抗生物質投与がマウスの糞便中ウイルス群集に及ぼす影響

抗生物質投与がマウスの糞便中ウイルス群集に及ぼす影響
Jacqueline Moltzau Anderson, Tim Lachnit, Simone Lipinski, Maren Falk-Paulsen, Philip Rosenstiel オーサーノート
G3 Genes|Genomes|Genetics, jkac293, https://doi.org/10.1093/g3journal/jkac293
掲載：2022年11月22日 記事履歴
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要旨
ウイルスおよびバクテリオファージは、腸管バリア機能および常在細菌群の構成と機能特性に強い影響を及ぼす。糞便中のウイルス群の変動は、炎症性腸疾患（IBD）を含むヒトの疾患に関与している可能性がある。NOD2遺伝子の機能欠損変異は、ヒトの慢性炎症性腸疾患（IBD）のサブタイプであるクローン病の発症リスク上昇と関連しており、そこでも糞便中のウイルス群集の特異的変化が報告されている。腸管ウイルスの動態に関する理解を深めるため、野生型（WT）C57BL/6Jマウスと核酸結合オリゴマー化ドメイン含有タンパク質2ノックアウト（NOD2 KO）マウスの糞便サンプルについて、抗生物質による擾乱に対するウイルス群の縦断的特徴を明らかにした。ウイルス様粒子（VLP）の配列決定により、真核生物ウイルスとバクテリオファージからなるマウス糞便ウイルス群の高い多様性と個体間の高い変動が示された。抗生物質は糞便中のウイルス群に大きな影響を与えた。ウイルス群集の組成は，遺伝子型に関係なく観察期間（抗生物質投与停止後10週間）中に部分的にしか回復しなかった．しかし、ウイルスとバクテリオームの組成のシフトは高い相関があり、特定のファージの喪失が細菌群集組成の長期的な調節異常に寄与している可能性が示唆された。このことから、糞便中のビロームに対する治療的干渉は、微生物叢を標的とした治療法における新たなアプローチとなる可能性があることが示唆された。

ビローム、腸内バクテリオファージ、抗生物質擾乱、NOD2、レジリエンス