「主席で卒業」？

「主席」ではなく、「首席」。「首」は髪の毛の生えた頭を象る象形文字で、ここでは最上位の意味を表します。

「首都」「首長」などの「首」も同じ意味です。内閣総理大臣の別名「首相」も、「首席の宰相」が原義です。