治安主導の要請を受けた陸上自衛隊東部方面総監部は直ちに神浜市周辺の駐屯地に出動命令を出した。 　また、「魔法少女管理法」において制定されたマニュアルに従い厚生省に連絡、保護施設に居る魔法少女たちを派出するよう依頼した。

完全武装の機動隊銃器対策レンジャーですら太刀打ちできないことから報告を受けた日本政府は警察力での解決は困難と断定。 自衛隊を治安出動させることを決定する。日本政府が命令したとなると国民感情の動揺招くと考え、県知事に要請を出させる形を採った。