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糞便代謝物プロファイリングにより術後感染リスクのある肝移植レシピエントを同定

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臨床・トランスレーショナルレポート|オンライン版
糞便代謝物プロファイリングにより術後感染リスクのある肝移植レシピエントを同定

https://www.cell.com/cell-host-microbe/fulltext/S1931-3128(23)00465-1?dgcid=raven_jbs_aip_email



クリストファー・J・レーマン 11
ニコラス・P・ディラ
マシュー・オデンワルド
ジョン・ファン
タリア・B・ベイカー
アーロック・カチャ
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脚注を表示発行:2023年12月15日DOI:https://doi.org/10.1016/j.chom.2023.11.016

ハイライト

肝移植を受ける患者の2/3はマイクロバイオームの多様性が減少している

便中代謝産物レベルはマイクロバイオームの多様性および病原体密度と相関する

糞便メタボロームプロファイリングにより移植後感染リスクのある患者を特定できる

便中代謝産物濃度からマイクロバイオーム標的介入を導くことができる
概要
腸内細菌叢が産生する代謝産物は粘膜免疫防御を調節し、上皮バリア機能を最適化する。腸内細菌叢の多様性の喪失や抗生物質耐性病原体の拡大などの腸内細菌叢異常症は、糞便中代謝産物濃度の変化や全身性感染症の罹患率の上昇を伴う。しかしながら、腸内細菌叢異常症を定量化する検査は、まだ臨床に取り入れられていない。われわれは、肝移植(LT)を受けた107例の患者の糞便中代謝産物を定量化し、これらを糞便中マイクロバイオーム組成、病原体の拡大、および術後感染と相関させた。宿主を介する抗菌防御に微生物由来の代謝産物が関与していることを示唆する実験的研究と一致して、短鎖および分岐鎖脂肪酸、二次胆汁酸、トリプトファン代謝産物の糞便中濃度の低下は、LT患者におけるマイクロバイオームの組成異常および術後感染症の相対リスクと相関していた。我々の知見は、糞便代謝産物プロファイリングにより、術後感染リスクの高いLT患者を同定できること、およびマイクロバイオーム標的治療の道標を提供できる可能性があることを示している。
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参考文献
アルビロス A.
デ・ゴッタルディ A.
レスチーニョM.
肝疾患における腸肝軸:治療のための病態生理学的基盤。
J. Hepatol. 2020; 72: 558-577
論文で見る
スコープス (768)
パブコメ
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
クリス M.
ベルナ E.C.
ローゼン H.R.
ロズポーンC.A.
肝移植における機能的マイクロバイオミクス。
Transplantation. 2019; 103: 668-678
論文で見る
スコープス (20)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
マレー・K.F.
カリザーズR.L.
AASLD
AASLD診療ガイドライン:肝移植患者の評価。
Hepatology. 2005; 41: 1407-1432
論文で見る
スコープス (626)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
アンナバジャラ M.K.
ゴメス-シモンズA.
マセシックN.
サリバン S.B.
クレス A.
カーン S.D.
ギディンズ M.J.
スタンプ S.
キム G.I.
ナレイン R.
他。
多剤耐性菌のコロニー形成と肝移植後の腸内マイクロバイオームの縦断的進化。
Nat. Commun. 2019; 10: 4715
論文で見る
スコープス (52)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
マセシック N.
ゴメス-シモンズA.
サリバン S.B.
ギディンズ M.J.
ファーガソン S.A.
コラカビ G.
リーズ D.
パーク S.
シム K.
ソワシュ M.G.
他。
ゲノムサーベイランスにより明らかになった多剤耐性菌のコロニー形成と感染の多様性:肝移植レシピエントにおける前向きコホート研究。
Clin. Infect. Dis. 2018; 67: 905-912
論文で見る
スコープス (47)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
チェン D.
ディングルT.C.
ベルガ S.
カッバーニ D.
バンジ R.A.
ウォルター J.
アブラデス J.G.
Cervera C.
バンコマイシン耐性腸球菌の腸内コロニー形成と肝移植転帰との関連。
Transpl. Infect. Dis. 2022; 24: e13821
論文で見る
スコープス (4)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ペレイラ M.R.
スカリーB.F.
パウチS.M.
ウールマンA.C.
グーディ S.
エモン J.E.
ベルナ E.C.
肝移植レシピエントにおけるカルバペネム耐性Klebsiella pneumoniae感染症のリスク因子と転帰。
肝移植 2015; 21: 1511-1519
論文で見る
スコープス(68)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
オデンワルドM.A.
ロートH.F.
レティッカーA.
セゴビアM.
ピライA.
肝移植レシピエントの長期ケアにおける進化する課題。
Clin. Transplant. 2023; 37e15085
論文で見る
スコープス(1)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
スワルテ J.C.
Li Y.
Hu S.
ビョーク J.R.
ガセサ R.
ヴィッチ・ヴィラ A.V.
ドゥウェス R.M.
コリイ V.
クリルシコフ A.
ポストA.
他。
腸内細菌叢異常は固形臓器移植後の死亡率上昇と関連する。
Sci. Transl. Med. 2022; 14: eabn7566
論文で見る
スコープス (12)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
チャン Z.J.
レーマンC.J.
コールC.G.
パマー E.G.
マイクロバイオーム研究の臨床への応用。
Annu. Rev. Microbiol. 2022; 76: 435-460
論文で見る
スコープス (5)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
バフィーC.G.
ブッチV.
スタイン R.R.
マッケニー P.T.
リン L.
ゴボーン A.
リュー H.
キネブリュー M.
ヴィアレA.
et al.
胆汁酸を介したクロストリジウム・ディフィシルに対する抵抗性の回復。
Nature. 2015; 517: 205-208
論文で見る
スコープス (1238)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ペレド J.U.
ゴメスA.L.C.
デブリン S.M.
リットマン E.R.
タウル Y.
ソン A.D.
ウェーバー D.
橋本D.
スリンガーランド A.E.
スリンガーランドJ.B.
他。
同種造血細胞移植における死亡率予測因子としての微生物叢。
N. Engl. J. Med. 2020; 382: 822-834
論文で見る
スコープス (358)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
野村宗弘
長友良和
土井健司
清水淳
馬場和夫
齋藤知行
松本 聡
井上和彦
武藤正明
固形がん患者におけるニボルマブまたはペムブロリズマブ治療に対する臨床効果と腸内細菌叢の短鎖脂肪酸との関連。
JAMA Netw. Open. 2020; 3e202895
論文で見る
スコープス(165)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ゴパラクリシュナン V.
スペンサーC.N.
Nezi L.
ルーベン A.
アンドリュース M.C.
カルピネッツT.V.
プリエト P.A.
ビセンテ D.
ホフマン K.
ウェイ S.C.
et al.
腸内細菌叢はメラノーマ患者の抗PD-1免疫療法に対する反応を調節する。
Science. 2018; 359: 97-103
論文で見る
スコープス (2707)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
古沢由美子
小畑由美子
福田真一
遠藤利明
中藤剛志
高橋大輔
中西義人
植竹 C.
加藤和彦
加藤貴之

腸内細菌由来の酪酸は大腸制御性T細胞の分化を誘導する。
Nature. 2013; 504: 446-450
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Wang B.
Zhou Z.
Li L.
肝疾患におけるAHRシグナル伝達の腸内細菌叢制御。
Biomolecules. 2022; 12: 1244
論文で見る
スコパス (5)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
キネブリューM.A.
バフィーC.G.
ディールG.E.
ゼネヴィッチL.A.
ライナー I.
ホウル T.M.
フラベル R.A.
リットマン D.R.
パマー E.G.
細菌フラジェリンに応答した腸管CD103+CD11b+樹状細胞によるインターロイキン23産生は、粘膜自然免疫防御を増強する。
Immunity. 2012; 36: 276-287
論文で見る
スコパス (378)
PubMed
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全文
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グーグル奨学生
キャンベル C.
マッケニー P.T.
コンスタンチノフスキー D.
イサエバ O.I.
シザス M.
ヴェルター J.
マイ C.
ジン・W.B.
グオ C.J.
ヴィオランテ S.
他。
胆汁酸の細菌代謝は、末梢制御性T細胞の生成を促進する。
Nature. 2020; 581: 475-479
論文で見る
スコープス(360)
パブコメ
クロス
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ハング S.
Paik D.
ヤオ L.
キム E.
トリナス J.
ルー J.
ハ S.
ネルソン B.N.
ケリー S.P.
ウー L.
他。
胆汁酸代謝産物はTH17とTreg細胞の分化を制御する。
Nature. 2019; 576: 143-148
論文で見る
スコープス (564)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
アルパイアN.
キャンベルC.
ファンX.
ディキイ S.
ファン・デル・ヴィーケンJ.
デルース P.
リュー H.
クロス J.R.
フェファー K.
コファー P.J.

常在細菌が産生する代謝産物は、末梢制御性T細胞の生成を促進する。
Nature. 2013; 504: 451-455
論文で見る
スコパス(3006)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
オメネッティ S.
ピサロ T.T.
Treg/th17軸:腸内細菌叢によって制御される動的バランス。
フロント。Immunol. 2015; 6: 639
論文で見る
スコープス (329)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
チェン J.
ビテッタL.
病原体誘発性炎症亢進の抑制における酪酸の役割。
Immune Netw.
論文で見る
スコパス (70)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ハークB.W.
リットマンE.R.
ショバードJ.L.
ピカード A.J.
フォンタナ E.
アディ F.
ギャルツェン Y.
リン L.
モルジャリア S.M.
ペレド J.U.
et al.
酪酸産生微生物叢の腸内コロニー形成がallo-HCT後の呼吸器ウイルス感染に及ぼす影響。
Blood. 2018; 131: 2978-2986
論文で見る
PubMed
Google Scholar
スタッツ M.R.
ディラ N.P.
ピアソン S.D.
ルコント・オソリオP.
ナヤック R.
ハリド M.
アドラー E.
ボワシエール J.
リン H.
ライターW.
他。
COVID-19の呼吸不全患者において、免疫調節性の糞便代謝産物が死亡率と関連している。
Nat. Commun. 2022; 13: 6615
論文で見る
スコープス (15)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ハフナー J.J.
カテマウスワ M.
カゴーン T.S.
ホサイン E.
ヤコブソン D.
フローレス K.
パラブ A.R.
オブレゴン・ティト A.J.
ティト R.Y.
レイエス L.M.

産業化勾配を横断する非標的糞便メタボローム解析により、糞便微生物-メタボローム相互作用における産業化の共有代謝物および影響が明らかになった。
mSystems. 2022; 7: e0071022
論文で見る
日本学術振興会特別研究員 (0)
パブコメ
クロスフィルム
グーグル奨学生
シン L.M.
マンシャーマニ A.
ベアーD.J.
ノボトニーJ.A.
シャロン C.S.
カーン N.A.
Zhu R.
ホルシャーH.D.
健康成人の食物摂取量を予測するバイオマーカーとしての糞便代謝物。
J. 2023; 152: 2956-2965
論文で見る
スコパス (5)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ダス・ジェフェリー I.B.
A.
オヘリーE.
コフラン S.
シセック K.
ムーア M.
ブラッドリー F.
カーティ T.
プラダン M.
ドウィベディC.
他。
過敏性腸症候群および胆汁酸吸収不良の有無による糞便微生物群およびメタボロームの相違。
Gastroenterology. 2020; 158: 1016-1028.e8
論文で見る
スコープス(103)
パブコメ
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ケリー P.E.
ン H.J.
ファレル G.
マッカーディ S.
ラッセル R.K.
ハンセン R.
ラットレイ Z.
ジェラシミディス K.
ラットレイ N.J.W.
LC-MS分析のための最適化された単相糞便抽出法と消化器疾患におけるその応用。
Metabolites. 2022; 12: 1110
論文で見る
論文 (1)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
パパジヤンR.
フェルディヤンN.
スリニバサンK.
ゴンザレス C.
シャノンW.D.
ブラウント K.
フックスB.C.
クロストリジオイデスディフィシル(Clostridioides difficile)感染症の再発に対する、微生物叢に基づく生きたバイオセラピーの治験薬投与後のヒト糞便胆汁酸分析。
Microorganisms. 2023; 11: 135
論文で見る
スコパス (4)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ヴィッヒ・ヴィラ A.V.
Hu S.
アンドリュー-サンチェスS.
コリイ V.
ヤンセン B.H.
アウグスティンH.E.
ボルテ L.A.
ルイグロック・R.A.A.A.
アブアリG.
Giallourakis C.

炎症性腸疾患における糞便メタボロームとその決定因子。
Gut. 2023; 72: 1472-1485
論文で見る
スコープス (10)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
タウル Y.
ジェンク R.R.
ペラレス M.A.
リットマン E.R.
モルジャリア S.
リン L.
ゴボーン A.
ヴィアーレ A.
ダヒ P.B.
他。
腸内細菌の多様性が同種造血幹細胞移植後の死亡率に及ぼす影響。
Blood. 2014; 124: 1174-1182
論文で見る
スコープス(612)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
バジャジ J.S.
Khoruts A.
肝疾患および肝硬変における微生物叢の変化と腸内細菌叢移植。
J. Hepatol. 2020; 72: 1003-1027
論文で見る
スコープス (101)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ドゥオン N.
Bajaj J.S.
肝移植における腸内細菌叢の影響。
Curr. Opin. Organ Transplant. 2021; 26: 587-594
論文で見る
スコープス(2)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
アギーレM.
エック A.
ケーネン M.E.
サベルクールP.H.M.
バディング A.E.
ヴェネマ K.
検証されたin vitro腸内モデルにおいて、食事がヒト腸内細菌叢の代謝活性と組成を素早く変化させる。
Res. Microbiol. 2016; 167: 114-125
論文で見る
スコープス (113)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
マクファーレンG.T.
ギブソンG.R.
ビーティ E.
カミングス J.H.
分岐鎖脂肪酸の測定に基づくヒト腸内細菌によるタンパク質からの短鎖脂肪酸産生の推定。
FEMS Microbiol. Lett. 1992; 101: 81-88
論文で見る
スコパス (73)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
船橋真一
グローブ T.L.
ワン M.
ヴァルマ Y.
マクファデン M.E.
ブラウン L.C.
グオ C.
ヒギンボトム S.
アルモ S.C.
フィッシュバッハM.A.
腸内マイクロバイオームによる胆汁酸デヒドロキシル化の代謝経路。
Nature. 2020; 582: 566-570
論文で見る
スコープス(205)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Paik D.
ヤオ L.
Zhang Y.
Bae S.
D'Agostino G.D.
Zhang M.
Kim E.
フランゾーザ E.A.
アビラ・パチェコ J.
ビサンズJ.E.
他。
ヒト腸内細菌はTH17を調節する胆汁酸代謝産物を産生する。
ネイチャー。2022; 603: 907-912
論文で見る
スコープス (147)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
パトナム E.E.
グッドマンA.L.
腸内常在菌によるビタミンB群の獲得。
PLoS Pathog. 2020; 16e1008208
論文で見る
スコープス (41)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Meijers B.K.I.
クレーズK.
バンメンスB.
デ・ローH.
ヴィアエネL.
フェルベケ K.
カイパース D.
ヴァンレンテルヘム Y.
Evenepoel P。
軽度から中等度の腎疾患におけるp-クレゾールと心血管リスク。
Clin. J. Am. Soc. Nephrol. 2010; 5: 1182-1189
論文で見る
スコープス (246)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
バルゴッシ E.
ガルディーニF.
ガット V.
モンタナーリ C.
トリアーニ S.
タバネッリ G.
エンテロコッカス・フェシウム(Enterococcus faecium)およびエンテロコッカス・フェカリス(Enterococcus faecalis)株のチラミン産生能と表現型および遺伝的特徴の相関性。
Front. Microbiol. 2015; 6: 1371
論文で見る
スコープス (42)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ロアート F.
ゴーティエB.
シン A.
Lê Cao K.A.
mixOmics: 'omics'特徴選択と複数データ統合のためのRパッケージ。
PLoS Comput. Biol. 2017; 13e1005752
論文で見る
スコープス (1664)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Cao K.-A.L.
ロハートF.
ゴンザレス I.
デジャン S.
mixOmics: オミックスデータ統合プロジェクト。
http://mixomics.org/
日付:2016年
記事で見る
グーグル・スカラー
ウェルズ J.E.
ハイレモン P.B.
ヒト糞便から分離された高活性7α-デヒドロキシル化菌株であるClostridium sp.TO-931株における胆汁酸7α-デヒドロキシル化オペロンの同定と特徴づけ。
Appl. Environ. Microbiol. 2000; 66: 1107-1113
論文で見る
スコープス (119)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
佐藤康博
アタラシ K.
プリクタD.R.
新井康弘
笹島 聡
カーニー S.M.
須田和彦
竹下 和男
佐々木 隆
岡本慎一郎
他。
百寿者のマイクロバイオームには新規胆汁酸生合成経路が濃縮されている。
Nature. 2021; 599: 458-464
論文で見る
スコープス(176)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
デブリン A.S.
フィッシュバッハ M.A.
著名な微生物由来の胆汁酸の生合成経路。
Nat. Chem. Biol. 2015; 11: 685-690
論文で見る
スコープス (246)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
フランツC.M.A.P.
シュペヒトI.
ハベラーP.
ホルツァプフェル W.H.
食品から分離された腸球菌の胆汁酸ヒドロラーゼ活性:スクリーニングと定量。
J. Food Prot. 2001; 64: 725-729
論文で見る
スコープス (97)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
タウル Y.
ザビエルJ.B.
リピューマL.
ウベダ C.
ゴールドバーグ J.
ゴボーン A.
リー Y.J.
デュビン K.A.
ソッチ N.D.
ヴィアレA.

同種造血幹細胞移植を受けた患者における腸管支配と菌血症のリスク。
Clin. Infect. Dis. 2012; 55: 905-914
論文で見る
スコープス (675)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
ストーマI.
リットマンE.R.
ペレド J.U.
ジラルト S.
ファンデンブリンク M.R.M.
パマー E.G.
タウルY.
腸内細菌叢の組成変化とグラム陰性菌による血流感染リスク。
Clin. Infect. Dis. 2021; 73: e4627-e4635
論文で見る
スコープス (51)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
バシスC.M.
シーカッツA.
フォッグL.
ロランス K.
ムーア N.M.
オカモト K.
リー Y.
バルドウスキー L.
ベル P.
サラザール E.
et al.
長期急性期病院(LTACH)入院時の患者におけるカルバペネム耐性腸内細菌科細菌(CRE)保菌の腸内細菌叢と臨床的予測因子。
オープンフォーラムInfect. Dis. 2016; 3: 2220
論文で見る
クロス
グーグル奨学生
ベルナール-レイションL.
ヴェンゾン M.
クライン J.
アクセルラッド J.E.
チャン C.
サリバン A.P.
ハッシー G.A.
カサノバス・マッサーナ A.
ノバル M.G.
バレロ・ヒメネスA.M.

抗生物質を投与されたCOVID-19患者における腸内細菌叢の異常は、微生物のトランスロケーションおよび菌血症と関連している。
Nat. Commun. 2022; 13: 5926
論文で見る
スコープス (43)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
サヴィッツJ.
キヌレニン経路:すべてのパイに指を入れる。
モル。Psychiatry. 2020; 25: 131-147
論文で見る
スコープス (296)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
Więdłocha M.
マルシノヴィッチP.
ヤノスカ-ヤチュジクM.
Szulc A。
腸内細菌叢、キヌレニン経路と精神障害 - レビュー。
プログ。Neuropsychopharmacol。生物。精神医学。2021; 106: 110145
論文で見る
スコープス (28)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ウィリアムズ B.B.
ヴァン・ベンショテンA.H.
シメルマンチッチP.
ドニア M.S.
ツィンマーマン M.
タケタニ M.
石原 A.
カシャップ P.C.
フレイザー J.S.
フィッシュバッハ M.A.
神経伝達物質トリプタミンを産生する腸内細菌脱炭酸酵素の発見と特徴づけ。
Cell Host Microbe. 2014; 16: 495-503
論文で見る
スコープス (411)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ボーンホフ M.
ミラー C.P.
ストレプトマイシン投与マウスにおけるサルモネラ菌感染感受性の亢進。
J. Infect. Dis. 1962; 111: 117-127
論文で見る
スコープス (154)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
フレター R.
正常腸内細菌叢の阻害によるモルモットの致死的腸コレラ感染。
J. Infect. Dis. 1955; 97: 57-65
論文で見る
スコパス (83)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ソルバラ M.T.
デュビン K.
リットマン E.R.
ムーディ T.U.
フォンタナ E.
ソック R.
ライナー I.M.
タウル Y.
ペレド J.U.
ファンデンブリンクM.R.M.

微生物叢を介した細胞内酸性化による抗生物質耐性腸内細菌科細菌の抑制。
J. Exp. Med. 2019; 216: 84-98
論文で見る
スコープス (115)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
ヤコブソンA.
ラムL.
ラジェンドラムM.
タンブリーニF.
ハニーカットJ.
ファム T.
ヴァン・トレウレン W.V.
プルース K.
ステイラー S.R.
ルーゴ K.
他。
サルモネラ菌感染に対するコロニー形成抵抗性を仲介する腸内常在菌産生代謝産物。
Cell Host Microbe. 2018; 24: 296-307.e7
論文で見る
スコープス (262)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
Djukovic A.
ガルソン M.J.
カンレット C.
カブラル V.
ララウイ R.
ガルシア・ガルセラ M.
レチェンバーガー J.
トレンブレー=フランコ M.
ペニャランダ I.
プチャデス-カラスコL.

多剤耐性腸内細菌科細菌による腸内コロニー形成を制限するために、乳酸桿菌がクロストリジウム属をサポートしている。
Nat. Commun. 2022; 13: 5617
論文で見る
スコパス (14)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
オデンワルド M.A.
リン・エイチ
レーマン C.
ディラ N.P.
コール C.G.
モスタッドJ.D.
パパス T.E.
ラマスワミ R.
モラン A.
ハチソンA.L.

ビフィズス菌はラクチュロースを代謝して腸内代謝産物を最適化し、肝疾患患者の全身感染を予防する。
Nat. Microbiol. 2023; 8: 2033-2049
論文で見る
スコープス (1)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ハバード T.D.
マレーI.A.
ビッソン W.H.
ラホティ T.S.
ゴウダ K.
アミン S.G.
パターソン A.D.
パーデューG.H.
微生物由来のインドールを感知するためのヒトアリール炭化水素受容体の適応。
Sci. Rep. 2015; 5: 12689
論文で見る
スコープス (237)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
オピッツC.A.
リッツェンバーガーU.M.
ザームF.
オット M.
トリッチラー I.
トランプ S.
シューマッハ T.
イェスタエット L.
シュレンク D.
ウェラーM.

ヒトアリール炭化水素受容体の内因性腫瘍促進リガンド。
Nature. 2011; 478: 197-203
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
コナー T.J.
スターN.
オサリバンJ.B.
ハーキンA.
全身性炎症チャレンジ後のラット脳におけるインドラミン2,3-ジオキシゲナーゼとキヌレニン3-モノオキシゲナーゼの誘導: IFN-γの役割?
Neurosci. 2008; 441: 29-34
論文で見る
スコープス (169)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
オルハン F.
バット M.
サンドバーグ K.
ストール S.
Piehl F.
スヴェンソン C.
エルハルト S.
Schwieler L.
カロリンスカ統合失調症プロジェクト(KaSP)コンソーシアム
末梢単球におけるToll様受容体刺激下流のキヌレニン経路に沿ったトリプトファン代謝。
Scand. J. Immunol. 2016; 84: 262-271
論文で見る
スコパス (31)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
カイード M.
ミショノー D.
ソシエG.
ウォーラー E.K.
インドール誘導体、マイクロバイオーム、移植片対宿主病。
Curr. Opin. Immunol. 2021; 70: 40-47
論文で見る
スコープス (12)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Jaskiewicz J.
ザオ Y.
ホーズ J.W.
下村陽子
クラッブ D.W.
ハリスR.A.
結腸細胞によるイソ酪酸の異化。
Arch. Biochem. Biophys. 1996; 327: 265-270
論文で見る
スコープス (45)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
タッコネッリ E.
デ・アンジェリスG.D.
カタルド M.A.
マンテンゴリ E.
スパヌ T.
パン A.
コルティ G.
ラディーチェ A.
ストルツォーリ L.
アンティノリ S.
他。
抗生物質の使用と抗生物質耐性菌のコロニー形成および感染リスク:病院集団ベースの研究。
Antimicrob. Agents Chemother. 2009; 53: 4264-4269
論文で見る
スコープス (111)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
バフィーC.G.
ジャーカムI.
エクインダ M.
リピューマL.
ゴボーン A.
ヴィアーレ A.
ウベダ C.
ザビエル J.
パマー E.G.
クリンダマイシン単回投与後の腸内細菌叢の顕著な変化により、Clostridium difficile誘発性大腸炎に対する感受性が持続する。
Infect. Immun. 2012; 80: 62-73
論文で見る
スコープス (411)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Yan J.
リャオ C.
テイラー B.P.
フォンタナ E.
アモレッティ L.A.
ライト R.J.
リットマン E.R.
ダイ A.
ウォーターズ N.
ペレドJ.U.
他。
造血細胞移植患者の糞便マイクロバイオームショットガンメタゲノミクスの集大成。
Sci. Data. 2022; 9: 219
論文で見る
スコープス (4)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
テルミーO.
フィードラーL.
マルティネスL.
フォスターJ.
ペルマレディ P.
レバイン R.S.
Hennekens C.H.
憂慮すべき傾向:米国におけるアルコール性肝硬変による死亡率。
Am. J. Med. 2022; 135: 1263-1266
論文で見る
スコープス (6)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ハウグ K.
コクラン K.
ナイナラ V.C.
ウィリアムズ M.
チャン J.
ジャヤシーラン K.V.
オドノバン C.
MetaboLights:科学コミュニティのニーズに応えて進化するリソース。
Nucleic Acids Res. 2020; 48: D440-D444
論文で見る
PubMed
Google Scholar
ボルジャー A.M.
ローゼ M.
Usadel B.
Trimmomatic:イルミナ配列データ用の柔軟なトリマー。
Bioinformatics. 2014; 30: 2114-2120
論文で見る
論文リスト
PubMed
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ハッテンハワー
ニーダータ
https://huttenhower.sph.harvard.edu/kneaddata/
日付:2023年
記事で見る
グーグル・スカラー
ブランコ=ミゲス A.
ベギーニF.
クンボF.
マカイバーL.J.
トンプソン K.N.
ゾルフォ M.
マンギ P.
デュボア L.
ホアン・K.D.
トーマス A.M.
et al.
MetaPhlAn 4を用いた未同定種のメタゲノム分類学的プロファイリングの拡張と改善。
Nat. Biotechnol. 2023; 41: 1633-1644
論文で見る
筑波大学
PubMed
クロス
グーグル奨学生
シュルーターJ.
ジュコビッチA.
テイラーB.P.
ヤン J.
Duan C.
ハッシー G.A.
リャオ C.
シャルマ S.
フォンタナ E.
アモレッティL.A.

TaxUMAPアトラス:大規模な臨床マイクロバイオームデータの効率的な表示により、菌血症に対する防御における生態学的競合が明らかになった。
Cell Host Microbe. 2023; 31: 1126-1139.e6
論文で見る
スコープ (1)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル・スカラー
ブッフフィンクB.
ロイター K.
Drost H.G.
DIAMONDを用いた生命樹スケールでの高感度タンパク質アラインメント。
Nat. Methods. 2021; 18: 366-368
論文で見る
スコープス (642)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
Sjoberg D.
ホワイティングK.
カリーM.
ラベリーJ.
Larmarange J.
gtsummaryパッケージによる再現可能な要約表。
R J. 2021; 13: 570-580
論文で見る
クロスフィルム
Google Scholar
Kassambara A.
rstatix: Rで基本的な統計検定を行うためのパイプフレンドリーなフレームワーク。
(GitHub)
https://github.com/kassambara/rstatix
日付:2022年
記事で見る
グーグル・スカラー
Gu Z.
Eils R.
Schlesner M.
多次元ゲノムデータのパターンと相関を明らかにする複雑なヒートマップ。
Bioinformatics. 2016; 32: 2847-2849
論文で見る
スコープス (3882)
PubMed
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ティーレC.
Hirschfeld G.
cutpointr: Rにおける最適カットポイントの推定と検証の改善。
J. Stat. Softw. 2021; 98: 1-27
論文で見る
スコープス (111)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ウィッカム H.
ggplot2, データ解析のためのエレガントなグラフィックス.
Springer, 2009
記事で見る
クロスリファレンス
グーグル・スカラー
Kuhn M.
caret: 分類と回帰のトレーニング。
(Rパッケージバージョン6.0-91)
https://CRAN.R-project.org/package=caret
日付:2022年
記事で見る
グーグル・スカラー
スティーブンソン M.
軍曹E.
ホイヤーC.
ヌネス T.
ホイヤーC.
マーシャル J.
サンチェス J.
ソーントン R.
ライツィゲル J.
ロビソン-コックスJ.
et al.
epiR: 疫学データ解析のためのツール。
https://cran.r-project.org/web/packages/epiR/index.html
日付:2022年
記事で見る
Google Scholar
Dudnik G.
mltest: 分類評価メトリクス。
https://cran.r-project.org/web/packages/mltest/mltest.pdf
日付:2018年
記事で見る
グーグル・スカラー
Wasey J.O.
PRISMAstatement:「PRISMA」声明に従ってフローチャートをプロットする。
(バージョン1.1.1)
https://cran.r-project.org/web/packages/PRISMAstatement/PRISMAstatement.pdf
日付:2019年
論文で見る
グーグル・スカラー
記事情報
出版履歴
出版 2023年12月15日
受理 受理:2023年11月17日
改訂版受理 2023年10月6日
受理:2023年10月6日 受理日:2023年6月29日
出版段階
インプレス、修正校正
識別
DOI: https://doi.org/10.1016/j.chom.2023.11.016

著作権
© 2023 Elsevier Inc.
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また、このような研究は、科学的根拠を欠くものである。このような、曖昧で、曖昧で、曖昧で、曖昧で、曖昧で、曖昧で、曖昧で。このような試合では、このような試合はありません。このような稚魚は、その稚拙さゆえに、その稚拙さを際立たせることができず、また、その稚拙さゆえに、その稚拙さを際立たせることができない。このような素晴らしい試合は初めてです。私は、このような素晴らしいゲームをプレイすることはできません。 このような素晴らしい試合は初めてです。このような稚魚は、そのような稚拙な稚魚である可能性があります。

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