クローン病：特定の腸内細菌に関連した症状の重さ
クローン病：特定の腸内細菌に関連した症状の重さ
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3つの微生物プロファイル
クローン病における微生物叢と症状の重篤度
疾患進化を予測する微生物シグネチャー
結論
技術の現状
クローン病は、腸内細菌叢のバランスが崩れ、全体的に細菌叢の多様性が失われることが特徴であるとされています。また、この疾患の患者さんは様々な症状を呈し、寛解期の後に頻繁に再発を繰り返します。しかし、患者さんによって異なる症状や疾患の進展が、腸内細菌叢とどのように関連しているかは、まだ明らかになっていません。
この研究がもたらすもの
研究者らは、クローン病患者の腸内細菌叢の不均一性を調べ、G1、G2、G3と呼ばれる3つの異なるプロファイルを同定しました。経時的に採取した糞便サンプルを分析した結果、異なる微生物叢プロファイルが症状の重篤度と関連していることが観察されました。最終的に、さまざまな症状の「微生物サイン」が特定され、短鎖脂肪酸（SCFA）産生菌の減少と炎症性細菌の増加という、増悪の主な兆候が確認されたのです。
結論
この結果は、クローン病患者における腸内細菌叢の異常と症状の重症度との関連を示しており、この疾患のより良い評価と管理のために腸内細菌叢の組成を分析する必要性を示唆しています。
クローン病は、腸内細菌の異常によって特徴づけられる慢性炎症性疾患で、腸の合併症を引き起こす可能性があります。
Sylvie Buffet-Bataillonが共同で行った最近の研究では、この疾患の患者さんにおいて、症状の悪化と腸内細菌叢の進行性変化との間に関連性があることが示されました。
この研究は、Scientific Reports誌に掲載されたもので、ディスバイオーシスを評価することで、治療法の最適化につながる可能性があることを示唆しています。
3つの微生物プロファイル
クローン病患者における微生物叢の不均一性を明らかにするため、レンヌ大学の研究者らは、259人の患者から採取した糞便サンプルのゲノム配列決定を行いました。
得られた結果をもとに、研究者は3つの異なる微生物相プロファイル、すなわちG1（ノルマルビオース）、G2、G3（ディスバイオーシス）を特定しました。特に、G1からG3への移行時に種の多様性が徐々に減少し、プロテオバクテリアの割合が変化することが観察された。
他の研究で報告されているように、ディスバイオーシスは、ファーミキューテス門のSCFA産生菌の減少とプロテオバクテリアの増加によって特徴づけられた。
一方、疾患活動性の評価に用いられる標準的な非侵襲性マーカーである糞便性カルプロテクチン（FC）値には変化が見られませんでした。
クローン病における微生物叢と症状の重篤度
その後、41名の患者さんのサブグループから採取した糞便サンプルを分析したところ、微生物叢の構成と症状の間に関連性があることがわかりました。
G1は寛解、G2は寛解と「軽度から中等度」の症状、G3は重度の症状と関連しており、症状の重症度はG1からG3へと上昇することがわかったのです。また、経時的に採取した糞便サンプルを分析した結果、症状の改善は、安定した微生物叢、G3からG2への移行、G2からG1への移行のいずれかと関連していることがわかりました。
したがって、このような異なる微生物相の間の移行は、経時的な疾患進化の重要な指標となる可能性がある。
疾患進化を予測する微生物シグネチャー
その後、G1、G2、G3プロファイルの違いを調べたところ、最初の悪化の兆候（G1からG2への移行）は、腸内の主要な免疫細胞の抗炎症反応を促進することが知られているSCFA産生菌のローズブリア、ユーバクテリウム、サブドリジャーナム、ルミノコックスが失われたことによることが判明しました。
また、炎症性病原体であるProteusとFinegoldia、およびSCFAをあまり生成しない細菌（Ezakiella、Anaerococcus、Megasphaera、Anaeroglobus、Fenollaria）の増加が観察された。
臨床症状のさらなる悪化（G2〜G3）は、SCFAをあまり産生しない細菌の重要な損失と、Klebsiella、Pseudomonas、Salmonella、Acinetobacter、Hafniaといった他の炎症性細菌、Staphylococcus、Enterococcus、Streptococcusといった堅果門に属する炎症性属の増加に関連していた。
結論
治療によってディスバイオシスの進行を逆転させたり、食い止められるかどうかは不明ですが、本研究は、SCFA産生がクローン病患者の腸内恒常性の回復と寛解の延長に関連することを示唆しています。したがって、SCFA産生菌に基づく治療法は、疾患の寛解の誘発・維持や手術後の再発防止に有用であると考えられます。
「最後に、得られた微生物叢の変化に関するデータは、クローン病患者の寛解維持に有効であることが既に示されている、カスタマイズされた糞便微生物叢移植（FMT）に有用な情報を提供する可能性があります」と研究者は結論付けています。
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