第11回デジタル進化生物セミナー

3月26日（金）16:00- 

末永雄介博士（千葉県がんセンター研究所）
「Coding RNAとNoncoding RNAを分かつ原理とは何か？
―小児がん研究をきっかけとした遺伝子進化研究」

https://digitalevosemi.jimdofree.com

また、第10回の大林龍胆博士のご講演「バクテリアの染色体倍数性進化を考える」の見逃し配信を公開致しています。
ぜひご覧ください。
https://youtu.be/5LyCAt5DCd4

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2021年3月26日金曜日16:00-（日本時間）
末永雄介博士（千葉県がんセンター研究所）
「Coding RNAとNoncoding RNAを分かつ原理とは何か？―小児がん研究をきっかけとした遺伝子進化研究」

10才に満たない幼い子どもが患うがんに神経芽腫があります。神経芽腫はその名の通り神経細胞やその前駆細胞からできるがんで、胎児においてこれら細胞が異常に増殖することが原因と考えられています。この異常な増殖にはMYCNというがん遺伝子が関与しており、MYCNを抑制することが神経芽腫の有効な治療法になると考えられています。私はこのMYCNを治療標的として研究する中で、MYCNのアンチセンス転写産物NCYMがヒトやチンパンジーでのみ100アミノ酸以上の読み枠を持つことを見つけました。公的データベースではこの転写産物はlong non-coding RNAとして登録されていましたが、ヒト神経芽腫細胞では実際にNCYMタンパク質が発現し神経芽腫の遠隔転移を促進することがわかりました(Suenaga et al., PLoS Genetics 2014; Suenaga et al. Jpn J Clin Oncol. 2020)。
　不思議なことにこのNCYMタンパク質は既知のタンパク質と全く相同性がなく、既知のドメイン構造もありませんでした。その後の比較ゲノム解析からNCYMはヒト亜科においてlong noncoding RNAから全く新規に出現したcoding遺伝子（de novo遺伝子）であると結論づけました。これが遺伝子進化の研究と出会ったきっかけです。
　本講演では、「任意のRNA配列からそのRNAのcoding 確率が計算できないか？」というコンセプトをもとに考案したスコア(PTIスコア)について紹介し、約340万転写産物（100生物種とウイルス105種）の解析から見えてきたcoding RNAとNoncoding RNAの境界とその進化について議論します。また、現在ヒトにおいてlong noncoding RNAと登録されている遺伝子の中にもcoding 確率が高いRNAが存在し、大脳発生やがんと関連することが示唆されました。このことは現在long noncoding RNAと登録されている遺伝子の中に種を特徴づけるde novo遺伝子が多数存在する可能性を示しています。De novo遺伝子研究に興味を持っていただき、様々な生物種において解析が進むことを願って発表いたします。

研究室HP: https://www.pref.chiba.lg.jp/gan/kenkyujo/soshiki/segyo/index.html
ゴールドリボンネットワークについて
https://www.goldribbon.jp/activity
Smash Childhood Cancer 〜 小児がんで闘う子どもたちへのITでの支援
https://www.worldcommunitygrid.org/research/scc1/details.do

参考文献
Suenaga et al., PLoS Genetics (2014) NCYM, a Cis-Antisense Gene of MYCN, Encodes a De Novo Evolved Protein That Inhibits GSK3β Resulting in the Stabilization of MYCN in Human Neuroblastomas.
Suenaga et al. Jpn J Clin Oncol (2020) De novo evolved gene product NCYM in the pathogenesis and clinical outcome of human neuroblastomas and other cancers.

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