ヒト便からの食事摂取のメタゲノム推定
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ヒト便からの食事摂取のメタゲノム推定
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.02.578701v1
ORCIDプロフィールを見るChristian Diener, ORCIDプロフィールを見るSean M Gibbons
doi: https://doi.org/10.1101/2024.02.02.578701
この論文はプレプリントであり、査読認証を受けていません。
00010042
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要旨
食事摂取量は、腸内細菌叢の組成、ヒトの代謝、およびほぼすべての主要な慢性疾患の発症率と密接に関連している。食事と栄養素の摂取量は通常、食事に関するアンケートを用いて定量化されるが、このアンケートは大まかな食品カテゴリーに焦点を当てる傾向があり、自己申告バイアスに悩まされ、研究参加者の強いコンプライアンスを必要とする。ここでは、MEDI（Metagenomic Estimation of Dietary Intake）：便メタゲノム中の食物由来DNAを用いて食事摂取量を定量化する方法を紹介する。メタゲノミックショットガンシーケンスデータにおいて、存在量が少ない場合（10リード以上）でも食品を正確に検出できることを示す。さらに、特定の生物からのDNAの存在量という観点から、食事摂取を栄養摂取の詳細な代謝表現に変換できることを示す。MEDIは乳幼児における固形食摂取の開始を特定することができ、成人集団における食事アンケートの回答を正確に予測した。さらに、大規模な臨床コホートにおいてメタボリックシンドロームと関連する特定の食事の特徴を同定することができ、アンケートを必要とせずに個人固有の食事パターンを詳細に定量化する概念実証を提供した。
競合利益声明
著者らは競合する利益はないと宣言している。
著作権 本プレプリントの著作権者は著者/資金提供者であり、bioRxivに本プレプリントを永続的に表示するライセンスを許諾している。CC-BY-NC 4.0国際ライセンスの下で利用可能です。
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2024年2月6日掲載
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