抗生物質耐性病原体から身を守る腸内細菌叢の細菌を特定


2023年2月20日

抗生物質耐性病原体から身を守る腸内細菌叢の細菌を特定

https://phys.org/news/2023-02-intestinal-microbiota-bacteria-antibiotic-resistant-pathogens.html

バレンシア地方健康・生物医学研究振興財団(FISABIO)

抗生物質の種類によって、腸内細菌叢の状態やバンコマイシン耐性腸球菌(VRE)に対する感受性のグレードが異なる。マウスを異なるスペクトルの抗生物質(すなわち、シプロフロキサシン、ネオマイシン、セフトリアキソン、アンピシリン、クリンダマイシンまたはバンコマイシン)で7日間処理した。その後、あるマウス群には106個のVRE colony forming units(CFU)を経口投与し、別のマウス群にはVRE接種前に2週間回復させた。VRE接種直前に糞便を採取して微生物叢を解析し、VRE接種2日後に糞便を採取してVRE濃度を測定した。対照として、無処理マウスの糞便サンプルを採取し、微生物叢解析とVRE定量を行った。 b マウスから採取した糞便サンプルに含まれるOTUの相対量を用いて得られたBray-Curtis距離に基づくNMDS(Non-metric Multidimensional Scaling)解析。各ポイントはマウス1匹の微生物叢を表す。c 採取した糞便サンプルで同定された最も豊富な上位100のOTUの存在量を示すヒートマップである。無処置(NT)、Ciprofloxacin(Cip)、Neomycin(Neo)、Ceftriaxone(Cef)、Ampicillin(Amp)、Clindamycin(Clin)、Bangomycin(Van)、Proteo(Proteobacteria)。OTUの分類およびOTUの存在量の統計解析は補足データファイル2に記載した。LOD = 検出限界。LOD以下の点は、VREのCFUを検出できなかったマウスを示す。*p < 0.05, **p < 0.01, ns - 無意, 両側Wilcoxon rank-sum test. 回復期間なしのセフトリアキソンを除き、各処理につきN=5匹のマウスを用い、N=3匹のマウスを用いた。パネル(d)に示す統計結果は、上方:マウスの各処理群と未処理群との比較、下方:特定の抗生物質で処理したマウスの各群(回復期間の前と後)との比較に言及するものである。(d)では、25%から75%までのボックスが広がっている。ボックス内の線は中央値を表す。ひげは最大値と最小値を示す。ソースデータはSource Dataファイルとして提供される。出典:Nature Communications (2022). DOI: 10.1038/s41467-022-35380-5
Conselleria de Sanitat Universal i Salut Públicaの機関であるFoundation for the Promotion of Health and Biomedical Research of Valencia Region(Fisabio)の「微生物叢、感染、炎症」研究グループによる研究により、腸内細菌叢の5菌種が複数の抗生物質に耐性を持つ菌のコロニー形成を制限する能力が確認されました。

Carles Úbeda博士が主導し、Nature Communicationsに掲載されたこの研究は、動物モデルにおいて、腸内細菌叢にもともと存在するAlistipes、Barnesiella、Olsenella、Oscillibacter、Flavonifractor属の細菌菌株のコンソーシアムが、腸球菌属細菌の増殖に必要な栄養分を除去することを明らかにしたものです。特に、抗生物質に対して多剤耐性であるこれらの病原菌は、食事によく含まれる果糖という糖の一種が失われることで影響を受ける。

このように、病原体が遭遇する栄養不足は、彼らの最適な成長を妨げ、結果として感染から体を守ることになるのです。「マウスを用いたモデルで、これらの常在菌を投与すると、感染症の発症や患者間の伝播に重要なステップである腸内への病原体の定着能力が低下することを示しました」とウベダ博士は説明しました。

この種の病原菌は、世界中の入院患者における感染症の原因として3番目と4番目に多く、現在使用されているほとんどの抗生物質に対して耐性があるため、治療を困難にし、致死的な結果を引き起こす可能性があります。このため、世界保健機関(WHO)によると、新しい治療法を開発しなければならない最優先の多剤耐性病原体の一つとなっています。

今回、ゲノム・健康領域の研究グループは、細菌のDNAやRNAの大量塩基配列解析(メタゲノム)、消化管内に存在する代謝産物と呼ばれる物質の分析(メタボローム)という新しい技術を応用して研究を実施しました。

この研究は、この多重耐性菌による感染症を予防するための、抗生物質を使わない新たな戦略につながる可能性があります。"抗生物質耐性は、今日の社会が直面している最も重要な公衆衛生問題の一つであるため、これは重要な発見です。"と研究者は結論付けています。

詳細はこちら Sandrine Isaac et al, Microbiome-mediated fructose depletion restricts murine gut colonization by vancomycin-resistant Enterococcus, Nature Communications (2022). DOI: 10.1038/s41467-022-35380-5

ジャーナル情報です。ネイチャーコミュニケーションズ

提供:バレンシア地方健康・生物医学研究振興財団(FISABIO)

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病院患者における隠れ菌は抗菌薬耐性の大きなリスクとなる
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