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nori
2021年3月10日 21:24
生体分子シミュレーションでは,ほとんどの場合,Amber系統もしくはそれと同等な関数形が原子間相互作用を表現するために使用されます(関数と関数内で使用されるパラメータはまとめて力場関数と称されます)。①式の最後はクーロン相互作用項であり,原子間距離に反比例します。このクーロン相互作用を如何に精度を落とさずに効率的に計算するかがシミュレーション上の大きな課題の一つになります。Gromacs,