- 運営しているクリエイター
2015年8月の記事一覧
Rでheatmapを作成
マイクロアレイ解析やオミックス解析でよく見かけるheatmap。
下記サイトを参考にheatmapの描き方を勉強したのでメモ。
だれでもできるマイクロアレイ解析
http://blogs.yahoo.co.jp/doshiroutomicroarray
まず、Rを起動します。
Bioconductorがインストールされていない場合には、インストール。
> source("http://bi
マイクロアレイやRNA-Seqデータの解析
マイクロアレイやRNASeqなどの発現データのダウンロード。
NCBIのGEOのサイト
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
'Search for Gene Expression at GEO Profiles'をクリックして、'GEO DataSets'タブを選んで、論文に掲載されているGSEコードを入力すると、実験のページに移動する。
いくつかのファイルへの