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NGSデータ解析用にubuntu20.04バージョンをベースに環境をセットアップしました。
備忘録として書いたものですが、同じような環境をセットアップする方の参考になれば幸いです。
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#pip3
pip3とcutadapt,HTseqのインストール
pip は、The Python Package Index に公開されているPythonパッケージのインストールなどを行うユーティリティ。
pipを使ってcutadapt,HTseqをインストールします。
(cutadapt,HTseqはpythonで書かれています)
ubuntuには最初からpythonがインストールされているので、
バージョンを確認します。
python3 --versio