マガジンのカバー画像

ubuntu 20.04 解析用PC セットアップ(備忘録)

9
NGSデータ解析用にubuntu20.04バージョンをベースに環境をセットアップしました。 備忘録として書いたものですが、同じような環境をセットアップする方の参考になれば幸いです。
運営しているクリエイター

#HTseq

pip3とcutadapt,HTseqのインストール

pip3とcutadapt,HTseqのインストール

pip は、The Python Package Index に公開されているPythonパッケージのインストールなどを行うユーティリティ。
pipを使ってcutadapt,HTseqをインストールします。
(cutadapt,HTseqはpythonで書かれています)
ubuntuには最初からpythonがインストールされているので、
バージョンを確認します。

python3 --versio

もっとみる