暇空茜氏問題で会計検査院が出てきた理由は、一般論として考えて

都外まで関わると国の所管だし
暇空茜氏が国の不正を追及する話だから

でしょう。
暇空茜氏らの訴え自体は女叩き男に古来よくある集団ヒスですが、万一colabo側に瑕疵があれば、国や都が行政訴訟の被告になっちゃうんで。