糞便微生物叢移植材料の嫌気的調製とバンク化のためのプロトコルの開発： 培養画分中の細菌の豊富さの評価

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糞便微生物叢移植材料の嫌気的調製とバンク化のためのプロトコルの開発： 培養画分中の細菌の豊富さの評価

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38138045/

Berta Bosch et al. 2023.
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引用

要旨
糞便微生物叢移植（FMT）は、再発性Clostridioides difficile感染症以外の適応において、非常に多様な結果を示している。多くの疾患における微生物叢異常は、厳密に嫌気性菌の枯渇によって特徴づけられるが、これはFMTの有効性にとって極めて重要であると考えられる。われわれは、材料採取から投与に至るまで、移植の準備とバンクの全過程において嫌気状態を確保するためのプロトコルを開発した。このプロトコールには嫌気キャビネット、すなわち非標準的な実験装置が必要である。培養と16S rRNA遺伝子プロファイリングを組み合わせて、移植準備中の生存嫌気性菌の集団を分析したところ、-80℃で4、8、12ヵ月間嫌気的または好気的に保存した後、培養によって78％の糞便種が捕捉された。この結果は、厳密に嫌気的な移植準備と保存が、酸化的条件よりも種の豊富さを保つ可能性を示唆しているが、全体的な差は有意ではなかった。しかし、NeglectaやAnaerotruncusのような特定の嫌気性菌は、酸素暴露の影響を受けた。12ヶ月までの保存期間は、培養分類群の存在に影響を与えなかった。注目すべきは、培養嫌気性菌の豊富さではなく、培養嫌気性菌の豊富さに焦点を当てたことである。特定の適応症に対するFMTにおいて、開発された嫌気性プロトコールの利点は、臨床試験で実証される必要がある。

キーワード クロストリジウム・ディフィシル（Clostridium difficile）；嫌気性条件；ディスバイオーシス；糞便微生物叢移植（FMT）；炎症性腸疾患；短鎖脂肪酸（SCFA

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