比較メタゲノム解析により、ヒト科動物における腸内細菌叢の宿主特異的な機能適応が明らかになった

比較メタゲノム解析により、ヒト科動物における腸内細菌叢の宿主特異的な機能適応が明らかになった

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doi: https://doi.org/10.1101/2023.03.01.530589
この記事はプレプリントであり、査読の認定を受けていません[これはどういう意味ですか?］
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AbstractInfo/HistoryMetrics プレビュー PDF
要約
多様な環境と宿主種におけるヒトの腸内細菌叢の組成と機能の軌跡を明らかにすることは、宿主の進化と健康に影響を及ぼす可能性のある、ヒトの微生物叢の特異的な特性を明らかにするのに役立つ可能性がある。ショットガン・メタゲノム解析により、アフリカとヨーロッパから採取したヒトのサンプルとともに、2種のゴリラ亜種（Gorilla gorilla, Gorilla beringei beringei）、3種のチンパンジー亜種（Pan troglodytes verus, P.t. troglodytes, P.t. schweinfurthii）およびボノボ（Pan paniscus）の野生生活するヒトの腸内細菌叢における分類学的多様性および機能の変化を調査しました。その結果、宿主の系統と一致する微生物の分類学的・機能的適応を、群集と微生物のゲノムレベルの両方で確認することができました。これらの適応には、繰り返される水平方向の遺伝子移動と遺伝子喪失が関与していることを示すことができた。我々は、これらの適応過程とマイクロバイオームの変化が、ヒスチジン代謝の変化による2型糖尿病や、好気的条件への微生物の適応による炎症性腸疾患などの慢性炎症性疾患を宿主にもたらすと仮定している。さらに、我々は、特にヨーロッパ人集団において、ヒトの微生物叢の多様性と進化的に保存されたクレードが広く失われていることを示唆する複数の証拠を見いだした。最後に、宿主と微生物の共分化を示すパターンが、特に細菌科のDialisteraceaeで観察されたが、全体として、ヒトでは共系統のパターンがしばしば崩れていることが分かった。

利害関係者声明
著者らは、競合する利害関係を表明していない。

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2023年3月2日に掲載されました。
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