SARS-CoV-2検出率：口腔咽頭ぬぐい＞鼻咽頭ぬぐい＞唾液

今更ながら・・・と、言われるかもしれないが・・・

口腔咽頭ぬぐい検体は鼻咽頭ぬぐい検体よりもSARS-CoV-2の検出率が高く、検査に伴う不快感も少なかった
唾液検体は感度低いが、大量検査においてはコスト上有益かもしれない

Tobias Todsen. “Higher SARS-CoV-2 Detection of Oropharyngeal Compared with Nasopharyngeal or Saliva Specimen for Molecular Testing: A Multicentre Randomised Comparative Accuracy Study.” Thorax, n.d. https://thorax.bmj.com/content/thoraxjnl/early/2023/05/18/thorax-2022-219599.full.pdf.

【背景】 SARS-CoV-2感染の検出には検査が不可欠であるが、最適なサンプリング方法は未だ不明である。
【目的】 SARS-CoV-2分子検査において、鼻咽頭スワブ（NPS）、口腔咽頭スワブ（OPS）、唾液検体採取のいずれが最も検出率が高いかを明らかにすること。
【方法】 2つのCOVID-19外来検査センターにおいて、逆転写酵素PCR検査のために医療従事者が異なる順序でNPS、OPS、唾液検体を採取する無作為化臨床試験を実施した。SARS-CoV-2検出率は、特定のサンプリング方法で陽性となった数を、3つのサンプリング方法のいずれかが陽性となった数で割った値として算出した。副次的アウトカムとして、検査に関連する不快感を11段階の数値スケールで測定し、費用対効果を算出した。
【結果】 試験を完了した成人23 102人のうち、381人（1.65%）がSARS-CoV-2陽性であった。
SARS-CoV-2の検出率は、OPSでは78.7%（95% CI 74.3 to 82.7）、NPSでは72.7%（95% CI 67.9 to 77.1）（p=0.049 ）、唾液サンプリングでは61.9%（95% CI 56.9 to 66.8）（p<0.001 ）と高くなりました。
不快感スコアは、NPSが5.76（SD、2.52）と最も高く、次いでOPSが3.16（SD 3.16）、唾液検体が1.03（SD 18.8）で、すべての測定間でp<0.001であった。
唾液検体は最もコストが低く、NPSとOPSのSARS-CoV-2感染検出1件あたりの増分コストは、それぞれ3258米ドル、1832米ドルであった。
【結論】 SARS-CoV-2検査において、OPSはNPSよりもSARS-CoV-2の検出率が高く、検査に伴う不快感も少なかった。
唾液サンプリングはSARS-CoV-2の検出率が最も低かったが、集団検査のための最もコストのかからない方法であった。
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この研究ではランダムな順序で収集された3つの検体を比較し、OPS検体はNPS検体よりもSARS-CoV-2の分子検査での検出率が高いことが明らかになった。OPSはまた、NPSよりも許容度が高く、コストも低い。唾液の検出率はOPSやNPSよりも低かったが、大規模なテストのためのコストと許容度は高かった。
SAMPLE試験は、分子検査結果とテストの不快感、コスト効果のデータを組み合わせることで、異なるSARS-CoV-2サンプル戦略の影響を完全に調査した。このランダム化試験設計により、3つのペアの標本の順序をランダム化し、すべてのRT-PCR分析に同じウイルス搬送培地と実験室の設備を使用することで、診断結果に影響を与える外的交絡因子をコントロールすることが可能となった。
我々の研究にはいくつかの限定要素がある。一つの参照基準として、被験者のSARS-CoV-2感染の確定診断を定義した。したがって、いずれかの検体（指標検査）からの陽性分子検査により、参照基準を陽性と定義することになる。しかし、3つの検体を独立した高感度RT-PCR検査に送ることで、偽陽性のリスクは非常に低いと考えられる。
我々は、OPS検体の方がNPS検体よりもわずかに高いSARS-CoV-2検出率を見つけたことに驚いた。しかし、これらの研究ではOPSプロシージャーやスタッフトレーニングの詳細な説明が欠けていた。この結果は、初期の無症候性感染期間中のSARS-CoV-2の増殖において、口腔咽頭腔が鼻腔よりも重要な役割を果たしていることを示唆している。
両方のOPSとNPSを別々に分子検査で収集するポリシー（OPS/NPS）は、単一のOPSまたはNPS検体に比べてSARS-CoV-2の検出率をそれぞれ15%と21%点増加させるでしょう。これらの結果は以前の研究と一致し、WHOの推奨を支持している。OPSとNPSの検体を分子検査で組み合わせるべきである。ただし、これらの結果の限定要素は、診断用のNPS/OPSの結果は個々にRT-PCRに送られたNPSとOPSの検体から計算されていることです。SARS-CoV-2陽性被験者の定義は、陽性の分子検査結果がどれであれ、検査結果の組み合わせは常に高感度をもたらします。

我々の研究で唾液検体の検出率はNPS検体よりも11%点低く、これはSARS-CoV-2検査について報告されている系統的レビューの結果よりもわずかに低いです。唾液の検出率が低い理由の一つは、無症候性の参加者を多数含んでいたこと、そしてNPSやOPSと比較して不確定な唾液検査（1%）が多かったことです。ただし、唾液検体はNPSとOPS検体よりも検出率が低いものの、保護装具の必要性と人件費の削減により、予備分析コストは4分の1になるため、唾液は大規模検査に適しています。

SAMPLE試験は、公的な設定での分子検査において、OPS検体が高いSARS-CoV-2検出率を持ち、コストが低く、NPSよりも許容性が高いという証拠を提供します。唾液検体は、検出率がわずかに低いものの、検体ごとのコストが大幅に低いため、大規模検査に適しています。OPS/NPSの組み合わせ検体は最高のSARS-CoV-2検出率を達成し、感染患者を検出し、隔離することが重要な入院中の検査の一部として推奨できます。OPSの分子検査からの高感度が迅速な抗原検査にも一般化できるかどうかを調査するために、さらなる研究が必要です。

我々の診断結果が子供を含むより異質な人口に一般化できるか、そしてOPSの分子検査からの高感度が迅速な抗原検査にも一般化できるかどうかを調査するために、さらなる研究が必要です。