健康な第一近親者における腸内細菌叢の構成は将来のクローン病発症と関連する

健康な第一近親者における腸内細菌叢の構成は将来のクローン病発症と関連する

https://www.gastrojournal.org/article/S0016-5085(23)00805-3/fulltext

ホアン・アントニオ・レイゴサ・ガレイ ＊＊＊＊＊＊＊（英語名：Juan Antonio Raygoza Garay
ウィリアムズ・ターピン（Williams Turpin
李善浩（Sun-Ho Lee） ∗
ウェイ・シュウ
CCC GEMプロジェクト研究コンソーシアム
ケネス・クロイトゥル
すべての著者を表示する

脚注を表示する
Published:May 30, 2023DOI:https://doi.org/10.1053/j.gastro.2023.05.032
PlumX メトリクス
この論文はPDFのみです。読むには、こちらからダウンロードしてください。
要旨
背景と目的
クローン病（CD）の原因は不明であるが、現在の仮説では、微生物や環境要因が遺伝的に影響を受けやすい人の腸の炎症を誘発し、慢性的な腸の炎症につながると考えられている。CD患者を対象としたケースコントロール研究では、腸内細菌叢組成の変化がカタログ化されている。しかし、これらの研究では、腸内細菌叢組成の変化がCDの発症と関連しているのか、炎症や薬剤治療の結果であるのかを区別することはできない。
研究方法
この前向きコホート研究では、CD患者の健康な第一度近親者（FDR）3483人を集め、CD発症に先行する腸内細菌叢組成を特定し、この組成がCD発症リスクをどの程度予測するのかを明らかにした。腸内細菌叢組成の解析（16S rDNAシーケンスに基づく）に機械学習アプローチを適用し、将来のCD発症と関連する微生物シグネチャーを定義した。このモデルの性能は、独立した検証コホートで評価されました。
結果
検証コホートにおいて、マイクロバイオームリスクスコア（MRS）モデルは、発見コホートのMRSの中央値を閾値として、ハザード比（HR）2.24、95％CI [1.03, 4.84] およびp値=0.04をもたらした。MRSは、発症の5年前までにCDを発症した個体を捕捉し、時間的妥当性を示した（AUC > 0.65）。MRSに寄与した最も重要な5つの分類群は、Ruminococcus torques、Blautia、Colidextribacter、Oscillospiraceaceの未培養の属レベルのグループ、Roseburiaだった。
結論
本研究は、腸内細菌叢の構成が将来のCD発症と関連することを初めて示したものであり、腸内細菌叢がCDの発症に寄与していることを示唆するものである。
キーワード
マイクロビオーム
糞便性細菌（Faecalibacterium
糞便カルプロテクチン
ビタミンB
前臨床炎症性腸疾患
この記事の全文を読むには、お支払いが必要です。
AGAメンバーログイン
AGAのユーザー名とパスワードでログインしてください。
1回限りのアクセス価格情報
購読する
胃腸科の購読を申し込む
ワンタイムアクセスを購入する
アカデミック＆パーソナル: 24時間オンラインアクセス
企業のR&Dプロフェッショナル：24時間オンラインアクセス
すでに印刷物を購読されている方 オンラインアクセスを申し込む
すでにオンライン購読をされている方 サインイン
登録する アカウントを作成する
機関投資家向けアクセス ScienceDirectにサインインする
記事情報
出版履歴
受理された： 2023年5月8日
改訂版受理 2023年5月1日
受理された： 2023年3月16日
出版段階
インプレスジャーナル プレプルーフ
脚注
Ken Croitoru： 執筆-校閲・編集、執筆-原案、監修、リソース、プロジェクト管理、資金獲得。Baruch Yerushalmi： リソース ダン・ターナー 執筆-校閲・編集、資源、概念化。ウェイ・シュー（Wei Xu）： 執筆-校閲・編集、監修、方法論、概念化。アンドリュー・D・パターソン 執筆-原案、監修、方法論、概念化。マーク・ロペレスキー リソース、概念化。レモ・パナンシオンヌ Remo Panancionne: 執筆 - レビューと編集, リソース, コンセプチャライゼーション. Iris Dotan（アイリス・ドタン）： リソース。A. ヒラリー・スタインハート リソース、コンセプチャライゼーション マーク・S・シルバーバーグ 概念化。イリット・ア・バイロン リソース チャールズ・N・バーンスタイン リソース、コンセプチャライゼーション。コレット・デスランドル リソース マリア・チーノ リソース Osvaldo Espin-Garcia：執筆 - 査読と編集、方法論、形式的分析。Paul Moayyedi: 執筆 - レビューと編集、リソース、調査、概念化。Guy L aumais： リソース、概念化 マリア・アブレウ ライティング - レビューと編集、リソース。Anne M Griffiths： 執筆-校閲・編集、資源、方法論、概念化。ジョン・K・マーシャル 執筆-校閲・編集、リソース、概念化。デビッド・R・マック 執筆-校閲・編集、資源、概念化。アンソニー・オトリー 執筆-校閲・編集、資源、概念化。レビナス・A・ディールマン 概念化 Hien Huynh： 概念化。ケヴァン・ジェイコブソン リソース、コンセプチャライゼーション ジェフリー・S・ハイアムズ 概念化 ワエル・エル・マタリー リソース、概念化。Ashleigh Goethel: 原稿執筆、プロジェクト管理。ミシェル・アイ・スミス リソース、プロジェクト管理。David S Guttman: 方法論、概念化。ブライアン・フィーガン（Brian Feagan）： 概念化。フアン・アントニオ・レイゴサ・ガレイ： 執筆-校閲・編集、執筆-原案、視覚化、方法論、形式的分析、概念化。李善浩：執筆-校閲・編集、執筆-原案、視覚化、検証、方法論、調査、形式的分析、概念化。ウイリアムズ・ターピン 執筆-校閲・編集、執筆-原案、可視化、監修、方法論、調査、形式的分析、概念化。
利益相反の声明
すべての著者は、原稿に関連する潜在的な利益相反（金銭的、職業的、個人的なもの）がないことを公表している。
著者の貢献
概念化： Juan Antonio Raygoza Garay (Lead), Williams Turpin (Lead), Sun-Ho Lee (Lead), Anne M. Griffiths (Equal), Paul Moayyedi (equal), Maria Abreu (equal), Guy L. Aumais (equal), Charles N. Bernstein (equal), Maria Cino (equal), Wael El-Matary (equal), Brian Feagan (equals), David S. Guttman (equals), Hien Huynh (equal), Levinus A. Dieleman（同等）、Jeffrey S. Hyams（同等）、Kevan Jacobson（同等）、David Mack（同等）、John K. Marshall（同等）、Anthony Otley（同等）、Remo Panaccione（同等）、Mark Ropeleski（同等）、Mark S. Silverberg（同等）、 A. Hillary Steinhart（同等）、Dan Turner（同等）、Wei Xu（リード）、Kenneth Croitoru（リード）
データキュレーション Juan Antonio Raygoza Garay (Lead)、Williams Turpin (Equal)、Sun-Ho Lee (Equal)
形式的な分析： Juan Antonio Raygoza Garay (Lead)、Williams Turpin (supporting)、Sun-Ho Lee (Lead)。
資金調達の獲得 Kenneth Croitoru (リード)
調査 Williams Turpin（同等）、Sun-Ho Lee（同等）、Kenneth Croitoru（リード）
方法論 Juan Antonio Raygoza Garay (Lead)、Williams Turpin (Equal)、Sun-Ho Lee (Equal)、Osvaldo Espin-Garcia（Equal）、David S. Guttman (supporting), Andrew D. Paterson (equal), Wei Xu (Lead)、 Kenneth Croitoru (Lead)
プロジェクト管理 ウィリアムズ・ターピン（同等）、ミシェル・I．Smith（サポート）、Ashleigh Goethel（サポート）、Kenneth Croitoru（Lead）。
リソース Anne M. Griffiths (Lead), Paul Moayyedi (equal), Maria Abreu (equal), Guy L. Aumais (equal), Charles N. Bernstein (equal), Irit A. Biron (supporting), Colette Deslandres (supporting), Iris Dotan (supporting), Wael El-Matary (equal), Kevan Jacobson (equal), David Mack (equal), John K. Marshall（同等）、Anthony Otley（同等）、Remo Panaccione（同等）、Mark Ropeleski（同等）、A. Hillary Steinhart（同等）、Dan Turner（同等）、Baruch Yerushalmi（同等）、Kenneth Croitoru（リード）。
ソフトウェア NA
スーパーバイザー Williams Turpin（同等）、Andrew D. Paterson（同等）、Wei Xu（リード）、Kenneth Croitoru（リード）
バリデーション Sun-Ho Lee (同等), Osvaldo Espin-Garcia (同等)
可視化 Juan Antonio Raygoza Garay (Lead)、Williams Turpin (supporting)、Sun-Ho Lee (equal)。
ライティング - 原案 Juan Antonio Raygoza Garay (Lead), Williams Turpin (equal), Sun-Ho Lee (equal), Ashleigh Goethel (supporting), Andrew D. Paterson (supporting), Kenneth Croitoru (Lead)
ライティング-レビュー＆エディティング Juan Antonio Raygoza Garay (Lead), Williams Turpin (Lead), Sun-Ho Lee (Lead), Anne M. Griffiths (supporting), Osvaldo Espin-Garcia (equal), Charles N. Bernstein (equal), David Mack (supporting), John K. Marshall (supporting), Anthony Otley (supporting), Remo Panaccione (support), Dan Turner (supporting), Wei Xu (support), Kenneth Croitoru (Lead)
その他 NA
データの利用可能性に関する声明
生データおよび解析済みデータのリクエストは、http://www.gemproject.ca/data-access/ に記載されている指示に従ってください。生マイクロバイオームデータは、Accessionの下で一般に公開されています： PRJNA685746で公開されています。すべての提出物はGEMプロジェクト運営委員会によって審査され、要求されたサンプル/データが、GEMプロジェクト研究デザインに従ったネステッドコホートのGEMプロジェクトの意図する分析に何ら支障をきたさないこと、およびすでに進行中の分析と重複しないことが確認されます。この評価を満たした提案は、GEMプロジェクト運営委員会（GPSC）の全メンバーに配布され、レビューと公開討論が行われる予定です。この審査では、提案のグローバルな科学的メリットに焦点を当てます。この審査では、基本的な科学的メリット、要求されたサンプルやデータの入手可能性を評価し、GEMプロジェクトの本来の意図に妥協がないことを確認します。運営委員会のメンバーで、申請書のスポンサーになってくれる人に連絡を取ることは価値があることです。GPSCで過半数の承認を得たプロジェクトには、独立した査読プロセスを適用する助成機関から申請者が資金を得た時点で、要求されたサンプルやデータが申請者に提供されることを明記したサポートレターをGEMプロジェクトが提供することが知らされます。すべての提出物の審査に使用される基準には、提案の「科学的妥当性」と、要求された生物材料の入手可能性の判断が含まれます。資金提供機関に要求する予算は、サンプルの処理またはデータベースの適切なクエリーの設定にかかる費用を考慮しなければならない。この意図は、申請者が資金提供の機会への提出を検討するための十分な時間を確保することである。
なお、マイクロバイオームに基づくリスクスコアのソースコードファイルは、以下のリンクにあります： https://github.com/raygozag/GEM-microbiome-gastroenterology-paper
助成金の支援
本研究は、Crohn's and Colitis Canada Grant #CCC -GEMIII, Canadian Institutes of Health Research (CIHR) Grant #CMF108031 and the Helmsley Charitable Trustからの助成金により行われました。Williams Turpinは、CIHR Fellowship/ Canadian Association of Gastroenterology (CAG) / Ferring Pharmaceuticals Inc.からPostdoctoral Fellowship Research Awardを受けたことがあります。Sun Ho Leeは、Imagine/CIHR/CAG Fellowship Awardの元受賞者です。Williams Turpin、Sun-Ho Lee、Juan Antonio Raygoza Garayは、トロントのマウントサイナイ病院医学部からフェローシップを授与されています。Kenneth Croitoruは、炎症性腸疾患におけるカナダ研究チェアの受賞者である。
概要
腸内細菌叢の組成、機能、便の代謝産物は、CD患者の健康なFDRのコホートにおいて、CDを発症しやすい人を特定できる。
知っておくべきこと
背景と文脈
CDの症例対照研究では、腸内細菌叢の組成の変化が将来のCDの発症に関連するのか、あるいは炎症の結果なのかを区別することができない。
新しい知見
本研究では、CDの将来の発症に関連する前臨床腸内細菌叢のシグネチャーを特定し、微生物叢が病因に関与していることを示唆している。
制限事項
検証コホートでは、CD発症を予測するマイクロバイオームリスクスコアの予測性能は、C-indexが0.67と控えめであった。しかし、マイクロバイオームの予測値は、他の機械学習アルゴリズムを用いて再現された。
臨床研究上の関連性
本研究は、マイクロバイオームリスクスコアが、微生物のアンバランスを修正することを目的とした介入から恩恵を受け、おそらくCDの発症リスクを低減させるであろう健康なアトリスク者を層別化する可能性を提供することを示唆しています。
基礎研究との関連性
本研究は、腸内細菌叢がCDの病因に寄与する可能性があることを示唆している。また、個人の分類群ではなく、微生物群集がCDのリスクと関連していることを明らかにした。
アイデンティフィケーション
DOI: https://doi.org/10.1053/j.gastro.2023.05.032
著作権について
© 2023 AGAインスティテュートによる
サイエンスダイレクト
ScienceDirectでこの論文にアクセスする
関連記事
ホーム
論文・号外
現在の課題
号外一覧
特別号
プレスリリース
付録
マルチメディア
動画
DDWアブストラクト
CME
著者向け
抄録作成・索引作成
CONSORTチェックリスト
カバーアートの提出
図に関するFAQ
グラフィカルアブストラクト
著者向け説明書
メディカルイラストレーションFAQ
研究者アカデミー
国際的な著者のためのリソース
ソーシャルメディア
スタイルガイド
原稿を投稿する
ジャーナルインフォメーション
Gastroenterologyについて
編集委員会
連絡先
アクセス
編集委員会
編集スタッフ
ガストロダイジェスト寄稿者の利益相反について
広告主様向け情報
再利用の許可
取材禁止
新着情報
購読申し込み
AGA
AGAホーム
AGAモバイル
AGAに参加する
COVID-19
上部消化管がん
AGAクリニカルガイダンス
機能性腸疾患
肝細胞癌（Hepatocellular Carcinoma
インパクトのある基礎研究
インパクトのある臨床研究
IBD
全コレクション
フォローする
ユーチューブ
ツイッター
フェイスブック
本サイトのコンテンツは、医療従事者向けです。
当社は、サービスの提供・向上やコンテンツのカスタマイズに役立てるため、クッキーを使用しています。クッキーの設定を更新するには、本サイトのクッキー設定にアクセスしてください。
著作権 © 2023 Elsevier Inc.ただし、第三者から提供された一部のコンテンツは除きます。

プライバシーポリシー

ご利用条件

アクセシビリティ

ヘルプ＆コンタクト