初心者によるmacOSでの構造解析

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MacはUNIXベースのOSなのでLinuxを使わずとも構造解析できるよ！というのはよく知ってるし昔はそれで実際にMacを使って解析してきたわけですが，構造解析から足を洗って数年… もっと読む

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#初心者

Mojave で fink-0.44.1 のインストール ”は” できた件（2019.03.19）

3 月 15 日付けでブログを更新した，fink-0.44.1 リリースのお知らせですが，あ，リリースされたんだ，これならインストールもうまく行くと思って，特にニュースの内容について精読していませんでした．何が書かれてあったかというと， 1）Mojave で fink インストールしないこと，つまり，OS は 10.9 - 10.13 のときに fink install すること． 2）fink install した後で，Mojave にアップグレードする． 3）ターミナ

初心者が macOS Mojave に Homebrew を使って GROMACS をインストール（1）

Homebrew を使って色々なソフトウェアをインストールする前準備は終わった（はず）なので，分子動力学シミュレーション（Molecular Dynamics (MD) Simulation）のソフトウェア，GROMACS とその計算に必要な幾つかのソフトウェアをインストールしていきたいと思います．このブログとインストールが同時並行なのでうまく行くかも分かりませんが…（うまく行かなかったらトラブルシューティングもしないとです…） ※ 結果，多分うまく行ったのですが，途中

fink-0.44.1 released のお知らせ（2019.03.15）

一昨日，Fink の Mirroring infrastructure が軒並みダウンしているおかげで Mojave に Fink をインストールできないとブログに書きましたが，今日，再び Fink のサイトに行ってみたところ，Mojave 用にアップデートした ver. 0.44.1 がリリースされていました．これで，Fink もインストール可能になったと信じて後日（来週あたりにでも）やりたいと思います．

備忘録的 macOS Mojave の Homebrew 環境再構築（2）

（1）で Homebrew のアンインストール・再インストールを行い，brew doctor で Homebrew の環境を完全クリーンな状態にしました．なので当然 $ brew list を実行してもすっからかんです．因みに fink list とは違って brew の場合はインストールされた Formula がリストアップされます．というのはさておき，何故 Homebrew を入れたのか，理由は今のところ一つです．それは分子動力学シミュレーション（GROMACS）を