ヒト腸内における微生物相互作用の疾患特異的な消失

ディスバイオーシスにおける微生物間の相互作用はどのようなものなのでしょうか？大規模なメタゲノム全体の代謝モデリング研究を行い、疾患によって大きく異なることを明らかにしました。
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ヒト腸内における微生物相互給餌の疾患特異的な消失
View ORCID ProfileVanessa Rossetto Marcelino, Caitlin Welsh, Christian Diener, View ORCID ProfileEmily L. Gulliver, Emily L. Rutten, Remy B. Young, Edward M. Giles, View ORCID ProfileSean M. Gibbons, Chris Greening, View ORCID ProfileSamuel C. Forster
doi: https://doi.org/10.1101/2023.02.17.528570
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要約
ヒトの健康に不可欠な多くの腸内細菌は、生存のために互いの生産する栄養素に依存している。しかし、このような相互摂食の相互作用は定量化が困難で、その特性は十分に明らかにされていない。本論文では、このような相互作用を定量化するためのMetabolite Exchange Score (MES)を紹介する。1600人以上のメタゲノム全体の代謝モデルを用いて、MESは11疾患中10疾患においてクロスフィードパートナーの喪失によって著しく影響を受ける代謝的相互作用を特定し、ランク付けすることを可能にした。クローン病の症例対照研究に適用したところ、硫化水素を消費する能力を持つ種の欠如が、疾患のマイクロバイオームの主な特徴であると同定されました。また、微生物間相互作用の回復を目標とすることは、健康な腸内生態系を再構築するためのメカニズムに基づいた有望な戦略であることを提案する。

利害関係者声明
S.C.F.は、特許の発明者であり、BiomeBankおよびMicrobioticaの顧問を務めている。R.B.YはBiomeBankのアドバイザーを務めている。他のすべての著者は、競合する利害関係を宣言する必要はない。