腸内細菌叢の共進化系統と形質がヒトの健康状態に及ぼす相反する影響

2023年6月2日 10:40

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.05.30.542569v1

iew ORCID ProfileHao Li, View ORCID ProfileJunliang He, Jieping Liang, Yiting Liang, View ORCID ProfileWei Zheng, Qingming, View ORCID ProfileFeng Guo
doi: https://doi.org/10.1101/2023.05.30.542569
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要旨
ヒトの腸内細菌の共進化史や宿主生理との関連性についてはほとんど知られていない。ここでは、野生霊長類の腸内原核生物ゲノムデータベース（pSGBs）を構築し、ヒト腸内原核生物データベース（hSGBs）と比較して、hSGBsの共有共進化クラスター（SCEC-hSGBs）および共進化形質を定義することにした。その結果、糖質活性酵素や抗生物質耐性といった特定の機能の進化的傾向を分析し、SCEC-hSGBsの宿主ジャンプイベントやゲノム減少傾向を明らかにした。興味深いことに、SCEC-hSGBsと、肉食動物に部分的に由来するとされる形質のスーパーエンリッチャー（SUEN-hSGBs）は、宿主の健康状態に対して反対の意味を示した。具体的には、SUEN-hSGBsは様々な疾患において濃縮され、腸内生物多様性と負の相関を示し、既知の健康ネガティブマーカー分類群や代謝産物に不釣り合いな寄与を示した。本研究は、ヒトの腸内細菌の起源と適応性に関する知見を提供し、プロバイオティクスや微生物に基づく宿主の健康予測を開発するための参考となる。
利益相反声明
著者らは、競合する利害関係はないことを宣言している。
著作権について
このプレプリントの著作権者は著者／資金提供者であり、bioRxivにプレプリントを永続的に表示するライセンスを付与しています。CC-BY-NC 4.0国際ライセンスで提供されています。
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