フィンランドの大規模縦断的乳児コホートにおける腸内細菌叢の変動源


フィンランドの大規模縦断的乳児コホートにおける腸内細菌叢の変動源

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37399600/

Roosa Jokela et al. 2023.
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要旨
背景 乳児の腸内細菌叢は広く研究されているが、技術的変数を含む細菌叢決定因子に関する包括的評価は大規模な乳児コホートでは行われていない。
方法 フィンランドのHELMi出生コホートにおいて、生後3週から2年まで縦断的にサンプリングした乳児の16S rRNA遺伝子アンプリコンベースの腸内細菌叢プロファイルに対する109の変数の影響を調べた。家族内解析のために両親のスポット糞便サンプルが含まれ、Bray-Curtis距離の並べ替え多変量解析を用いてβ多様性パターンを評価した985家族から合計7657サンプルが得られた。また、異なる分類学的レベルと距離法の効果も評価した。
結果 時点特異的モデルでは、DNA抽出バッチ、分娩様式と関連する周産期曝露、排便頻度、パリティ/兄弟姉妹の順に、最大2~6%の変動が説明された。乳児の消化管機能を記述する変数は、最初の2年間は継続的に重要であり、哺乳習慣などの変化を反映していた。分娩形態と分娩時抗生物質への曝露が、乳児の微生物叢に及ぼす分娩/きょうだいの影響は、乳児の微生物叢研究に関連する周産期因子の緊密な相互連関を例証するものであった。合計すると、乳児の腸内細菌叢の生物学的変動の最大19%を説明することができた。我々の結果は、分散分割の結果を各コホートの特徴や微生物叢処理の文脈で解釈する必要性を強調している。
解釈 本研究は、均質なコホートにおける生後2年間の乳児腸内細菌叢組成に関連する主要因の包括的な報告を提供するものである。本研究は、今後考えられる重要な研究領域と考慮すべき交絡因子を明らかにした。
資金提供 本研究は、ビジネスフィンランド、フィンランドアカデミー、栄養研究財団、ヘルシンキ大学微生物学・バイオテクノロジー博士課程(フィンランド)より助成を受けた。
キーワード 出生コホート;乳児腸内細菌叢;分娩率;便の一貫性;技術的交絡因子;分散分割。
著作権 © 2023 The Author(s). Elsevier B.V.発行。無断複写・転載を禁じます。
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