記事一覧
MeCabのユーザー辞書追加
①MeCabのインストール ②csvファイルの作成 ③mecab-dict-index.exeで作成(管理者権限必要) https://teratail.com/questions/343763
遺伝的アルゴリズムを用いた特徴量選択
タイトル通りだが、GAを用いて特徴量選択をやってみたいと思ったので、勉強している。本記事はその備忘録である https://horomary.hatenablog.com/entry/2019/03/10/19091…
taggerでユーザー辞書を読み込ませる(Jupyter Notebook)
昨日記事で作成したdicファイルが必要
ipadic内のmecabrcをメモ帳かなんかで開く
; This file can be empty but it needs to existの下に下記を追加
userdic = "ユーザー辞書ファイル(dic)のpath"
tagger = MeCab.Tagger(ipadic.MECAB_ARGS)で解析するとユーザー辞書が反映されている
MeCabのユーザー辞書追加
①MeCabのインストール
②csvファイルの作成
③mecab-dict-index.exeで作成(管理者権限必要)
https://teratail.com/questions/343763
Psi4参考サイトまとめ
自分用のまとめです
SHAPによる特徴量の影響説明②
・shap_values[]
shap_values[0], shap_values[1]でクラス0と1それぞれの予測モデルに対する特徴量の寄与度を算出
・explainer.expected_value[]
予測の平均値
・force_plot
shap.force_plot(explainer.expected_value[0], shap_values[0][0,:], X_tes
SHAPによる特徴量の影響説明
SVCで作成した分類器の特徴量の説明をしたいと思い、SHAPを使用してみようと思った。
下記のコードを参考にしている。
ひとまずほぼコピペで動いたが、エラーが大量に出ていた。
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The default of 'normalize' will be set to False in version 1.2 and deprec
遺伝的アルゴリズムを用いた特徴量選択
タイトル通りだが、GAを用いて特徴量選択をやってみたいと思ったので、勉強している。本記事はその備忘録である
https://horomary.hatenablog.com/entry/2019/03/10/190919
https://qiita.com/kimisyo/items/2a1fc6a28b389f3e0561
https://darden.hatenablog.com/entr
今日の進捗 2021 8/11
手持ちのデータを使って、各物質のエンタルピーの予測を行った。人のコードをほぼそのままコピペして動かしているが、徐々に中身の理解も進んでおり満足している。今後の目標としては1から自分でコードを書いて、回せるようにしたい。
今日の進捗 2021 8/8
今日はpytorchのネットワークの組み方について学び、実際に書いてみた。ひとまず学習させるところまでは行ったが、学習の際にエラーが出るので、明日はそこを解決したい。
順調といえるかはわからないが、少しずつ進歩していると思っている。
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今日の進捗 2021 8/5
今週の前半はワクチン接種後の副作用で体調が芳しくなく、なにもできなかった。2回目の接種の時は家に引きこもれる装備を整えておいた方が良さそう。
本日は手持ちのデータをpytorch_geometricに入力できるように変換を行ってみた。ただ、2原子分子とメタンでエラーが出た。なぜエラーが出るのかを把握し、修正する予定である。
今日の進捗 2021 7/31
Qiitaに投稿されている、Graph Convolutional Network による溶解度予測 (回帰)という記事の中身について勉強を行った。
また、pytorchで入力を2つするやり方を調べた。pytorchではtorch.catで結合可能らしい。当然だが、2つの入力は同じじゃないといけない。
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今日の進捗 2021 7/29
昨日は疲れて寝てしまったので進捗がなかったということを念のため報告しておく。
今日は今まで学んだグラフについてパワーポイントにてまとめる作業をした。出力をすることで学んだ内容がより頭に入ったと思う。
今週末は連休でできなかったことをこなしたい
今日の進捗 2021 7/27
torchのtensor型とは何ぞや？ ということについてお勉強した。基本的にはnumpyのndarrayと同じと考えてよさそう
とはいえ分子グラフの表現方法とかまだわかってないから、そっちもお勉強しなきゃ。
時間がなさ過ぎてつらい。
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https://qiita.com/mathlive/
今日の進捗 2021 7/26
あいかわらずGNNについて文献調査。やりたい内容とほぼ同じ先行研究を見つけたので今日、明日で読みたい。あ^~、オープンアクセスの論文助かる。
平日は時間がないから効率的になりたい。
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ディープラーニングによる異性化反応の遷移状態の生成
https://pubs.rsc.org/en/cont
今日の進捗 2021 7/25
今日はpytorchのチュートリアルやってました。英語弱者なので日本語訳されてるのありがてぇ^~。
別に英語が全くできないわけではないけど、全然知らない内容を英語で勉強するのは厳しい。
途中で疲れたので、あとはディープラーニングについてもお勉強した
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今日の進捗 2021 7/24
pytorchのインストールに取り組んだ。何とかインストールできたのでチュートリアル的なことを行えた。
また、インストール中は暇なので、CNNなどの基礎勉強を行った。
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ゼロから作る Deep learning
https://qiita.com/DNA1980/items/8c8258c9