表題通り. Google Summer of Code 2022に通った. 今回応募したのは, National Resource for Network Biologyが出してた, ってやつ. ハーバードでResearch AssociateをされてるDr. Augustin Lunaと一緒に働くことになりました. やることは既存のライブラリにGNN使えるモジュールを追加しよう的なやつ. で, 申請した書類はコレ. ある程度フォーマットは決まっていて, 一旦ドラフ
読んだなんかGATとかの論文 なんかおもろいの見つけたけど事前知識をたくさんつけなあかんなとなってる. やった課題 酒を飲む グレーディング 思ったこと中間にかまけて研究を全くしていないので今週はちゃんとやっていきたい… が今スタックしてるところなのでサーベイ再度やり直して進捗を生みたいものである.
読んだIntroduction algorithm 関連 RSAとか群論とかFFTとかを試験用に復習 Degroot の Probability and Statistics 試験用に軽くさらった. PDFとCDFの計算が未だ明確ではないのでもう少し勉強したいところ. PRML 一周した やった課題 あと課題の復習 酒をしこたま飲む 思ったこと春休み, 本当に課題と試験勉強しかしていなかった. あと酒を飲んだ. 何故か16時頃に睡魔に勝てないことが増えてき
読んだIntroduction to Algorithm 群論関連 論文を2, 3本 Drug Repurposing の勉強中 やった課題 リポジトリ作成 論文まとめとComputational Biologyまとめみたいなの作った 禁煙8日目 思ったこと再来週一週間休みなので良い. ゆうて最近休みのような時間の使い方をしている. が, 月曜日には教授にドラッグリパーパシング関連の研究を勧めていく旨を話しつつディスカッションできればいいなと思う. となんか来
読んだIntroduction to Algorithm 冪剰余のところ 論文を2, 3本 Drug Repurposing の勉強中 PRML ギブスサンプリング やった課題 リポジトリ作成 自分があとから見たらありがたそうなまとめを作ろうかと思っている. やるかはわからん 論文まとめ ギター2時間くらい 思ったこと時間の使い方がむじいなと思った. 最近睡眠周期が安定してきそうな感じがしているので(1-7時位まで寝てあとは時間が使える感じ)ちょっと細
読んだフラジャイル 研究への意欲が湧くいい漫画であった ドラッグディスカバリーやっていこうな 生化学とPharmacogenomics系の講義取りたい. Data Imputation, zenzen kyoumi nai PRML MCMCのところ やった美術館行った 結構日本の美術がたくさんあった. まあまあ広くて疲れた レビュー 2本 実験系の実装少し とりあえず既存の実装との比較1つ目は終えてあと一つ ミーティング Drug repurpos
読んだ1章 FFTのところとユークリッドの互除法のところ やったコードレビュー ポケモン 論文実装の再現 データセットの作成 絶対おかしいデータセット作成手法なんだけどこれどうしようってなってる Kaggle 週イチ一時間やることにした :yazaten: ゼルダ 2周目 3体ガノン倒した 思ったこと今の研究おもんないからこあどばいざー探したいって言ったら薬理系の人のプロジェクトに行けそうになった :happy: :happy: 友達とご飯食べてたら
読んだIntroduction to Algorithms: Chapter 30 やった研究 データセット作成 既存研究に作成方法が書いてはあったが明らかに動かない記載があって困った 複数種データセットが提示されていたが, それを用いたときのコードも残しておいてほしいなと思った. 課題 なんか計算量が一生合わなくてよくわからなかった. アルゴリズムがいつか得意になる日が来るのだろうか… ヨヨイさんと1on1 一年ぶりくらいに1on1をした. いい感じ
読んだコードリーディング Keras: https://github.com/keras-team/keras/tree/master/keras/layers torchdistill: https://github.com/yoshitomo-matsubara/torchdistill PRML: サンプリングの章のMCMCまで Probability and Statistics, (4th Edition) by Mark J. Schervish, and
読んだ今週は何を読んだか覚えていない…ので一旦割愛する. やった研究用コードの Matlab → Python の実装. ランダムウォークの実装 ギターの練習 ゼルダの祠集め 思ったこと今週はコーディングがメインだった. 来週から授業が始まるため, 色々頑張っていきたい. ちょっと思ったんだけども, 会社勤めしてたときに得たどう働くかとか, 研究をどう回すといいか, みたいなのが博士課程に活かせると思ったんだけどあまり思い出せていない…書き留めておけばよかった.
読んだ PRML 3章. 経験ベイズとかの話をやってなかったので読んだ. なんかあんまり数式を追う気が起きなかったので, 他のやつで補っておこうかと思う. 遺伝子のデータの穴埋めを頑張ってするというやつ. 距離行列作って Adaptive Gaussian Kernel に通してMarkov Normalizationしてexp通して元のベクトルに書けるといい感じになるというやつ. イントロ, リザルト, メソッドだけ読んだ. 多分理解した. 表現型と遺伝子型の関連の予
読んだ Effective Python 第2版 ―Pythonプログラムを改良する90項目 Brett Slatkin 1, 2, 5, 6章は勉強になるところがあった. がメインがプロダクション運用のために書かれている感じだった. オブジェクト指向でなぜつくるのか 第３版 知っておきたいOOP、設計、アジャイル開発の基礎知識 平澤 章 1-7まで読んだ. 8以降はプロダクションぽかったので読んでない. 独学プログラマー Python言語の基本から仕事のやり方まで
先週アドベントカレンダーを書いたわけだが, 仕事をしていたときほどいつ何をして何を学んだ, みたいなログを取れていないという気づきを得たので今週から週報を書こうと思う. ただのメモのためそこまで中身はない. 今週やったこと読んだ 問題解決力を鍛える!アルゴリズムとデータ構造 (KS情報科学専門書) 大槻 兼資 読んでる プログラマ脳を鍛える数学パズル シンプルで高速なコードが書けるようになる70問 増井 敏克 Effective Python 第2版 ―Python
