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分子動力学シミュレーション

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2020年12月の記事一覧

Umbrella SamplingとWeighted Histogram Analysis Method

Umbrella Samplingは,反応座標のある点にピン止めされるようなポテンシャル(umbrella potential)を反応座標軸に沿って複数用意し,反応座標軸周辺を重点的にサンプリングする手法です。Umbrella Samplingで得られたサンプリングデータはUmbrella Potential込みの状態ですが,興味があるのはUmbrella Potentialがない状態での自由エネ

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