小さな誤解が命取り #1 〜ウイルスの変異〜
シリーズで、短い記事をいくつか出そうと思います。
題して、『小さな誤解が命取り』シリーズ。このシリーズの目的は、新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）に対する理解を深めるために、小さな誤解を正し、議論の前提を共有することです。
今回は、その第一回。『ウイルスの変異』について解説します。
中国・武漢で発生したウイルス性肺炎の原因が、新型のコロナウイルス（SARS-CoV-2）と判明してから、丸3年が経ちました。
このコロナ禍で、ウイルスは変異しやすいこと、特にRNAウイルスは早く変異していくことは、常識として知られるようになったと思います。
デルタ株以降、オミクロン株で大きく弱毒化し、「最初の所謂『武漢株』とは全く別のウイルスだから、「新型コロナウイルス」という呼称は止めるべきだ！」と主張する人たちもいることは、私の過去記事で紹介しました。
では、ここで問題です。
最初の武漢株とオミクロン株のRNAゲノムの塩基配列を比較した場合、一致率はどのくらいになるでしょうか？
① 99 ％
② 88 ％
③ 77 ％
最も近いと思うものを、3つの中から選んでください。
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正解は、「① 99 ％」です。当たりましたか？
実際に、新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の塩基配列を比較してみましょう。
武漢株（Wuhan-Hu-1）の配列情報はこちら。↓
オミクロン株の配列情報はこちら（2022年2月のもの）。↓
この2つの塩基配列（約3万塩基）をプリントアウトし、目視で比較することもできますが、それはとても大変な作業なので、私は、『GENETYX』という遺伝子解析ソフトウェアを使いました。
解析結果は、以下の通りです。
2つの塩基配列を比較すると、29779塩基中、29674塩基が一致したと出ています（一致率は、正確には「99.6％」）。画像に表示されている塩基配列の先頭の部分だけ見ると、ほぼ全ての配列が一致していることが分かります。
ただし、スパイクタンパク質をコードする遺伝子（21563～25384番目）には、塩基の『欠失』や『挿入』を含めた大きな変化が見られます。
このように、オミクロン株に生じた変異のほとんどは、スパイクタンパク質に集中しているのです。
（画像：https://www.genscript.com/omicron-variant.html）
SARS-CoV-2は、『nsp14』と呼ばれる変異を修復する特殊なタンパク質を持ちます。
この特殊なタンパク質の働きにより、現在、一年で「27.814塩基」が変異すると推定されています（1月14日現在）。全長3万塩基中の約30塩基です。
nsp14を持つSARS-CoV-2の変異速度は、これを持たない他のRNAウイルスと比較して、実はとても「遅い」のです。
☆ SARS-CoV-2は、変異を修復する特殊なタンパク質を持つ。
☆ 最初の武漢株とオミクロン株のRNAゲノムの一致率は、「99.6％」。
これらの前提が、実は、『ワクチン』や『人工ウイルス説』など、新型コロナウイルスに関する様々な議論をする上で、非常に重要なのです。
まずは、これらの前提を共有しなければいけないと思いました。
また詳しくは別の記事にまとめますが、例えば、『人工ウイルス説』では、「サイコロの同じ目ばかり出るのは確率的におかしい！人工だ！」というような話があります。しかしながら、SARS-CoV-2には変異を修復するタンパク質が存在するため、「サイコロを振り直す」という試行を組み込まなければいけないのです。
以上。
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※ この記事に特定の個人や団体を貶める意図はありません。
※ 文責は、全て翡翠個人にあります。
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