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2022年2月の記事一覧
Funnel Metadynamics
Funnel metadynamicsは2分子間の結合自由エネルギーを定量的に求めることを目的に提案された分子シミュレーション手法の一種です。言葉通りFunnel型のrestraint potentialでサンプリング領域を制限したmetadynamicsを実行します。restraint potentialはサンプリング領域を制限する以外にも結合定数に関して具体的に計算可能な表式を得る意味合いもあ
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