第1部 ファントム・ブラッド(ファントムブラッド、ファントムブラッド)
全44章。19世紀末のイギリス、裕福な地主の息子ジョナサン・ジョースターは、彼を憎み、ジョースター家の後継者としての地位を奪おうと企む新しい養兄ディオ・ブランドーと出会う。ディオの企みが阻止されると、彼は古代の石仮面を使って吸血鬼に変身し、ジョースター家を破壊する。ジョナサンは旅に出て新たな仲間と出会い、世界征服を新たな目標とするディオを止めるため、武術の波紋をマスターする。
Volumes 1–5, 44 chapters. In late 19th-century England, Jonathan Joestar, the young son of a wealthy landowner, meets his new adopted brother Dio Brando, who loathes him and plans to usurp his position as heir to the Joestar family. When Dio's attempts are thwarted, he transforms himself into a vampire using an ancient Stone Mask and destroys the Joestar estate. Jonathan embarks on a journey, meets new allies, and masters the Hamon (波紋, "Ripple") martial arts technique to stop Dio, who has made world domination his new goal.
第2部:戦闘潮流(せんとうちょうりゅう)
第5巻から第12巻まで、全69章。1938年、ドイツの探検隊が石仮面を作った強力なヒューマノイド、ピラーマンを発見し、目覚めさせる。柱人間は研究者たちを殺害して逃走し、他の柱人間を目覚めさせ、アジャの赤い石を手に入れることで人類の覇権を取り戻そうとする。ジョナサンの孫であるジョセフ・ジョースターは、新たな仲間やハモンの師匠と団結し、ピラーマンを倒す。
第3部 スターダストクルセイダース(スターダストクルセイダース、Sutādasuto Kuruseidāsu)
第13巻から第28巻まで、全152章。1989年、ディオ・ブランドー(現在は "DIO")は海から墓を引き揚げられ、目覚める。ディオがジョナサンの遺体を奪還したことで、ジョナサンの子孫であるジョセフ、娘の九条ホリー、孫の九条承太郎の3人にスタンドが目覚める。しかし、ホリーは自分のスタンドに対応できず、余命50日となってしまう。承太郎とジョセフ、そして新たな仲間であるモハマド・アヴドル、花京院典明、ジャン・ピエール・ポルナレフ、イギーは、この期限が切れる前にディオを倒すべく旅に出る。
第4部 ダイヤモンドは砕けない(ダイヤモンドは砕けない、ダイヤモンドは砕けない)
第29巻から第47巻まで、全174章。1999年、ジョースター一家は、ジョセフに東方丈助という隠し子がいることを知る。ヨースケは、鏃(やじり)で打たれた者に "杖 "を授ける神秘の弓矢の存在を知る。弓矢を追い求める丈介、丈太郎、そして盟友の広瀬康一、虹村億泰、岸辺露伴は、スタンド使いの連続殺人鬼・吉良吉影という重大な脅威に遭遇する。
第5部 黄金の風(おうごんのかぜ)
全47~63巻、155章。2001年、イタリアのナポリ。ジョルノ・ジョバァーナは、ディオがジョナサン・ジョースターの遺体を持っている間に身ごもった息子である。ジョルノは、子供たちに麻薬を売る売人を撲滅するため、マフィアのボスになることを目指す。スタンド使い、ブルーノ・ブッチャラーティ、レオーネ・アバッキオ、ナランチャ・ギルガ、グイド・ミスタ、そして(当初は)パンナコータ・フーゴで構成される彼のチームは、マフィアのボス、ディアボロに立ち向かい、ディアボロが正体を隠すために殺そうとする娘トリッシュ・ウナを守らなければならない。
第6部:ストーンオーシャン(蘇東雲大山)
全64巻~80巻、158章。2011年、フロリダ州ポートセントルーシー近郊で、九条丈太郎の娘ジョリーン・キュジョーは殺人の濡れ衣を着せられ、刑務所に送られる。彼女はスタンド使いのエンポリオ・アルニーノ、アーメス・コステロ、ナルシソ・アナスイ、ウェザー・リポート、フー・ファイターズ、そして父親と協力し、ディオに忠誠を誓う刑務所のチャプレン、エンリコ・プッチ神父を追い詰める。
第7部 スティール・ボール・ラン(スティール・ボール・ラン、Sutīru Bōru Ran)
第81巻から第104巻までの95章。別の時間軸の1890年、合衆国大統領ファニー・ヴァレンタインは、優勝者に5千万ドルの報酬を与えるクロスカントリー競馬レースを開催する。バレンタインはこのレースを利用して、散らばった聖なる死体の一部を集め、自らの国家主義的な目的のために使おうとしていた。レーサーのジャイロ・ツェペリとジョニー・ジョースターはバレンタインの策略を暴き、雇われた刺客から身を守らなければならない。
第8部 ジョジョリオン(ジョジョリオン、ジョジョリオン)
第105巻から131巻、110章。スティール・ボール・ラン』と同じ宇宙を舞台にした2012年の森王町は、2011年の東日本大震災で壊滅的な被害を受け、「ウォール・アイズ」と呼ばれる謎の断層が出現した。地元の大学生・広瀬康穂は、瓦礫に埋もれた青年を発見し、「ヨースケ」と名付ける。記憶喪失になったヨースケは、自分の過去の秘密を暴こうとするが、その一方で、人を癒し、その見返りに何かを "奪う "ことができる謎の木「ロカカ」の実を売る地元の犯罪組織とそのリーダー、トオルの活動にも直面する。
第9部:ジョジョの国
132巻以降。現代、ジョディオとドラゴナ・ジョースターの兄妹は、母親を養い守るためにハワイのオアフ島で違法行為に手を染める。ジョディオは、この物語は自分が大金持ちになるためのものだと宣言する。2人は、窃盗狂のパコ・ラブランテス、疑り深いウサギ・アロハオエとともに、金持ちの日本人観光客からダイヤモンドを盗むというミッションに挑むが、予測不可能な出来事によって、ミッションはたちまち軌道から外れてしまう。