イラン原産の鳥類の肉および糞便中のClostridioides ( Clostridium ) difficile株の汚染の程度、抗生物質耐性、および遺伝的多様性の検討

イラン原産の鳥類の肉および糞便中のClostridioides ( Clostridium ) difficile株の汚染の程度、抗生物質耐性、および遺伝的多様性の検討

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37101693/

Examining the Extent of Contamination, Antibiotic Resistance, and Genetic Diversity of Clostridioides ( Clostridium) difficile Strains in Meat and Feces of Some Native Birds of Iran - PubMed

アクバル・アンサリアン・バレジら Biomed Res Int. 2023.
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クロストリジオイデス（クロストリジウム）・ディフィシル（C. difficile）は、疾病管理予防センターによると、ヒトや家畜に必須の腸内病原体の1つで、深刻な健康脅威となっています。また、抗菌薬はC. difficile感染症（CDI）の最も重要なリスクファクターの1つである。本研究では、2018年7月から2019年7月にかけて、イランのシャーレコルド地域のいくつかの在来鳥（鶏、鴨、ウズラ、ウズラ）の肉と糞に含まれるC. difficile株の感染、抗生物質耐性、遺伝子多様性を調査しました。サンプルは、濃縮ステップの後、CDMN寒天培地で培養した。毒素プロファイルを決定するために、tcdA、tcdB、tcdC、cdtA、およびcdtB遺伝子をマルチプレックスPCRで検出した。これらの分離株の抗生物質感受性は、ディスク拡散法を用いて調べ、MICとε-ε-ε-テストに基づいて追跡した。イランShahrekordの6つの伝統的な農場から、鶏、鴨、ウズラ、ウズラの肉300検体と鳥の糞1100検体を収集した。35個の肉サンプル（11.6％）と191個の糞便サンプル（17.36％）にC. difficileが検出された。さらに，分離された5つの毒素原性サンプルは，5，1，3のtcdA/B，tcdC，およびcdtA/B遺伝子を有していた．226検体から分離された菌株のうち，鶏肉検体からはリボタイプRT027に属する2株と，鶏糞に関連するRT078プロファイルが1株分離された．抗菌薬感受性試験の結果，全株がアンピシリンに耐性，28.57％がメトロニダゾールに耐性，100％がバンコマイシンに感受性であった。この結果から、鳥の生肉は、鳥の生肉の消費に衛生的な脅威を与える耐性C. difficileの発生源である可能性があると結論づけられる。しかし、鳥肉に含まれるC. difficileの疫学的特徴をさらに理解するためには、さらなる研究が不可欠である。
著作権 © 2023 Akbar Ansarian Barezi et al.
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参考文献
Ghorbani Filabadi P., Rahimi E., Shakerian A., Esfandiari Z. イラン、イスファハンの様々な供給源からの肉ナゲットにおけるClostridium difficileの有病率、抗生物質耐性、および遺伝的多様性。ジャーナル・オブ・フード・クオリティ. 2022;2022:6. doi: 10.1155/2022/9919464.9919464 - DOI
Sartelli M.、Malangoni M. A.、Abu-Zidan F.M.、他 外科患者におけるクロストリジウム・ディフィシル感染症の管理に関する WSES ガイドライン。ワールド・ジャーナル・オブ・エマージェンシー・サージェリー. 2015;10(1):1-23. doi: 10.1186/s13017-015-0033-6. - DOI - PMC - PubMed
ローソン P. A., シトロン D. M., トレル K. L., ファインゴールド S. M. クロストリジウム・ディフィシルをクロストリジョイデス・ディフィシル（ホールとオトゥール 1935）プレヴォ 1938 に再分類した。Anaerobe . 2016;40:95-99. doi: 10.1016/j.anaerobe.2016.06.008. - DOI - PubMed
Bartlett J. G., Chang T. W., Onderdonk A. B. Role of Clostridium difficile in antibiotic-associated pseudomembranous colitis. 胃腸病学(Gastroenterology) . 1978;75(5):778-782. doi: 10.1016/0016-5085(78)90457-2. - DOI - PubMed
Collins D. A., Hawkey P. M., Riley T. V. アジアにおけるクロストリジウム・ディフィシル感染症の疫学. 抗菌薬耐性と感染制御. 2013;2(1):p. 21. doi: 10.1186/2047-2994-2-21. - DOI - PMC - PubMed
Yu Z., Liyan M., Jing Y., et al. 入院中の成人におけるClostridium difficile感染の疫学と、中国中部におけるC. difficile PCRリボタイプ027の初分離. BMC Infectious Diseases（ビーエムシー感染症）. 2019;19(1):1-14. doi: 10.1186/s12879-019-3841-6. - DOI - PMC - PubMed
Smimor A. E., Bradley S. F., Strausbaugh L. J., Crossley K., Nicolle L. E. 高齢者向け長期介護施設におけるクロストリジウム・ディフィシル. 感染制御と病院疫学. 2014;23(11):696-703. - PubMed
Ofosu A. Clostridium difficile感染症：現在の治療法と新しい治療法のレビュー．アナルズ・オブ・ガストロエンテロロジー（Annals of Gastroenterology）. 2016;29(2):147-154. doi: 10.20524/aog.2016.0006. - DOI - PMC - PubMed
食品中のクロストリジウム・ディフィシル--罪のない傍観者か、深刻な脅威か？臨床微生物学的感染症(Clinical Microbiology Infection) . 2010;16(1):3-10. doi: 10.1111/j.1469-0691.2009.03108.x. - DOI - PubMed
Rupnik M., Wilcox M. H., Gerding D. N. Clostridium difficile infection: New developments in epidemiology and pathogenesis. ネイチャーレビュー マイクロバイオロジー . 2009;7(7):526-536. doi: 10.1038/nrmicro2164. - DOI - PubMed
Bakri M. サウジアラビア、ジャザンの牛、羊、山羊の生肉におけるClostridium difficileの有病率．サウジアラビア・ジャーナル・オブ・バイオロジカル・サイエンス（Saudi Jouranl of Biological Sciences） . 2018;25(4):783-785. doi: 10.1016/j.sjbs.2016.07.002. - DOI - PMC - PubMed
Heise J., Witt P., Maneck C., Wichmann-Schauer H., Maurischat S. 異なる切断工場で処理した新鮮な鶏肉サンプルにおけるClostridioides difficile株の有病率と系統的関係。インターナショナル・ジャーナル・オブ・フード・マイクロバイオロジー. 2021;339, article 109032 doi: 10.1016/j.ijfoodmicro.2020.109032. - DOI - PubMed
ロドリゲス-パラシオス A., リード-スミス R. J., シュテンプフリ H.. Clostridium difficileは、ひき肉調理に推奨される最小限の温度で生存する。Anaerobe . 2010;16(5):540-542. doi: 10.1016/j.anaerobe.2010.05.004. - DOI - PubMed
ジンバブエの農村地域における環境中のClostridium difficileの有病率。熱帯医学と衛生学の王立協会のトランザクション。2006;100(12):1146-1150. doi: 10.1016/j.trstmh.2006.01.009. - DOI - PubMed
Lemee L., Dhalluin A., Testelin S., et al. Clostridium difficileの毒素原性培養におけるtpi（トリオースリン酸イソメラーゼ）、tcdA（トキシンA）、tcdB（トキシンB）遺伝子を標的としたマルチプレックスPCR. ジャーナル・オブ・クリニカル・マイクロバイオロジー（Journal of Clinical Microbiology） . 2004;42(12):5710–5714. doi: 10.1128/JCM.42.12.5710-5714.2004. - DOI - PMC - PubMed
Bidet P., Barbut F., Lalande V., Burghoffer B., Petit J. C. リボソームRNA遺伝子配列決定に基づくClostridium difficileの新しいPCR-リボタイピング法の開発. FEMS Microbiol Letter . 1999;175(2):261-266. doi: 10.1111/j.1574-6968.1999.tb13629.x. - DOI - PubMed
Weinstein M. P., Lweis J. S., 2nd The clinical and laboratory standards institute subcommittee on antimicrobial susceptibility testing: background, organization, functions, and processes. ジャーナル・オブ・クリニカル・マイクロバイオロジー. 2020;58(3, article e01864) doi: 10.1128/JCM.01864-19. - DOI - PMC - PubMed
小売用鶏肉におけるClostridium difficileの検出と特徴づけ．レターズ・イン・アプライド・マイクロバイオロジー（Letters in Applied Microbiology） . 2010;50(4):362-365. doi: 10.1111/j.1472-765X.2010.02802.x. - DOI - PubMed
Shaughnessy M., Snider T., Sepulveda R., et al. ミネソタ州の小売肉、食品生産動物、コンパニオン動物、およびヒトにおけるClostridium difficileの有病率と分子特性。ジャーナル・オブ・フード・プロテクション. 2018;81(10):1635-1642. doi: 10.4315/0362-028X.JFP-18-104. - DOI - PubMed
トルコの牛肉および鶏肉製品から分離されたClostridium difficileの有病率.Ersöz S., Coşansu S. コリアン ジャーナル フォー フード サイエンス オブ アニマル リソース . 2018;38(4):759-767. doi: 10.5851/kosfa.2018.e14. - DOI - PMC - PubMed
Zamani A., Razmyar J., Berger F. K., Kalidari G. A., Jamshidi A. Isolation and toxin gene detection of clostridium (Clostridioides) difficile from traditional and commercial quail farms and packed quail meat for market supply - short communication. Acta Veterinaria Hungarica . 2019;67(4):499-504. doi: 10.1556/004.2019.049. - DOI - PubMed
Rahimi E., Jalali M., Weese J. S. イランの牛、牛、羊、山羊、ラクダ、水牛の生肉におけるClostridium difficileの有病率. BMCパブリックヘルス. 2014;14(1):1-4. doi: 10.1186/1471-2458-14-119. - DOI - PMC - PubMed
Crobach M. J. T., Vernon J. J., Loo V. G., et al. クロストリジウム・ディフィシルのコロニー形成の理解. クリニカル・マイクロバイオロジー・レビューズ. 2018;31(2, article e00021) doi: 10.1128/CMR.00021-17. - DOI - PMC - PubMed
Zidaric V., Zemljic M., Janezic S., Kocuvan A., Rupnik M. 交換用産卵鶏を生産する単一の養鶏場から分離されたClostridium difficile遺伝子型の高い多様性。Anaerobe . 2008;14(6):325-327. doi: 10.1016/j.anaerobe.2008.10.001. - DOI - PubMed
Hussain I., Borah P., Sharma R. K., et al. インド北東部のヒトおよび動物から分離されたClostridium difficileの分子的特性. モレキュラー・アンド・セルラー・プローブス. 2016;30(5):306-311. doi: 10.1016/j.mcp.2016.08.010. - DOI - PubMed
ソンガー J. G., アンダーソン M. A. クロストリジウム・ディフィシル：食用動物の重要な病原体. Anaerobe . 2006;12(1):1-4. doi: 10.1016/j.anaerobe.2005.09.001. - DOI - PubMed
ハーベイ・R・B、ノーマン・K・N、アンドリュース・K、他 テキサス州の小売肉および加工工場におけるクロストリジウム・ディフィシル。ジャーナル・オブ・ベテリナリーダイアグノスティック・インベスティゲーション（Journal of Veterinary Diagnostic Investigation）．2011;23(4):807-811. doi: 10.1177/1040638711407893. - DOI - PubMed
Von Abercron S. M., Karlsson F., Wigh G. T., Wierup M., Krovacek K. スウェーデンの小売ひき肉におけるClostridium difficileの低い発生率。ジャーナル・オブ・フード・プロテクション. 2009;72(8):1732-1734. doi: 10.4315/0362-028X-72.8.1732. - DOI - PubMed
Guran H. S., Ilhak O. I. トルコ東部地域の小売用鶏肉部位およびレバーにおけるクロストリジウム・ディフィシル。Journal für Verbraucherschutz und Lebensmittelsicherheit .2015;10(4):359-364. doi: 10.1007/s00003-015-0950-z. - DOI
Dupuy B., Govind R., Antunes A., Matamouros S. Clostridium difficile toxin synthesis is negatively regulated by TcdC. ジャーナル オブ メディカル マイクロバイオロジー. 2008;57(6):685-689. doi: 10.1099/jmm.0.47775-0. - DOI - PubMed
インドラA.、ラスニッヒH.、バリコN.、他 クロストリジウム・ディフィシル：新しい人獣共通感染症病原体。Wiener Klinische Wochenschrift . 2009;121(3-4):91-95. doi: 10.1007/s00508-008-1127-x. - DOI - PubMed
カリー S. R. クロストリジウム・ディフィシル. クリニックス・イン・ラボラトリーメディシン. 2012;30(1):329-342. - PMC - PubMed
イランの病院におけるクロストリジウム・ディフィシル感染症の分子疫学（Parisa S., Hasan S., Farzin K., et al. 抗菌薬耐性と感染制御. 2019;8(12):1-7. doi: 10.1186/s13756-018-0454-6. - DOI - PMC - PubMed
イスラエルにおけるClostridium difficileの分子疫学に関する全国調査：バンコマイシンおよびメトロニダゾールに対する感受性を低下させたリボタイプ027株の普及．診断微生物学と感染症. 2015;83(1):21-24. doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2015.05.015. - DOI - PubMed
Abu Faddan N. H., Aly S. A., Abou Faddan H. H. NosocomialClostridium difficile-associated diarrhoea in Assiut University Children's Hospital, Egypt. Paediatrics and International Child Health . 2016;36(1):39-44. doi: 10.1179/2046905514Y.0000000167. - DOI - PubMed
Sholeh M., Krutova M., Forouzesh M., et al. ヒト由来のクロストリジオイデス（Clostridium）ディフィシルにおける抗菌薬耐性：系統的レビューとメタアナリシス（A systematic review and meta-analysis. 抗菌薬耐性と感染制御. 2020;9(1):1-11. doi: 10.1186/s13756-020-00815-5. - DOI - PMC - PubMed
Saha S., Kapoor S., Tariq R., et al. Clostridioides difficileにおける抗生物質耐性の増加：システムレビューとメタアナリシス. Anaerobe . 2019;58:35-46. doi: 10.1016/j.anaerobe.2019.102072. - DOI - PubMed
Heidari H., Ebrahim-Saraie H. S., Amanati A., Motamedifar M., Hadi N., Bazargani A. クロストリジウム・ディフィシルの毒素原性臨床分離株における毒素プロファイルと抗菌薬耐性パターン。イラン・ジャーナル・オブ・ベーシック・メディカル・サイエンス. 2020;22(7):813-819. doi: 10.22038/ijbms.2019.35223.8390. - DOI - PMC - PubMed
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