書記のBio/Chem-Info日誌#12 パスウェイのデータベースを閲覧する(Reactome，KEGG PATHWAY)
Reactome
Reactomeは，ヒトをはじめとしたパスウェイのデータベースである。
Pathway Browserを開く。
ここではTRPV1に関するシグナルを見てみる。
青い四角をクリックすると，受容体の情報が列挙される。
白の丸と四角は，受容体によりカルシウムイオンが透過する関係を示している。
白い矢印の元を辿ると，RIPK1やRIPK3などがシグナル制御に関与していることが示されていることがわかる。
KEGG PATHWAY
今回はTRPV1に関連するパスウェイを検索する。
そのうちの1つである炎症系のシグナルについて。赤いところがTRPV1である。
左側では，様々な因子がカルシウム流入に関与していることがわかる。
右側には，TRPのファミリーにおける温度依存性について，リガンドと共にまとめられている。
別の生物種におけるパスウェイも確認できる。
少し探してみると，味覚についてのまとめがあった。
このような感じで，まずは既知の情報を収集するところから始めていく。
参考：
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