好中球プロファイリングが明らかにする抗腫瘍抗原提示能

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論文|187巻6号1422-1439.e24頁2024年3月14日号

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好中球プロファイリングが明らかにする抗腫瘍抗原提示能

https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(24)00126-0

呉英誠 8
馬嘉強 8
楊学鵬 8
ジア・ファン
張暁明
チアン・ガオ 9
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脚注を表示する発行:2024年03月05日DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.02.005
PlumXメトリクス

ハイライト

好中球はがんによって10の状態をとり、組織と表現型の可塑性を示す

好中球の成熟状態は炎症、血管新生、抗原提示にまたがる

抗原提示プログラムはロイシンによって誘発され、T細胞の新抗原応答を促進する。

抗原提示好中球の供給は免疫療法を促進し、TMEを微調整する
まとめ
好中球は、病原体に対する最も豊富で効率的な防御因子であるが、がん種を問わず相反する機能を発揮する。しかし、好中球の半減期が短いことから、がんにおいて好中球がどのように特異的な運命をたどるかを探ることは依然として困難である。ここでわれわれは、17のがん種（143人の患者から225サンプル）から単細胞好中球トランスクリプトームを作成し、統合した。好中球は、炎症、血管新生、抗原提示を含む10の異なる状態からなり、並外れた複雑性を示した。特に抗原提示プログラムは、ほとんどの癌において良好な生存と関連しており、ロイシン代謝とそれに続くヒストンH3K27ac修飾によって誘発される可能性があった。これらの好中球はさらに、（新）抗原特異的および抗原非依存的なT細胞応答を引き起こす可能性がある。好中球投与あるいはロイシン食は、様々なマウス癌モデルにおいて抗PD-1療法を増強する免疫バランスを微調整した。まとめると、これらのデータは、がん間で好中球が分岐していることを示すだけでなく、抗原提示好中球投与などの治療の可能性も示唆している。
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JCI Insight. 2018; 3e122467
論文で見る
スコープス (22)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ギド T.N.
クエックC.
メンジースA.M.
タスカー A.T.
シャン P.
ホルスト J.
マドール J.
リム S.Y.
ヴェリコヴィッチ R.
ウォンチェンコ M.
他
抗PD-1単剤療法と抗PD-1/抗CTLA-4併用療法に対する反応を規定する免疫細胞集団の違い。
Cancer Cell. 2019; 35: 238-255.e6
論文で見る
スコープス（454）
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ヒューゴ W.
ザレツキーJ.M.
サン L.
ソン C.
モレノ B.H.
Hu-Lieskovan S.
ベレント・マオズ B.
パン J.
Chmielowski B.
チェリーG.
et al.
転移性黒色腫における抗PD-1療法に対する反応のゲノムおよびトランスクリプトミクスの特徴。
Cell. 2016; 165: 35-44
論文で見る
スコープス (2018)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
マリアタサン S.
ターリー S.J.
ニクルスD.
カスティリオーニ A.
ユエン K.
ワン Y．
カデル3世 E.E.
ケッペン H．
アスタリタ J.L.
Cubas R.
他
TGFβは、T細胞の排除に寄与することにより、PD-L1遮断に対する腫瘍反応を減弱させる。
Nature. 2018; 554: 544-548
論文で見る
スコープス (2877)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
プラット A．
ナバロ A.
パレL.
レグアートN.
ガルバンP.
パスクアル T.
マルティネス A.
ヌシフォロ P.
コメルマ L.
アロスL.
他
非小細胞肺がん、頭頸部扁平上皮がん、および黒色腫におけるPD-1遮断後の免疫関連遺伝子発現プロファイリング。
Cancer Res. 2017; 77: 3540-3550
論文で見る
スコープス (282)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ナタンソンT.
アフジャ A.
ルビンシュタインA.
アクソイB.A.
ヘルマン M.D.
ミャオ D．
ヴァン・アレン E.
メルグーブ T.
ウォルチョク J.D.
スナイダー A.
他。
CTLA-4遮断療法を受けたメラノーマにおける体細胞変異とネオエピトープ相同性。
Cancer Immunol. Res. 2017; 5: 84-91
論文で見る
スコープス (111)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ラウス M.
ドニア M.
ハルブストK.
アンデルセン R.
ミトラ S.
ローゼングレン F．
サリム M.
ヴァロン・クリステルソン J.
トルングレン T.
Kvist A.
他
メラノーマにおける突然変異および推定新抗原負荷は、養子T細胞療法の臨床的有用性を予測する。
Nat. Commun. 2017; 8: 1738
論文で見る
スコープス（265）
PubMed
クロス
グーグル奨学生
キム S.T.
クリステスクR.
バス A.J.
キム K.M.
オデガードJ.I.
キム K．
リュー X.Q.
シャー X.
Jung H．
リー M.
他。
転移性胃癌におけるPD-1阻害に対する臨床効果の包括的分子学的特徴づけ。
Nat. Med. 2018; 24: 1449-1458
論文で見る
スコープス (963)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
朱 A.X.
アッバス A.R.
デ・ガラレータM.R.
Guan Y.
Lu S.
Koeppen H.
Zhang W.
Hsu C.H.
He A.R.
Ryoo B.Y.
他
進行肝細胞癌におけるアテゾリズマブとベバシズマブの併用療法に対する臨床効果と抵抗性の分子相関。
Nat. Med. 2022; 28: 1599-1611
論文で見る
スコープス (136)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Voabil P.
デ・ブルインM.
ローロフセンL.M.
ヘンドリクス S.H.
ブロカンプ S.
ファンデンブラバーM.
ブロークス A.
サンダース J.
ヘルツィヒ P.
ジッペリウスA.
et al.
癌におけるPD-1遮断に対する反応を解析するためのex vivo腫瘍断片プラットフォーム。
Nat. Med. 2021; 27: 1250-1261
論文で見る
スコープス (133)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
リウ Z.
Zhang Z.
ヒト組織全体の細胞タイプのマッピング。
Science. 2022; 376: 695-696
論文で見る
スコープス(15)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
チェン S.
Li Z.
Gao R.
Xing B.
Gao Y.
Yang Y.
秦 S.
Zhang L.
Ouyang H.
Du P.
et al.
腫瘍浸潤骨髄系細胞の汎癌単一細胞転写アトラス。
Cell. 2021; 184: 792-809.e23
論文で見る
抄録集(409)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
鄭 L.
秦 S.
Si W.
Wang A.
Xing B.
Gao R.
Ren X.
Wang L.
Wu X.
Zhang J.
et al.
腫瘍浸潤T細胞の汎癌シングルセルランドスケープ。
Science. 2021; 374: abe6474
論文で見る
スコープス(312)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
バレステロス I.
ルビオ-ポンセA.
ジェヌア M.
ルシト E.
クオック I.
フェルナンデス-カルボG.
コイラッティ T.E.
ファン・グリンスベン E.
ゴンサレス-ヘルナンデスS.
ニコラス-アビラJ.Á.
他。
組織環境による好中球運命の共選択。
Cell. 2020; 183: 1282-1297.e18
論文で見る
スコパス(201)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
チェン D.S.
メルマンI.
腫瘍学と免疫学の出会い：癌と免疫のサイクル。
Immunity. 2013; 39: 1-10
論文で見る
スコープス (4377)
パブコメ
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
バンドラ-サイモンJ.
ロッシュ P.A.
癌における樹状細胞による抗原プロセシングと提示の機能不全。
Mol. Immunol. 2019; 113: 31-37
論文で見る
スコープス (56)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
シンガル S．
ボージナガルワラP.S.
オブライエンS.
ムーン E.K.
ガーフォール A.L.
ラオ A.S.
クアトロモーニ J.G.
スティーブン T.L.
リッツキー L.
デシュパンデ C．
et al.
早期ヒト肺癌における抗原提示細胞の特徴を持つ腫瘍関連好中球のサブセットの起源と役割。
Cancer Cell. 2016; 30: 120-135
https://doi.org/10.1016/j.ccell.2016.06.001
論文で見る
スコープス (273)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
マイソールV.
カッレX.
ミアーズ J.
ロゼッティ F.
大久保一男
リュー P.X.
チャン F．
マデラサルセド I.
ローゼンバウアー F.
ストーン・R.M.
他
FcγRが好中球を抗原提示細胞へと再プログラムし、獲得抗腫瘍免疫を惹起する。
Nat. Commun. 2021; 12: 4791
論文で見る
スコープス (41)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
Hu Z.
Zhao T.V.
Huang T.
Huang T.
ジン K.
Goronzy I.N.
ウー B.
アブデル M.P.
ベッテンコートJ.W.
ベリーG.J.
他
転写因子RFX5は、滑膜マクロファージにおける抗原提示機能と栄養ストレスに対する抵抗性を調整している。
Nat. Metab. 2022; 4: 759-774
論文で見る
スコパス (34)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
リウ・P.S.
チェン Y.T.
Li X.
Hsueh P.C.
Tzeng S.F.
チェン・エイチ
Shi P.Z.
Xie X.
パリク S.
プランク M.
他。
CD40シグナルが脂肪酸とグルタミンの代謝を再配線し、マクロファージの抗腫瘍機能を刺激する。
Nat. Immunol. 2023; 24: 452-462
論文で見る
スコパス (13)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Qian J.
オルブレヒト S.
Boeckx B.
Vos H.
ラウイ D.
エトリオグル E.
ワータース E.
ポメラ V.
フェルバンド S.
ブシャールP.
et al.
単一細胞プロファイリングによって明らかになった不均一な腫瘍微小環境の汎癌青写真。
細胞研究 2020; 30: 745-762
https://doi.org/10.1038/s41422-020-0355-0
論文で見る
スコープス (282)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
チャン J.M.
キンタナル-ビジャロンガ
ガオ V.R.
Xie Y.
アラジ V.
チャウダリー O.
マシリオニス I.
エッガー J.
チャウ A.
ウォレT.
他。
ヒト小細胞肺癌のアトラスにおける可塑性、転移、免疫抑制の徴候。
Cancer Cell. 2021; 39: 1479-1496.e18
https://doi.org/10.1016/j.ccell.2021.09.008
論文で見る
スコープス (120)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ヤン L.
He Y.-T.
Dong S.
ウェイ X.-W.
Chen Z.-H.
Zhang B.
チェン W.-D.
ヤン X.-R.
Wang F.
Shang X.-M.
et al.
単一細胞トランスクリプトーム解析により、EGFR変異型肺腺癌における抑制性腫瘍免疫微小環境が明らかになった。
J. Immunother. Cancer. 2022; 10: e003534
https://doi.org/10.1136/jitc-2021-003534
論文で見る
スコープス (53)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Hu S.
Lu H.
Xie W.
Wang D.
Shan Z.
Xing X.
Wang X.-M.
Fang J.
Dong W.
Dai W.
et al.
TDO2+筋線維芽細胞は扁平上皮癌の悪性化において免疫抑制を媒介する。
J. Clin. Invest. 2022; 132: e157649
https://doi.org/10.1172/JCI157649
論文で見る
スコープス (18)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ジョーンズ R.C.
カルカニアスJ.
クラズナウ M.A.
ピスコ A.O.
クエイク S.R.
サルツマン J．
ヨセフ N．
ブルタップB.
ブラウン P．
他
タブラ・サピエンス・コンソーシアム
タブラ・サピエンス：ヒトの複数臓器、単一細胞のトランスクリプトーム・アトラス。
Science. 2022; 376: eabl4896
https://doi.org/10.1126/science.abl4896
論文で見る
スコープス (254)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
バトラーA.
ホフマンP.
スミベルトP.
パパレキシ E.
Satija R.
異なる条件、技術、種にまたがるシングルセル・トランスクリプトームデータの統合。
Nat. Biotechnol. 2018; 36: 411-420
論文で見る
スコープス (5514)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
コルサンスキーI.
ミラードN.
ファンJ.
スロウィコフスキー K.
チャン・F.
ウェイ K.
バグレンコ Y.
ブレナー M.
ロー P.R.
Raychaudhuri S.
Harmonyによるシングルセルデータの高速、高感度、高精度な統合。
Nat. Methods. 2019; 16: 1289-1296
論文で見る
スコープス (2077)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
キンカーG.S.
グリーンワルドA.C.
タル R.
オルロバZ.
クオコ M.S.
マクファーランド J.M.
ウォーレン A．
ロッドマン C．
ロス J.A.
ベンダー S.A.
他。
汎癌単一細胞RNA-seqは、細胞異質性の反復プログラムを同定する。
Nat. Genet. 2020; 52: 1208-1218
論文で見る
スコープス(155)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ハーフェマイスターC.
サティヤR.
正則化負の二項回帰を用いた単一細胞RNA-seqデータの正規化と分散の安定化。
Genome Biol.
論文で見る
スコープス (1491)
PubMed
Crossref
グーグル奨学生
アンドレッタ M．
カルモナ S.J.
UCell：ロバストでスケーラブルなシングルセル遺伝子シグネチャースコアリング。
Comput. Struct. Biotechnol. J. 2021; 19: 3796-3798
論文で見る
スコープス (114)
パブコメ
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
金久正明
古道正明
田辺真一
佐藤康晴
森島和彦
KEGG：ゲノム、パスウェイ、疾患、薬剤に関する新たな視点。
Nucleic Acids Res. 2017; 45: D353-D361
論文で見る
スコープス (5187)
PubMed
クロスリファレンス
グーグル奨学生
リベルゾン A.
ビルガー C.
トルヴァルズドッティル H.
ガンディ M.
メシロフJ.P.
Tamayo P.
遺伝子発現データベース
Cell Syst. 2015; 1: 417-425
論文で見る
スコープス (5464)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
アッシュバーナー M.
ボールC.A.
ブレイク J.A.
ボトスタイン D.
バトラーH.
チェリー J.M.
デイビス A.P.
ドリンスキー K．
ドワイト S.S.
エッピッグJ.T.
et al.
遺伝子オントロジー：生物学統一のためのツール。遺伝子オントロジー・コンソーシアム。
Nat. Genet. 2000; 25: 25-29
論文で見る
スコープス (29493)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
リンダマン G.C.
趙J.
ルーリスM.
ビーレッキ P.
フラベル R.A.
ナドラーB.
Kluger Y.
シングルセルRNA-seqデータのゼロ保存インピュテーション。
Nat. Commun. 2022; 13: 192
論文で見る
スコープス(61)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
エフレモヴァ M.
ヴェント-トルモM.
タイヒマン S.A.
ヴェント-トルモ R.
CellPhoneDB：マルチサブユニット・リガンド・レセプター複合体の複合発現から細胞間コミュニケーションを推測する。
Nat. Protoc. 2020; 15: 1484-1506
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ゴールドマン M.J.
クラフトB.
ハスティ M.
レペチカ K.
マクデイドF.
カマス A.
バネルジー A.
ルオ Y.
ロジャース D．
ブルックスA.N.
et al.
Xenaプラットフォームによる癌ゲノムデータの可視化と解釈。
Nat. Biotechnol. 2020; 38: 675-678
論文で見る
スコープス (1682)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
チェン B．
コダドゥスト M.S.
リュー C.L.
ニューマン A.M.
アリザデ A.A.
CIBERSORTによる腫瘍浸潤免疫細胞のプロファイリング。
Methods Mol. Biol. 2018; 1711: 243-259
論文で見る
スコープス (1619)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
吉原和彦
シャモラドゴリ M.
マルティネス E.
ベジェスナ R.
キム・エイチ
トーレス＝ガルシア W.
トレビーニョ V.
シェン H．
レアード P.W.
レバインD.A.
他。
発現データから腫瘍の純度、間質細胞と免疫細胞の混在を推測する。
Nat. Commun. 2013; 4: 2612
論文で見る
スコープス (4806)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
チャロエントンP.
フィノテロF.
アンゲロバ M.
メイヤー C.
エフレモワ M.
リーダー D.
ハックル H.
Trajanoski Z.
汎癌イムノゲノム解析により、遺伝子型-免疫表現型の関係とチェックポイント遮断に対する反応性の予測因子が明らかになった。
Cell Rep.
論文で見る
スコープス (2454)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
Li B.
セバーソン E.
ピニョン J.C.
Zhao H.
Li T.
Novak J.
Jiang P.
シェン H.
アスター J.C.
ロディグ S．
他。
腫瘍免疫の包括的解析：がん免疫療法への示唆。
ゲノム生物学 2016; 17: 174
論文で見る
スコープス (1416)
PubMed
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ラクルJ.
デ・ヨンジK.
バウムガートナーP.
シュパイザー D.E.
グフェラー D.
バルク腫瘍遺伝子発現データから、癌細胞と免疫細胞のタイプを同時に列挙した。
eLife. 2017; 6
論文で見る
スコープス (643)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
リーB.T.
バーバーG.P.
ベネ・パジェスA.
キャスパーJ.
クローソン H.
ディーカンス M.
フィッシャー C.
ゴンザレス J.N.
ヒンリクス A.S.
リーC.M.
他。
UCSCゲノムブラウザデータベース：2022年更新。
Nucleic Acids Res. 2022; 50: D1115-D1122
論文で見る
スコープス (122)
PubMed
クロスリファレンス
グーグル奨学生
Lin J.
Dai Y.
Sang C.
Song G.
Xiang B.
Zhang M.
Dong L.
Xia X.
Ma J.
Shen X.
他。
肝内胆管癌における免疫サブグループのマルチモジュール解析により、治療上の脆弱性が明らかになった。
J. Immunother. Cancer. 2022; 10
論文で見る
スコープス (16)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
Song G.
Shi Y.
Meng L.
Ma J.
Huang S.
Zhang J.
ウー Y.
Li J.
Lin Y.
Yang S.
et al.
単一細胞トランスクリプトーム解析は、肝内胆管癌の2つの分子的サブタイプを示唆している。
Nat. Commun. 2022; 13: 1642
論文で見る
スコープス (33)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
丁 G.Y.
Ma J.Q.
Yun J.P.
Chen X.
Ling Y.
Zhang S.
Shi J.Y.
Chang Y.Q.
Ji Y.
Wang X.Y.
et al.
肝内胆管癌における三次リンパ球構造の分布と密度は臨床転帰を予測する。
J. Hepatol. 2022; 76: 608-618
論文で見る
スコープス (52)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
Ye Y.
Chen Z.
Jiang S.
Jia F.
Li T.
Lu X.
Xue J.
Lian X.
Ma J.
Hao P.
et al.
単一細胞プロファイリングにより、MDA5+皮膚筋炎における明確な適応免疫の特徴が明らかになり、治療的意義が示唆された。
Nat. Commun. 2022; 13: 6458
論文で見る
スコパス (17)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
シェン X.
Wang C.
Liang N.
Liu Z.
Li X.
Zhu Z.J.
メリマン T.R.
ダルベス N．
Terkeltaub R．
リー C．
et al.
Serum Metabolomics Identifies Dysregulated Pathway and Potential Metabolic Biomarkers for Hyperuricemia and Gout.
Arthritis Rheumatol. 2021; 73: 1738-1748
論文で見る
日本人の高尿酸血症
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
Wang Z.
Lu Z.
Lin S.
Xia J.
Zhong Z.
Xie Z.
Xing Y.
Qie J.
Jiao M.
Li Y.
et al.
ロイシンtRNAシンターゼ-2発現B細胞は大腸癌の免疫逃避に寄与する。
Immunity. 2022; 55: 1748
論文で見る
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
Zhang M.
Huang Y.
パン J.
Sang C.
Lin Y.
Dong L.
Shen X.
Wu Y.
Song G.
Ji S.
et al.
IL1RNのスプライシングによって生じる炎症性チェックポイントが、KRAS変異肝内胆管癌の治療機会を提供する。
Cancer Discov. 2023; 13: 2248-2269
論文で見る
スコープス (1)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Wu Y.
Zhao J.
Zhu H.
ファン Z.
Yuan X.
Chen S.
Mao R.
Fan Y.
SPACE：汎癌解析において、クロマチンアクセシビリティと臨床表現型および免疫微小環境をリンクするためのウェブサーバー。
Cell. Mol. Immunol. 2020; 17: 1294-1296
論文で見る
スコープス (2)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ウー Y.
ヤン Y.
Gu H.
Tao B.
Zhang E.
Wei J.
Wang Z.
Liu A.
Sun R.
Chen M.
et al.
マルチオミクス解析により、エンハンサーの機能的転写と潜在的翻訳が明らかになった。
Int. J. Cancer. 2020; 147: 2210-2224
論文で見る
スコープス (3)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
論文情報
出版履歴
出版 2024年3月5日
受理 受理：2024年2月5日
改訂版受理 2023年9月20日
受理：2023年9月20日 受理日：2023年4月11日
識別
DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.02.005

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