UCに対する糞便微生物移植における有効なドナーの微生物学的決定因子

UCに対する糞便微生物移植における有効なドナーの微生物学的決定因子
Craig Haifer1,2,3、http://orcid.org/0000-0003-2516-2121Laurence Don Wai Luu4、Sudarshan Paramsothy1,2、Thomas J Borody5、Rupert W Leong1,2、http://orcid.org/0000-0003-4017-1077Nadeem O Kaakoush4
A/Prof Nadeem O Kaakoush, School of Medical Sciences, University of New South Wales, Sydney, NSW 2052, Australia; n.kaakoush@unsw.edu.au 宛てにお送りください。

要旨
目的 便中有機体液移植（FMT）は、UCの治療において様々な有効性が認められている。最近、経口凍結乾燥FMTがUC患者に寛解をもたらし、1人のドナーが100％の有効性を示したのに対し、2人目のドナーは36％の有効性を示したことが明らかにされた。我々は、FMTのドナー選択を改善する目的で、これら2人のドナーの腸内細菌叢の差異を明らかにした。

デザイン 2人のドナーの糞便サンプルを44週間（ドナー1）または70週間（ドナー2）かけて採取した。ショットガン・メタゲノミクスとアンターゲット・メタボロミクスを用いて、マイクロバイオームとメタボロームをプロファイリングした。

結果 腸内細菌叢の長期安定性は、有効なドナーで非常に顕著であった。ドナーのマイクロバイオータ種の均一性は、UCにおけるFMTの2つの臨床試験において、臨床効果と関連する強固な特徴であり、患者におけるドナー種の生着率の向上につながった。ドナー腸内細菌叢のα多様性とβ多様性は、有意に異なっていた。90種の細菌と1種の古細菌がドナー間で存在量に差があり、そのうち44種は相対的存在量が0.1％以上であった。17/44種が有効なドナーに濃縮され、そのうち11種（64.7%）がそのドナーで一般的（75%以上のサンプル）な高品質ゲノムに組み立てられ、6種は患者への移植の証拠を示した。ドナー間の分類学的な違いは、メタボロミクスを使用して検証された実質的な微生物機能の違いにつながった。

結論 ドナーの微生物叢の安定性と種の均一性は、個々の微生物種や代謝物を超えて、UCの治療効果に関連する新たな指標として同定された。これらの指標は、宿主におけるより良い生着につながるコミュニティの回復力を表している可能性がある。

臨床試験登録番号 ACTRN12619000611123。

データの利用可能性に関する声明
データはオープンアクセスリポジトリで公開されています。ショットガンメタゲノミクスの生リード、および関連するメタゲノム集合ゲノムは、European Nucleotide Archive (ENA) にアクセッションPRJEB50699で提出された。16S rRNA遺伝子アンプリコンリードはENAのaccession PRJEB48134で公開されている。

http://dx.doi.org/10.1136/gutjnl-2022-327742

Altmetric.comからの統計情報
記事のaltmetricスコアは66です
もっと詳しく見る

3つのニュースメディアで取り上げられました
1件のブログで紹介されました
67人がツイートしました
1名が再編集
8人がMendeleyで閲覧
リンクされた記事
許可申請
この記事の一部または全部を再利用したい場合は、以下のリンクからCopyright Clearance CenterのRightsLinkサービスに移動してください。このリンクからCopyright Clearance CenterのRightsLinkサービスにアクセスすることができ、簡単な価格と様々な方法でコンテンツを再利用する許可を得ることができます。

許諾を得る
データの利用可能性に関する声明
データは、公開されたオープンアクセスリポジトリで利用可能です。ショットガンメタゲノミクスの生リード、および関連するメタゲノム集合ゲノムは、European Nucleotide Archive (ENA) にアクセッション PRJEB50699 として提出された。16S rRNA遺伝子アンプリコンリードはENAのaccession PRJEB48134で公開されている。

全文を見る
脚注
CHとLDWLは共同筆頭著者です。

ツイッター @LaurenceLuu, @rupertleong, @NOKaakoush

CHとLDWLは同等に貢献した。

寄稿者 概念化: NOK、RWL、CH、SP、TJB；データキュレーション。データキュレーション：LDWL, NOK 形式分析：NOK, LDWL: NOKとLDWL。資金獲得。RWL、NOK、SP、CH、TJB；調査。CH、LDWL、SP、RWL、NOK；監督。NOK、RWL、SP、可視化。NOK、執筆（原案）。執筆（原案）：NOK、執筆（査読および編集）：CH、LDWL、SP、RWL、NOK。CH, LDWL, SP, TJB, RWL; 保証人: NOK。

資金提供 本研究は，The Gutsy Group（2020-2021），St Vincent's Clinic Foundation（2019），オーストラリア消化器病学会（2019，2020）およびNHMRC Ideas grant（2011047）から資金提供を受けた。CHはRoyal Australasian College of Physiciansを通じた研究参加奨学金の支援を受けている。SPは、NHMRCの研究者助成金の支援を受けている。NOKはUNSW Scientiaフェローシップの支援を受けている。

利害関係者 CHは、Janssen、Pfizer、Takeda、Ferring、SandozおよびAbbvieから講演料と教育支援を得ている。SPはFinch Therapeuticsのコンサルタントを務めており、Ferring、Janssen、武田薬品から講演料を受け取っている。TJBはCentre for Digestive Diseasesに金銭的利害関係があり、Finch Therapeutics、RedHill BioおよびTopelia Austの医療顧問であり、FMT治療に関する特許を保有しています。RWLは、AbbVie、Aspen、Ferring、Celgene、Dr Falk Pharma、Novartis、MSD、Chiesi、BMSおよびGlutagenからの個人的報酬、Hospira / Fizer、JanssenおよびTakedaからの助成金および個人報酬、Shire Dr Falk Pharmaからの助成金、投稿論文以外での助成金を報告しています。他のすべての著者は、申告すべき利益相反はない。

患者および一般市民の参加 この研究のデザイン、実施、報告または普及計画には、患者および/または一般市民は関与していない。

証明と査読 受託研究ではなく、外部査読を受けている。

補足資料 本内容は、著者により提供されたものである。BMJ Publishing Group Limited (BMJ)の審査を受けておらず、査読を受けていない可能性がある。本コンテンツは、BMJ Publishing Group Limited (BMJ)の審査を受けておらず、査読を受けていない場合があります。BMJは、コンテンツに依存することから生じるすべての責任および義務を負いません。コンテンツに翻訳が含まれる場合，BMJは翻訳の正確性と信頼性を保証せず（現地の規制，臨床ガイドライン，用語，薬剤名，薬剤投与量を含むがこれに限らない），翻訳および翻案から生じるいかなる誤りおよび／または省略についても責任を負わない。

リンク記事
解説
糞便微生物移植を研究から臨床へ移行させるための、ドナーの有効性に関する微生物学的決定要因の評価
秦 劉 ジョバンニ・カマロタ ジャンルカ・イアニーロ
Gut 2022; - 公開オンライン：29 Sep 2022.
フルテキストを読むか、PDFをダウンロードする。
この記事を購入する（£33）

あなたにお勧めの他のコンテンツ
糞便微生物移植を研究から臨床に移行させるための、ドナーの有効性に関する微生物的な決定要因の評価
秦劉ら、ガット、2022年
糞便微生物移植の科学的フロンティア：アジア太平洋消化器病学会（APAGE）およびアジア太平洋消化器内視鏡学会（APSDE）の共同文書
Siew C Ngら、ガット、2020年
O48 UCに対するFMT後の細菌株と粘膜免疫プロファイルの間の新規相互作用。STOP-colitisの結果
Nabil Quraishiら、Gut、2022年
メタゲノム全関連研究により明らかになった日本人全身性エリテマトーデスの腸内細菌群の疾患特異的ランドスケープ
友藤嘉彦ら、Ann Rheum Dis、2021年
2型糖尿病の肥満被験者に対する糞便微生物叢移植後の微生物叢生着：24週間の二重盲検無作為化対照試験
Siew C Ngら、Gut、2022年
潰瘍性大腸炎を治療するための糞便移植でマイクロバイオームを操作する
コリーン・R・ケリーら、Journal of American Medical Association、2019年
IBSコホートにおける吸収不良糖質除去後の臨床転帰と関連する腸内細菌メタゲノムパスウェイの変化
マックら、Gut Microbes、2020年
クロストリジウム・ディフィシル感染症における糞便微生物移植の成功は、ドナーにおけるバクテリオファージの相対的存在量と相関する：レトロスペクティブ・コホート研究
朴ら、Gut Microbes、2019年
中等症から重症のプラーク乾癬患者におけるビメキズマブの安全性
Kenneth B. Gordonら、JAMA Dermatology、2022年
母乳と牛乳ベースの強化剤または乳児用ミルクを摂取する早産児の糞便マイクロバイオームのメタゲノムプロファイル：横断的研究
Miriam Aguilar-Lopezら、The American Journal of Clinical Nutrition、2022年