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分子動力学シミュレーション

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2021年9月の記事一覧

軌道アンサンブル平均からのクルックスの揺動定理の導出

生体分子シミュレーションの主題の1つとして高精度な自由エネルギー計算が挙げられます。分子シミュレーションによる自由エネルギー計算は,2つの要素「サンプリング手法」及び「サンプリングデータからの自由エネルギー値の予測」から構成されます。この「サンプリングデータからの自由エネルギー値の予測」する手法の1つであるベネット受容比法(Bennett acceptance ratio method)は多くの市

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