書記のBioInfo日誌#9(2021/08/24) DrugBankで検索
今回は，薬剤に関するDBである「DrugBank」について扱ってみる。
薬剤の検索
色々とできることはあるが，今回は最も基本である検索機能について実際に触れてみる。
例として，何かと話題な「レムデシビル」について検索する。
結果がこちら。
では，各欄についてざっと見てみる。
Identification
薬剤の概要。
Summary：Remdesivir is a nucleoside analog used to treat RNA virus infections including COVID-19.
各薬剤にはIDが割り当てられている。（DrugBank Accession Number：DB14761）
Pharmacology
薬理作用について，標的分子の列挙。
薬物動態について，主な代謝物。
Interactions
薬物相互作用について。
Products
製品情報について。
Categories
分類について。
Chemical Identifiers
化学的表示について。
References
参考文献。
他DBへのリンク。
Clinical Trials
臨床試験の情報。
Pharmacoeconomics
薬剤経済学，特許などの情報を含む。
Properties
物性情報。
Spectra
スペクトル情報。
Targets
上に挙げた標的分子の詳細。
Enzymes
代謝酵素の詳細。
Transporters
トランスポーターの詳細。
その他注目した機能：Similar Structures
類似構造を検索できる。
検索結果。
活用例
題名：Searching for target-specific and multi-targeting organics for Covid-19 in the Drugbank database with a double scoring approach（DrugbankデータベースにおけるCovid-19の標的特異性およびマルチターゲット有機化合物のダブルスコアリングアプローチによる探索）
著者：Natarajan Arul Murugan ら
日時：2020 Nov 5.
解説記事：
参考：
https://go.drugbank.com/covid-19
他にもできることがあるようだが，それはまた後日扱う。
本記事のもくじはこちら：
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