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バイオインフォマティクスまとめ

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バイオインフォマティクスに関する覚書
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#バイオインフォマティクス

Qiime2を使った微生物叢の解析(その6)

サンプル中で観察されたOTUsの数 (qiime2-2018.2) nedonoiMac:20180112 shigeru$ qiime diver…

Qiime2を使った微生物叢の解析(その5)

Taxonomy解析 ここでは、silva-119-99-515-806-nb-classifier.qzaに対してTaxonomy解析を行う…

Qiime2を使った微生物叢の解析(その4)

α、ß多様性解析結果の可視化 (qiime2-2018.2) nedonoiMac:20180112 shigeru$ qiime diversi…

Qiime2を使った微生物叢の解析(その3)

アライメントして系統樹を作成 (qiime2-2018.2) nedonoiMac:20180112 shigeru$ qiime alignme…

Qiime2を使った微生物叢の解析(その2)

プライマー配列とシーケンスの綺麗に読めていない3'側の配列をトリムして結合し、キメラのチェ…

Qiime2を使った微生物叢の解析(その1)

1. manifestとmetadataファイルを準備します。 シーケンスしたサンプルに関する情報について…