_Step3_最終工程

          【W8の目的とStep3概要】Python版はより発展的です。 上記の(ii)を実行中。デモデータを使ってW8のStep2を学びました。 出力は下記のようなデータテーブルです。 今回から最終工程のStep3。 「最も質の良い4つのタンパク質ーリガンド複合体構造」すなわち解像度順でTop 4に絞って共結晶のデータを取得します。 上位4つに絞るのですが、同スコアで4位が3つあるうち、3POZだけが残りますね。 PDBからデータが入手できた順(Row ID)に並ぶので、PD

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          【W8】タンパク質データの取得_11_Step3_最終工程

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