PubMedのフレーズインデックスとATMには要注意
Tip #24: PubMed’s Phrase Indexのブログをご紹介させていただきます。(時間の都合上途中まで)
フレーズで検索したい時は""引用符で囲む
PubMed含め,キーワードで検索するときに単語をひとかたまりフレーズで検索したい時には""引用符で囲みます。
囲まなくても,PubMedではATMが働き,subject translation tableにある用語はフレーズと認識され,さらにMeSHへの変換も追加された検索が行われます。
例)[fever of unknown origin]と入力して検索
History and Search Detailsの画面で実際に行われた検索を確認すると,"fever of unknown origin"はMeSH用語にあったので,"fever of unknown origin"[MeSH Tearms]というMeSHの検索が追加され,"fever","unknown" ,"origin"それぞれをどこかに含む文献集合,"fever of unknown origin"というフレーズをどこかに含む文献集合の検索が行われています。
このATM機能を回避したいときには3つの方法があります。
1.""フレーズ検索(""引用符で囲む)をする
2. field tagをつけて検索する
3. -(ハイフン)でつなぐ
1.""フレーズ検索(""引用符で囲む)をする
ダブルクォテーションで囲んで検索をします"kidney allograft"
ただし(囲んだフレーズが)PubMedのフレーズインデックスに見つからない場合,引用符は無視されてATMが働いた検索処理が行われます
2. field tagをつけて検索する
kidney allograft[tw]などのように検索フィールドを指定した検索をします
Text Words [tw]を指定した場合,タイトル,抄録,その他の抄録,MeSH用語,MeSH Subheadings,publication type,物質名,主題としての個人名,企業著者,二次資料,コメント/修正メモ,その他の用語(上記のその他の用語[OT]を参照)のすべての単語と数字を含む。通常,NLM以外の組織によって割り当てられたNASA宇宙飛行ミッションを含むMeSH以外の主題用語(キーワード)が検索対象になります
ただしフレーズインデックスに見つからない場合,1番目同様タグは無視されてATMが働いた検索処理が行われます
「psittacine flight」はフレーズインデックスにないため,"psittacine" と"flight"に分割され,("psittaciformes"[MeSH Terms] OR "psittaciformes"[All Fields] OR "psittacine"[All Fields] OR "psittacines"[All Fields]) AND "flight"[Text Word]の検索が実際には行われています
3.-(ハイフン)でつなぐ
単語を-(ハイフン)でつなぎます kidney-allograft
この時,キーワードがフレーズインデックスにない場合,0件になることに注意してください
検索用語をフレーズで入力した場合,(ATMは無効になり)PubMed は MeSH 用語とMeSH の階層構造でその用語の下位概念を含んだ検索は行いません。
例えば,"health planning" と入力すると,"Health Planning" を含む文献はヒットしますが(MeSHとしての"Health Planning"はヒットしますが)より具体的な用語(MeSHの下位語),例えば Health Care Rationing, Health Care Reform, Health Plan Implementation は含まれません。これらは MeSH の自動マッピングが働いた際には含まれます。
フレーズをダブルクオートで囲むか,オートタームマッピングを使用するか迷った場合は,ダブルクオートを使用する方法と使用しない方法の両方で検索を行い,検索の詳細と結果を確認して,目的のレベルの包括性と特異性が得られるのはどちらかを判断してください。また,ダブルクォートなしで検索を開始し,結果が広すぎる場合はダブルクォートを追加してください。
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